Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 6 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Ida Mujtahidah
Penerapan komputasi paralel pada algoritma firefly-markov clustering untuk menganalisis jaringan interaksi protein = Application of parallel computing on firefly markov clustering algorithm for analyzing protein interaction network
" ABSTRAK
Protein memiliki peranan penting dalam mengontrol fungsi enzim, mengatur produksi dan aktivitas di dalam sel. Untuk melakukan hal ini, protein berinteraksi dengan protein-protein lainnya, DNA dan molekul-molekul lainnya. Jaringan interaksi protein-protein ini memiliki ukuran yang sangat besar. Sehingga untuk memudahkan dalam menganalisis jaringan ini diperlukan metode clustering. Pada penelitian ini, algoritma Markov clustering digabungkan dengan algoritma firefly yang disebut sebagai algoritma firefly-Markov clustering FMCL . Pada algoritma FMCL, posisi kunang-kunang akan menggantikan nilai parameter inflate. ... "
2018
T49526
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
M. Syamsuddin Wisnubroto
Penerapan komputasi paralel pada algoritma firefly soft regularized markov clustering untuk menganalisis jaringan interaksi protein = Application of parallel computing on firefly soft regularized markov clustering algorithms for analyzing protein interaction network
" ABSTRAK
Protein memiliki peranan yang sangat penting dalam kehidupan. Setiap protein berinteraksi dengan protein-protein lain, DNA, dan molekul-molekul lainnya, sehingga terbentuklah jaringan interaksi protein yang berukuran sangat besar. Untuk memudahkan dalam menganalisisnya, diperlukan metode clustering. Algoritma Soft Regularized Markov Clustering (SR-MCL) merupakan pengembangan metode clustering yang mengurangi kelemahan dari Regularized Markov Clustering dan Markov Clustering. Namun, SR-MCL masih memiliki kelemahan yaitu parameter inflasi yang selalu dimasukkan secara manual oleh peneliti. Penelitian ini, SR-MCL digabung dengan Algoritma Firefly yang selanjutnya disebut Firefly Soft Regularized Markov ... "
2018
T49442
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Mohamad Irvan Septiar Musti
Prediksi interaksi protein berdasarkan barisan asam amino pada human immunodeficiency virus menggunakan global encoding dikombinasikan dengan rotation forest ensemble classifier = Sequence based prediction of protein protein interactions in human immunodeficiency virus using global encoding combined with rotation forest ensemble classifier
" ABSTRAK
HIV Human Immunodeficiency Virus adalah sebuah jenis retrovirus obligat intraseluler yang menyerang sistem kekebalan tubuh manusia. Virus ini menyerang dengan cara melakukan interaksi antara protein virus dengan protein manusia. Penelitian ini menggunakan data berupa barisan asam amino dari protein yang akan diubah fiturnya menggunakan metode global encoding. Hasil ekstraksi fitur tersebut kemudian akan digunakan sebagai masukan untuk metode rotation forest guna memprediksi interaksi protein HIV dengan manusia. Selain itu pula, penelitian ini juga membandingkan performa ... "
2018
T49480
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Vira Yustia Nurazmi
Penerapan komputasi paralel pada algoritma firefly regularized markov clustering untuk menganalisis jaringan interaksi protein = Application of parallel computing on firefly regularized markov clustering algorithm for analyzing protein interaction networks
" ABSTRAK
Algoritma Regularized Markov Clustering RMCL adalah suatu metode graf clustering yang merupakan pengembangan dari Markov Clustering MCL . Algoritma RMCL masih memiliki kelemahan pada parameter penggelembungan yang biasanya selalu diinputkan oleh pengguna untuk mendapatkan hasil clustering yang baik. Pada penelitian ini, RMCL digabungkan dengan algoritma Firefly untuk menganalisis jaringan interaksi protein yang disebut algoritma Firefly Regularized Markov Clustering FRMCL . Algoritma Firefly merupakan algoritma yang terinspirasi dari perilaku kunang-kunang dalam mencari koloninya. Implementasi algoritma FRMCL ... "
2018
T49488
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Shirley Aprilia
Prediksi interaksi protein pada human immunodeficiency virus menggunakan discrete cosine transform dikombinasikan dengan rotation forest ensemble classifier = Sequence based prediction of protein protein interaction in human immunodeficiency virus using discrete cosine transform combined with rotation forest ensemble classifier
" ABSTRAK
Protein adalah salah satu biomakromolekul yang mempunyai peran sangat penting dalam organisme hidup. Semua jenis protein terdiri dari serangkaian kombinasi 20 asam amino. Interaksi Protein-Protein Interaksi PPI memainkan peran penting dalam sebagian besar proses biologis sehingga deteksi interaksi protein-protein PPI pada dasarnya penting untuk memahami mekanisme molekuler dalam sistem biologis. Dengan menggunakan proses komputasi dan menerapkan metode pembelajaran mesin, akan lebih efisien daripada metode eksperimental yang membutuhkan waktu lama dan biaya mahal. Dalam tesis ini ... "
2018
T49487
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Susilo Hartomo
Prediksi interaksi protein berdasarkan barisan asam amino pada human immunodeficiency virus menggunakan pseudo substitution matrix representation feature dikombinasikan dengan rotation forest ensemble classifier = Sequence base prediction of protein-protein interactions using pseudo substitution matrix representation feature and ensemble rotation forest classifier in HIV (human immunodeficiency virus)
" ABSTRAK
Human Immunodeficiency Virus (virus HIV) adalah virus penyebab penyakit Acquired Immunodeficiency Syndrome (AIDS). Virus HIV merupakan retro virus yang menginfeksi sel-sel sistem kekebalan tubuh manusia. Virus HIV dalam proses menginfeksi tubuh manusia tidak dapat lepas dari terjadinya interaksi antara protein HIV dan protein manusia. Untuk menganalisis jaringan interaksi antar protein dapat menggunakan barisan asam amino penyusun dari suatu protein. Proses analisis dapat dilakukan dengan metode konvensional maupun komputasi. Keunggulan menggunakan metode komputasi yaitu dapat menghemat ... "
2018
T49440
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library