Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Penyakit dengue masih merupakan masalah kesehatan penting di sebagian besar Negara tropis dan subtropis. Dalam dua dekade terakhir terjadi lonjakan drastis baik jumlah kasus maupun daerah endemik di samping peningkatan keparahan penyakit (DHF/DSS). Meski telah dipelajari secara intensif, belum dipahami benar bagaimana mekanisme infeksi dengue berkembang menjadi DHF/DSS. Sejauh ini diketahui baik faktor inang maupun virulensi virus terlibat dalam menentukan keparahan penyakit. Studi-studi terbaru melaporkan perbedaan struktural genom di antara virus dengue yang memberikan manifestasi klinis berbeda. Perbedaan ini kemungkinan berhubungan dengan patogenesis penyakit. (Med J Indones 2004; 13: 190-4)

---

Dengue disease are reemerging disease and major health concern in tropical and subtropical regions because of the increasing number of patients, expanding endemic areas and increased occurrence of severe clinical manifestation (DHF/DSS) in the last two decades. Despite extensive studies, it is not fully elucidated mechanism by which dengue infection progress to DHF/DSS. Information obtained so far indicates that both host-related factor and virus virulence are involved. Recent studies have shown several structural differences of dengue virus genome between those associated with DF only and those with the potential to cause DHF. That genome differences might be correlated with pathogenesis. (Med J Indones 2004; 13: 190-4)"

"Helicobacter pylori is a globally significant pathogen that infects half of the population of the world. Its recognition enabled the development of new therapeutic and preventative strategies for serious health conditions such as gastric cancer, of which it is the major causative agent. Providing a broad overview of the current understanding of this pathogen and emphasizing its world health impacts, this book explores a range of topics including virulence factors, vaccine development and obstacles, epidemiology, antibiotic resistance and the role of Nod receptors, with a foreword by Barry Marshall, the Nobel Laureate and co-discoverer of H. pylori. It is an essential resource for researchers, students and medics in infectious and Helicobacter-associated diseases."

"Ruang lingkup dan Cara penelitian: Toxoplasma gondii adalah parasit yang menginfeksi burung dan mamalia termasuk manusia. Parasit ini dikembangkan untuk penelitian toksoplasmosis. Selama ini pengadaan takizoit di laboratorium FKUI dilakukan dengan cara inokulasi mencit setiap tiga hari. Penelitian ini ingin mengetahui metoda yang lebih praktis dan ekonomis untuk menyimpan takizoit T. gondii untuk menggantikan pengadaan takizoit cara lama. Telah diteliti dua jenis metoda penyimpanan takizoit dalam nitrogen cair, yaitu metoda Lin dan Booth. Sampel adalah takizoit T. gondii sebanyak 2,75x10 per tabung, terdiri dari 72 tabung. Terdapat perbedaan antara kedua metoda : Lin melakukan pencucian berulang dengan larutan NaCl 0,9%, media penyimpan hanya DMSO serta inkubasi sebelum masuk ke nitrogen cair adalah -20°C, -60°C, dilakukan pencairan langsung dalam water-bath. Booth melakukan pemanenan dengan larutan HESS, tanpa pemurnian, media penyimpanan: DMSO + BSA + DMEM, inkubasi: suhu kamar dan -70°C, serta mengalami 3 tahap mencairan dengan 3% FBS dalam DMEM. Parameter yang diamati: Jumlah takizoit mula-mula, persentase viabilitas dan virulensi parasit setelah 2, 4 dan 6 bulan penyimpanan. Hasil dan kesimpulan: Dengan metoda Lin diperoleh viabilitas : 61,38%, 39,50% dan 36,09% setelah 2, 4 dan fi bulan penyimpanan serta hilangnya virulensi. Pada metoda Booth viabilitas setelah 2, 4 dan 6 bulan penyimpanan: 68,49%, 61,68% dan 56,99% dan virulensi tetap baik. Hal ini karena metoda Booth memakai HBSS sebagai larutan pembilas, BSA dan DMEM sebagai medium, serta adanya pencairan kembali secara bertahap, sehingga membran tetap stabil dan terhindar dari "shock osmotik". Berdasarkan hasil ini dapat disimpulkan : nitrogen cair dapat digunakan untuk penyimpanan takizoit jangka panjang dan metoda Booth merupakan metoda penyimpanan yang cukup baik untuk masa penyimpanan 6 bulan."

"Latar Belakang: Kriptokokosis meningeal merupakan infeksi oportunistik yang muncul pada penderita terinfeksi HIV di Indonesia. Penyebab utama kriptokokosis adalah Cryptococcus neoformans. Laporan terkait karakteristik klinis, mikologis dan laboratorium klinis pada pasien AIDS dengan kriptokokosis meningeal belum ada di Indonesia. Tujuan: Mengetahui karakteristik klinis, mikologis dan laboratoris pasien AIDS dengan kriptokokosis meningeal di Jakarta. Metode: Penelitian deskripsi retrospektif dengan desain potong lintang ini dilakukan di RSCM dan RSKO untuk data klinisnya dan pemeriksaan laboratoriumnya dilakukan di laboratorium departemen Parasitologi FKUI dan Westerdijk Fungal Biodiversity Institute, Utrecht, the Netherlands. Hasil: Gejala klinis utama adalah sakit kepala. Pasien yang hidup lebih banyak dari yang meninggal di RS. Isolat Cryptococcus sp. seluruhnya memproduksi melanin, membentuk empat fenotipe koloni, memiliki dua jenis mating-type dan empat genotipe (AFLP1, AFLP1 A, AFLP2 dan AFLP3). Terdapat infeksi campur mating-type dan genotipe pada satu pasien. Hitung CD4 mayoritas rendah.Diskusi: Mating-type terbanyak adalah α- α karena lebih virulens. Genotipe yang ditemukan sesuai laporan di dunia. Infeksi campur mating-type dan genotipe diduga karena jamur yang menginfeksi memiliki mating-type dan genotipe yang berbeda.Kesimpulan: Sakit kepala merupakan gejala klinis terbanyak. Genotipe terbanyak adalah AFLP1. Terdapat infeksi campur mating-type dan genotipe pada satu pasien.

---

Background: Meningeal cryptococcosis is an opportunistic infection in HIV-infected patients. The main cause of cryptococcosis is Cryptococcus neoformans. Reports related to clinical, Mycological and laboratory characteristics in AIDS patients with meningeal cryptococcosis do not yet exist in Indonesia. Objective: To determine the clinical, Mycological and laboratory characteristics of AIDS patients with meningeal cryptococcosis in Jakarta. Methods: This retrospective description study with cross-sectional design was conducted at RSCM and RSKO for clinical data and laboratory tests were carried out in the laboratory of the department of Parasitology FKUI and Westerdijk Fungal Biodiversity Institute, Utrecht, the Netherlands. Results: The main symptom is headache. Patients live more than those who died in the hospital. All isolates of Cryptococcus sp. produce melanin, forming four colony phenotypes, having two types of mating-type and four genotypes (AFLP1, AFLP1 A, AFLP2 and AFLP3). There were a mixed mating-type and genotype infection in one patient.

Discussion: Most mating-types are α- α because they are more virulent. Genotype found is the same with reported in the world. The mixed mating-type and the genotype because suspected infecting fungi have different mating-types and genotypes.

Conclusion: Headache is the most symptom. Most genotypes are AFLP1. There was a mixed mating-type and genotype infection in one patient."

"The objective of this work was to study the virulence of 15 Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) isolates collected inthree provinces in Indonesia (North Sumatra, South Sumatra, and South Sulawesi) based on five Indonesian differentialrice genotypes and 10 near isogenic lines (NILs) that have been known to differ in their resistance to bacterial leafblight (BLB), in a greenhouse assessment. In addition, this study also aims to monitor the responses of 31 ricegenotypes (21 NILs, five differentials, five improved cultivars) to BLB disease in a field experiment. The 15 isolatesshowed different virulence patterns on the NILs?genotypes with a single resistance gene indicating the pathogendiversity. Eight different pathotypes were present, as demonstrated by a particular virulence pattern of each isolate onthe genotypes. Determination of Xoo pathotype revealed that Xoo pathotypes responded differently based on theirreaction to NILs and Indonesian differential genotypes. The field assessment demonstrated the incidence and severity ofBLB disease on rice genotypes ranging from 25% to 100% and 5.5% to 72.91%, respectively, while the mean diseaseindex ranged from 1.15% to 72.9%. The disease response varied among rice genotypes. IRBB50 (Xa4+xa5), IRBB51(Xa4+xa13), IRBB52 (Xa4+Xa21), IRBB53 (Xa4+Xa21), IRBB56 (Xa4+xa5+xa13), IRBB57 (Xa4+xa5+Xa21),IRBB59 (Xa4+xa13+Xa21), IRBB64 (Xa4+xa5+Xa7+Xa21), IRBB66 (Xa4+xa5+Xa7+xa13+Xa21), IRBB7(Xa7),Angke (Xa4+xa5) and Code (Xa4+Xa7) were revealed to be highly resistant to the BLB pathogen. These genotypeshave potential as genetic material for the pyramiding of several resistance genes for the development of rice resistanceto BLB disease in Indonesia.Penentuan Patotipe Xanthomonas oryzae pv oryzae Asal Populasi Indonesia Penyebab Penyakit Hawar DaunBakteri dan Reaksinya pada Padi Diferensial. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mempelajari virulensi 15 isolatXanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) yang dikumpulkan dari tiga provinsi di Indonesia (Sumatera Utara, SumateraSelatan, dan Sulawesi Selatan) berdasarkan reaksinya pada lima genotipe padi diferensial Indonesia dan 10 galur padiisogenik (NIL) yang telah diketahui perbedaan ketahanannya terhadap penyakit hawar daun bakteri (HDB) pada uji dirumah kaca. Selain itu, penelitian ini juga bertujuan untuk memantau tanggap 31 genotipe padi (21 NIL, lima diferensial,lima kultivar unggul) terhadap penyakit HDB pada pengujian di lapangan. Sebanyak 15 isolat menunjukkan pola virulensiyang berbeda pada genotipe NIL dengan gen ketahanan tunggal, yang menunjukkan adanya keragaman patogen. Tercatatdelapan patotipe yang berbeda, seperti ditunjukkan oleh pola virulensi tertentu isolat pada setiap genotipe. Hasilpenentuan patotipe Xoo mengungkapkan bahwa tanggap reaksi patotipe Xoo berdasarkan reaksinya terhadap NIL dangenotipe diferensial Indonesia berbeda-beda. Hasil penilaian di lapangan menunjukkan kejadian dan keparahan penyakitHDB pada genotipe padi masing masing berkisar dari 25-100% dan 5,5-72,91%, sedangkan indeks penyakit berkisarantara 1,15-72,9%. Tanggap penyakit bervariasi antar genotipe padi. IRBB50 (Xa4 + xa5), IRBB51 (Xa4 + xa13), IRBB52(Xa4 + Xa21), IRBB53 (Xa4 + Xa21), IRBB56 (Xa4 + xa5 + xa13), IRBB57 (Xa4 + xa5 + Xa21), IRBB59 (Xa4 + xa13 +Xa21), IRBB64 (Xa4 + xa5 + Xa7 + Xa21), IRBB66 (Xa4 + xa5 + Xa7 + xa13 + Xa21), IRBB7 (Xa7), Angke (Xa4 + xa5)dan Code (Xa4 + Xa7) bereaksi sangat tahan terhadap patogen HDB. Genotipe tersebut memiliki potensi sebagai bahangenetik piramida beberapa gen ketahanan untuk mengembangkan padi tahan terhadap penyakit HDB di Indonesia."

"MRSA merupakan penyebab infeksi nosokomial yang menjadi masalah kesehatan utama dibanyak rumah sakit di dunia, termasuk Indonesia. Patogen ini memiliki banyak faktor virulensiserta dapat mengembangkan resistensi terhadap berbagai kelas antibiotik, sehingga membuatinfeksi MRSA menjadi lebih sulit untuk diobati. Informasi terkait data genomik dari strainMRSA di Indonesia saat ini masih sangat terbatas. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuanuntuk memberikan informasi mengenai karakteristik genomik beserta profil virulensi danresistensi antibiotik dari 17 isolat tersimpan MRSA yang diisolasi dari pasien di rumah sakitrujukan. Dilakukan whole genome sequencing menggunakan platform Illumina NovaSeq 6000,kemudian dilanjutkan dengan analisis bioinformatika menggunakan pipeline ASA3P danBacannot. Hasil analisis menunjukkan bahwa ST239-SCCmec III-t37 (CC8) adalah yangpaling dominan ditemukan diantara semua isolat (41%). Selain itu, ditemukan ST baru (ST4abd) yang memiliki kemiripan yang tinggi dengan ST6. ST lain yang ditemukan adalahST772, ST97, ST8, dan ST118, yang termasuk dalam CC1, CC5, CC8, CC97. Semua isolatMRSA memiliki faktor virulensi yang tinggi, terutamaditemukan isolat MDR sebanyak 83,2% dengan resistensi paling tinggi ditunjukkan olehST 8, ST 6, dan ST 4abd. Selain itu,ST239. Hasil penelitian ini menunjukkan adanya strain HA-MRSA dan CA-MRSA pada isolattersimpan dari rumah sakit rujukan dengan profil virulensi dan resistensi yang tinggi.

---

Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is a major cause of nosocomial infections

in many healthcare settings worldwide, including Indonesia. This pathogen exhibits multiple

virulence factors and can develop resistance to multiple classes of antibiotics, causing MRSA

infections become difficult to treat. However, the genomic data of MRSA in Indonesia is still

limited. Therefore, this study aims to provide information regarding genomic characteristics,

virulence and antibiotic resistance profiles of 17 archived MRSA isolates from patients in

referral hospital. Whole genome sequencing was conducted using the Illumina NovaSeq 6000

platform, followed by bioinformatic analysis employing the ASA3P and Bacannot pipelines.

Analysis revealed that the ST239-SCCmec III-t37 (CC8) lineage predominated among all

isolates (41%). Additionally, a novel ST (ST 4abd) closely related to ST6 was identified. Other

STs found included ST772, ST97, ST8, and ST118, belonging to CC1, CC5, CC8, and CC97,

respectively. All MRSA isolates possess numerous virulence factors, notably prominent in ST

8, ST 6, and ST 4abd. Furthermore, 83.2% of isolates exhibited multidrug resistance (MDR),

with highest resistance observed in the ST239 lineage. This research emphasized the presence

of HA-MRSA and CA-MRSA in referral hospital with high virulence and antibiotic resistance

trait."