Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 4 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Novrina Ariij Aisyti
"Salah satu perkembangan menarik dalam pengobatan kanker adalah target terapi kanker, yaitu pemberian obat yang ditargetkan secara molekuler untuk menginhibisi protein onkogenik tirosin kinase. Tirosin kinase adalah enzim kinase yang berperan dalam proses seluler seperti pertumbuhan, diferensiasi, migrasi, dan apoptosis sebuah sel. Mutasi atau ekspresi berlebih dari tirosin kinase dapat mengakibatkan perubahan fungsi seluler tirosin kinase yang memicu pembentukan sel tumor dan kanker, sehingga inhibisi dari protein tersebut dapat memperlambat proliferasi dan angiogenesis dari sel kanker. Pada penelitian ini, permodelan secara in silico digunakan untuk mengetahui aktivitas inhibisi senyawa propolis yang berasal dari lebah tak bersengat Tetragonula biroi aff. Indonesia pada target protein tirosin kinase penyebab non-small cell lung cancer (NSCLC), kanker payudara, dan leukemia myeloid. 18 senyawa uji propolis yang memiliki potensi antikanker diujikan sebagai inhibitor untuk menghambat aktivitas protein Anaplastic Lymphoma Kinase (ALK), Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 (HER2), dan Brutons Tyrosine Kinase (BTK) penyebab NSCLC, kanker payudara, dan leukemia myeloid secara berturut-turut. Penambatan dikomputasikan menggunakan AutoDock Vina®, dengan LigPlot+ dan PyMOL untuk memvisualisasikan interaksi molekuler antara kompleks inhibitor-protein yang dihasilkan. Hasil menunjukkan bahwa kurarinon adalah inhibitor yang paling kuat terhadap ALK dengan skor -8,8 kkal/mol, yang berinteraksi dengan Met1199 sebagai residu utama untuk menghambat ALK. Sementara itu macarangin memiliki skor penambatan tertinggi untuk target HER2 dengan nilai sebesar -11,3 kkal/mol, dan Derrubone sebagai inhibitor paling kuat untuk BTK dengan skor -9,4 kkal/mol. Maka dari itu, studi ini menunjukkan bahwa kurarinon berpotensi untuk menjadi inhibitor ALK, dengan macarangin berpotensi sebagai inhibitor HER2, dan derrubone berpotensi untuk menjadi inhibitor BTK sehingga ketiga senyawa tersebut dapat diteliti dan dievaluasi lebih lanjut untuk studi in-vitro dan in-vivo sebagai novel inhibitor ALK, HER2, dan BTK.

 


One of the interesting developments in cancer treatment is the use of cancer targeted therapy, a molecular targeted drugs that are given to inhibit the oncogenic protein of tyrosine kinases. The tyrosine kinases is a group of kinase enzyme that plays a role in cellular processes such as cell growth, differentiation, migration, and apoptosis. Mutation or overexpression of tyrosine kinases can result in disruption of tyrosine kinase cellular function which triggers the formation of tumor and cancerous cells, where the inhibition of these proteins can slow down the proliferation and angiogenesis of cancer cells. In this study, in-silico modeling was used to determine the inhibitory activity of propolis compounds derived from Indonesian Tetragonula biroi aff. targeting tyrosine kinase protein that causes non-small cell lung cancer (NSCLC), breast cancer, and myeloid leukemia. 18 propolis compounds that have anticancer potential are tested as inhibitors to block the activity of Anaplastic Lymphoma Kinase (ALK), Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 (HER2), and Bruton's Tyrosine Kinase (BTK) protein that causes NSCLC, breast cancer, and myeloid leukemia respectively. Docking was computed using AutoDock Vina®, with LigPlot+ and PyMOL to visualize molecular interactions between the resulting inhibitor-protein complex. The result show that kurarinone is the most potent inhibitor towards ALK with a score -8,8 kcal/mol, interacting with Met1199 as a key residues for inhibiting ALK. Meanwhile macarangin has the highest docking score for HER2 target resulting in -11,3 kcal/mol, and derrubone as the most potent inhibitor for BTK with a score of -9,4 kcal/mol. This study suggest that kurarinone has the potential as ALK inhibitor, with macarangin has the potential to inhibit HER2, and derrubone has the potential as BTK inhibitor so that the three compounds can be further investigated and evaluated for in-vitro and in-vivo studies as novel ALK, HER2, and BTK inhibitors.

"

Depok: Fakultas Teknik Universitas Indonesia, 2020
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
cover
Rafidha Irdiani
"Coronavirus disease 2019 (Covid-19) merupakan penyakit saluran pernapasan yang disebabkan oleh virus severe acute respiratory syndrome 2 (SARS-CoV-2). Saat ini, Covid-19 menjadi masalah kesehatan global dan ditetapkan sebagai pandemic pada Maret 2020. Kompleksitas dan mutasi ssRNA virus yang sangat cepat menyebabkan dibutuhkan waktu lama untuk menghasilkan vaksin yang efektif. Sementara itu, angka kematian yang terus meningkat mengiringi peningkatan angka kasus setiap harinya membuat tingginya urgensi penemuan obat. Terdapat dua target pengobatan Covid-19 yang menjanjikan, yaitu protease SARS-CoV-2 dan ACE-2. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi propolis Tetragonula aff. biroi sebagai obat Covid-19 melalui studi in silico. Dalam penelitian ini, penambatan molekuler antara senyawa propolis dengan masing-masing protease SARS-CoV-2 dan ACE-2 dilakukan. Melalui penelitian ini, dapat disimpulkan bahwa senyawa yang berpotensi menghambat aktivitas protease SARSCoV-2 adalah glyasperin A dan broussoflavonol F, dengan docking score -7,8 kcal/mol dan dengan persentase kemiripan profil interaksi masing-masing dibandingkan dengan inhibitor 13b sebagai kontrol positif sebesar 63% dan 75%. Sementara itu, senyawa yang berpotensi menghambat aktivitas ACE-2 adalah glyasperin A, broussoflavonol F, dan sulabiroins A dengan docking score secara berurutan -10,8 kcal/mol, -9,9 kcal/mol, dan -9,5 kcal/mol serta persentase kemiripan profil interaksi dibandingkan dengan inhibitor MLN-4760 sebagai kontrol positif secara berurutan sebesar 77%, 23%, dan 38%.

Coronavirus disease 2019 (COVID-19), a respiratory disease caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), is a global health concern, as the World Health Organization declared this outbreak to be a global pandemic in March 2020. The need for an effective treatment is urgent because the development of an effective vaccine may take years given the complexity of the virus and its rapid mutation. Two promising treatment targets for COVID-19 are SARS-CoV-2 main protease and ACE-2. Thus, this study examined whether Sulawesi propolis compounds produced by Tetragonula aff. biroi can inhibit the enzymatic activity of both proteins. In this study, molecular docking was performed to analyze the interaction profiles of propolis compounds with SARS-CoV-2 main protease and ACE-2 severally. Based on the research, two compounds, namely glyasperin A and broussoflavonol F, are potential inhibitor for SARS-CoV-2 protease with docking score -7.8 kcal/mol and binding similarities compared to inhibitor 13b as positive control 63% and 75% respectively. Furthermore, glyasperin A, broussoflavonol F and sulabiroins A are also considered as potential inhibitors for ACE-2 with docking score -10.8 kcal/mol, -9.9 kcal/mol and -9.5 kcal/mol respectively, and binding similarity compared to inhibitor MLN-4760 as positive control 77%, 23% and 38% respectively."
Depok: Fakultas Teknik Universitas Indonesia, 2020
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Muhammad Nizar Hamzah Al Faris
"Propolis merupakan senyawa resin yang dikumpulkan dan diolah oleh lebah madu dari berbagai macam sumber tanaman dan banyak digunakan sebagai obat tradisional. Propolis tersusun atas komponen yang bervariasi serta memiliki aktivitas biologis yang luas dimana salah satunya adalah aktivitas anti-diabetes. Diabetes melitus merupakan penyakit metabolik di seluruh dunia yang diindikasikan oleh hiperglikemia atau tingginya kadar gula darah. Penyakit ini disebabkan oleh defisiensi sekresi insulin, resistansi enzim insulin, atau kerusakan. Diantara klasifikasi diabetes melitus, tipe 2 adalah kasus paling banyak dengan proporsi 90 - 95% dari total kasus diabetes. Sayangnya, obat diabetes melitus komersial saat ini masih menghasilkan banyak efek samping yang berbahaya. Pada aktivitas antidiabetes propolis, penelitian umum yang dilakukan membahas nilai kritis seperti gula darah, HbA1c, dan berat badan subjek penelitian. Disisi lain, penelitian yang menjawab aktivitas antidiabetes masih terbatas pada struktur atau kelas senyawa kimia tertentu seperti pada flavonoid, steroid, dan isoflavonoid. Pada penelitian ini akan dilakukan pengujian aktivitas antidiabetes tipe 2 dari propolis secara in silico dan mempelajari mekanismenya pada tubuh manusia. Sebagai bentuk kebaruan, akan menggunakan 30 senyawa uji yang berasal dari dua kelompok propolis Sulawesi Selatan yaitu hasil penelusuran menggunakan LC-MS / MS dan berdasarkan publikasi Miyata et al. (2020). Penelitian ini diawali dengan penentuan target protein yang meregulasi diabetes melitus tipe 2. Kemudian persiapan bahan dilakukan untuk masing-masing ligan dan target protein. Selanjutnya dilakukan analisis penambatan molekuler, analisis interaksi molekuler, visualisasi 2D dan 3D. Berdasarkan hasil analisis, aktivitas antidiabetes tipe 2 diperoleh dari senyawa 1,2,2-Trimethyl-3 - [(4-methylphenyl) carbamoyl] cyclopentane carboxylic acid dengan menginhibisi Aldose Reductase, Macarangin dengan mengaktivasi NAD-Dependent protein deacetylase sirtuin-6, (1'S) -2-trans, 4-trans-absisic acid dengan menginhibisi Dipeptidyl Peptidase 4, serta Broussoflavonol F dan Glyasperin A dengan menginhibisi Fructose-1,6-bisphosphatase. Dari hasil analisis pada penelitian ini ditunjukkan bahwa aktivitas antidiabetes dari propolis sulawesi selatan terbukti pada skala atomik.

Propolis is a resin compound which is collected and processed by honey bees from various plant sources and is widely used as traditional medicine. Propolis is composed of various components and has extensive biological activity, one of which is anti-diabetic activity. Diabetes mellitus is a metabolic disease throughout the world that is indicated by hyperglycemia or high blood sugar levels. This disease is generally caused by deficiency of insulin secretion, insulin enzyme resistance, or both. Among the classification of diabetes mellitus, type 2 is the most cases with a percentage of 90 - 95% of the total diabetes cases. In antidiabetic activity of propolis, research is generally conducted to discuss critical values ​​such as blood glucose, HbA1c, and body weight of research subjects. Unfortunately, current diabetes mellitus therapy still produces many dangerous side effects. On the other hand, research that answers the mechanism of antidiabetic activity is still limited to the structure or class of certain chemical compounds such as flavonoids, steroids, and isoflavonoids. This research will evaluate type 2 antidiabetic activity of propolis in silico and study its mechanism in the human body. As a form of novelty, 30 molecules derived from two groups of South Sulawesi propolis, namely results of LC-MS / MS identification and based on the publication of Miyata et al. (2020). The research begins with the determination of target proteins which regulate type 2 diabetes mellitus. Then material preparation was carried out for each ligand and target protein. Furthermore, molecular docking analysis, molecular interaction analysis, 2D and 3D visualization were performed. Based on the analysis, type 2 antidiabetic activity was obtained from 1,2,2-Trimethyl-3 - [(4-methylphenyl) carbamoyl] cyclopentane carboxylic acid with the mechanism of inhibiting Aldose Reductase, Macarangin by activating the NAD-Dependent protein deacetylase sirtuin-6, (1'S) -2-trans, 4-trans-abscisic acid with the mechanism of inhibiting Dipeptidyl Peptidase 4, and Broussoflavonol F and Glyasperin A with the mechanism of inhibiting Fructose-1,6-bisphosphatase. From the results of the analysis in this study it was shown that the antidiabetic activity of South Sulawesi propolis was proven on the atomic scale."
Depok: Fakultas Teknik Universitas Indonesia, 2020
T-pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library