Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 16 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Tambunan, Christine Mangisi Rettauli
Waveform relaxation: suatu metode penyelesaian masalah nilai awal pada sistem persamaan diferensial biasa
Depok: Universitas Indonesia, 2004
S27409
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Darno Raharjo
Penerapan metode pengelompokan regularized markov clustering (R-MCL) untuk menganalisa kekerabatan virus dengue = Implementation regularized markov clustering (R-MCL) algortihm to analyze family of dengue virus / Darno Raharjo
" [ABSTRAK
Virus dengue terdiri atas 10 protein penyusun yang berbeda dan diklasifikasikan menjadi empat serotipe utama (DEN 1 ? DEN 4). Penelitian ini dirancang untuk melakukan pengelompokan terhadap 30 sekuens protein virus dengue yang diambil dari Virus Pathogen Database and Analysis Resource (ViPR) menggunakan metode Regularized Markov Clustering (R?MCL) dan untuk menganalisis hasilnya. Dengan menggunakan program Python 3.4, algoritma R-MCL diimplementasikan dan menghasilkan 8 kelompok dengan pusat kelompok lebih dari satu di beberapa kelompok. Banyaknya pusat kelompok menunjukkan tingkat kepadatan interaksi. Interaksi protein ? ... "
2015
T44667
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Eryawan Deise Ulul
Implementasi hierarchical clustering menggunakan k-mer sparse matrix untuk menganalisis kekerabatan virus mers-cov = Implementation of hierarchical clustering using k-mer sparse matrix to analyze mers-cov genetic relationship / Eryawan Deise Ulul
" [ABSTRAK
Hierarchical clustering merupakan metode yang efektif dalam membentuk pohon filogenetik dengan mengetahui matriks jarak antar barisan DNA. Salah satu cara untuk membuat matriks jarak yaitu dengan cara menggunakan metode -mer. Kelebihan dari metode -mer yaitu lebih efisien dalam segi waktu. Langkahlangkah dalam membuat matriks jarak dengan metode -mer dimulai dengan membentuk -mer sparse matrix dari masing barisan DNA. Selanjutnya, membentuk -mer singular value vector. Pada tahap akhir yaitu menghitung jarak antar vektor. Pada tesis ini akan dilakukan analisis terhadap barisan DNA MERSCoV dengan ... "
2015
T44260
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Hengki Muradi
Penerapan metode pengelompokan hierarchical ordered partitioning and collapsing hybrid (Hopach) untuk menganalisis kekerabatan virus ebola = Application of hierarchical ordered partitioning and collapsing hybrid method to analyzing phylogenetically on ebola virus
" [Salah satu tujuan dalam studi ekpresi gen (DNA/Protein) adalah menemukan subbagian yang penting secara biologis dan kelompok-kelompok dari gen-gen. Pengelompokan gen tersebut dapat dilakukan dengan metode hirarki maupun metode partisi. Kedua metode pengelompokan dapat dikombinasikan, dimana dilakukan fase partisi dan hirarki secara bergantian, metode ini dikenal dengan metode Hopach. Tahap partisi dapat dilakukan dengan metode PAM, SOM, atau K-Means. Proses partisi dilanjutkan dengan proses Ordered, baru kemudian dikoreksi dengan proses agglomorative, sehingga hasil pengelompokan menjadi lebih akurat. ... "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2015
T43650
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Fatimah
Metode clustering self organizing MAP (SOM) pada DNA human papillomavirus (HPV) sebagai penyebab utama penyakit kanker serviks = Clustering self organizing MAP (SOM) method for humam papillomavirus (HPV) DNA as a main cause of cervical cancer disease / Fatimah
" Salah satu metode clustering yang banyak digunakan karena unggul dari sisi kestabilannya adalah metode Self Organizing Map. Pada tesis ini dibahas penggunaan metode SOM pada DNA Human Papillomavirus (HPV) yang menjadi penyebab utama penyakit kanker serviks, yaitu penyakit kanker yang menempati urutan pertama di negara berkembang. DNA HPV yang digunakan adalah sebanyak 18 buah yang diambil berdasarkan complete genome terbaru. Dengan menggunakan program berbasis opensource R, proses clustering berhasil mengelompokkan 18 tipe HPV ke dalam ... "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2015
T43535
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Nurlaili Lisma Febriyani
Pengelompokan sekuens protein virus herpes menggunakan tribe markov clustering (tribe-MCL) = Clustering of protein sequences herpes virus using tribe markov clustering (tribe-MCL) / Nurlaili Lisma Febriyani
" [ABSTRAK
Berdasarkan data World Health Organization (WHO) diketahui prevalensi herpes di negara-negara berkembang lebih tinggi dibandingkan dengan di negara maju. Virus herpes dapat ditemukan dimana saja dan salah satu ciri penting adalah kemampuannya yang dapat menimbulkan infeksi akut dan kronik pada waktuwaktu tertentu. Akibat infeksi tersebut memungkinkan terjadi komplikasi yang lebih berat. Virus herpes terdiri atas genome DNA tertutup inti yang mengandung protein dan dibungkus oleh glikoprotein. Dengan mempelajari ekspresi gen (sekuen DNA/protein) dan didukung oleh kemajuan di bidang bioinformatika, dapat ditemukan sub-sub bagian ... "
2015
T43669
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Soeganda Formalidin
Mencari korelasi bicluster pada data ekspresi gen penyakit diabetes melitus dengan menggunakan metode three-phase biclustering = Finding correlated bicluster from gene expression data of diabetes melitus using three-phase biclustering
" Penelitian ini bertujuan untuk mencari korelasi yang kuat antar gen dan kondisi dari data ekspresi gen penyakit Diabetes Melitus (DM) pada sampel obesitas dan sampel kurus dengan menggunakan metode three phase biclustering. Tahap pertama pada metode ini adalah dengan menggunakan matriks dekomposisi Singular Value Decomposition (SVD) yang mentransformasikan data menjadi dua matriks berbasis gen dan kondisi. Selanjutnya pada tahap kedua menggunakan metode partisi Partition Around Medoids (PAM) pada dua matriks gen dan kondisi menggunakan jarak ... "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2018
T49441
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
M. Syamsuddin Wisnubroto
Penerapan komputasi paralel pada algoritma firefly soft regularized markov clustering untuk menganalisis jaringan interaksi protein = Application of parallel computing on firefly soft regularized markov clustering algorithms for analyzing protein interaction network
" ABSTRAK
Protein memiliki peranan yang sangat penting dalam kehidupan. Setiap protein berinteraksi dengan protein-protein lain, DNA, dan molekul-molekul lainnya, sehingga terbentuklah jaringan interaksi protein yang berukuran sangat besar. Untuk memudahkan dalam menganalisisnya, diperlukan metode clustering. Algoritma Soft Regularized Markov Clustering (SR-MCL) merupakan pengembangan metode clustering yang mengurangi kelemahan dari Regularized Markov Clustering dan Markov Clustering. Namun, SR-MCL masih memiliki kelemahan yaitu parameter inflasi yang selalu dimasukkan secara manual oleh peneliti. Penelitian ini, SR-MCL digabung dengan Algoritma Firefly yang selanjutnya disebut Firefly Soft Regularized Markov ... "
2018
T49442
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Susilo Hartomo
Prediksi interaksi protein berdasarkan barisan asam amino pada human immunodeficiency virus menggunakan pseudo substitution matrix representation feature dikombinasikan dengan rotation forest ensemble classifier = Sequence base prediction of protein-protein interactions using pseudo substitution matrix representation feature and ensemble rotation forest classifier in HIV (human immunodeficiency virus)
" ABSTRAK
Human Immunodeficiency Virus (virus HIV) adalah virus penyebab penyakit Acquired Immunodeficiency Syndrome (AIDS). Virus HIV merupakan retro virus yang menginfeksi sel-sel sistem kekebalan tubuh manusia. Virus HIV dalam proses menginfeksi tubuh manusia tidak dapat lepas dari terjadinya interaksi antara protein HIV dan protein manusia. Untuk menganalisis jaringan interaksi antar protein dapat menggunakan barisan asam amino penyusun dari suatu protein. Proses analisis dapat dilakukan dengan metode konvensional maupun komputasi. Keunggulan menggunakan metode komputasi yaitu dapat menghemat ... "
2018
T49440
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Anas Bachtiar
Perbandingan Metode Seleksi Fitur Support Vector Machine-Recursive Feature Elimination (SVM-RFE) dan One Dimensional Naïve Bayes Classifier (1-DBC) pada Klasifikasi Kanker Prostat = Selecting Features Subsets based on Support Vector Machine-Recursive Features Elimination and One-Dimensional Naïve Bayes Classifier for Classification of Prostate Cancer
" Kematian yang disebabkan oleh kanker diperkirakan akan terus meningkat, terutama untuk kanker prostat. Penyakit ini adalah jenis kanker yang paling umum untuk pria di dunia. Jumlah kematian dapat dikurangi dengan deteksi dini menggunakan machine learning. Salah satunya adalah klasifikasi data kanker prostat. Data kanker yang digunakan memiliki berbagai fitur, tetapi tidak semua fitur adalah fitur penting. Dalam penelitian ini, kami menggunakan Support Vector Machine-Recursive Feature Elimination (SVM-RFE) dan One Dimensional Naïve Bayes Classifier (1-DBC) sebagai ... "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2019
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
<<   1 2   >>