Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Epididimis adalah bagian sistem reproduksi laki-laki yang berperan penting dalam proses pematangan sperma. Proses ini berlangsung karena adanya interaksi antara protein yang disekresikan oleh sel-sel epitel epididymis dengan sperma. Banyak gen yang mengatur protein-protein tersebut belum dipahami sepenuhnya, contohnya Serpina1f. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi signal peptide sebagai dasar informasi untuk mempelajari fungsi gen tersebut lebih lanjut, dan ketergantungan androgen untuk secara dini menyeleksi apakah gen ini cocok dikembangkan menjadi kontrasepsi pria nonhormonal. Metode penelitian untuk memprediksi signal peptide adalah dengan menggunakan SignalP 4.0, sedangkan analisis ketergantungan androgen menggunakan real-time RT-PCR. Hasil penelitian ini memperlihatkan bahwa Serpina1f mengandung signal peptide pada 27 asam amino yang pertama, sedangkan ekspresi gen berubah sesuai level androgen. Hal ini menunjukkan bahwa Serpina1f menghasilkan secretory protein dan gen ini diregulasi androgen.

---

Epididymis is a part of male reproductive system that plays important role in sperm maturation process. This process occurs by the interaction between proteins secreted by epididymal epithelial cells with sperm. Many of the genes that regulate the protein involved in this process have not been understood completely, such as Serpina1f. The objective of this research is to identify its signal peptide as basic information to further learn its function, and androgen dependency to early select whether this gene could be a target for a nonhormonal male contraception. SignalIP 4.0 was used to predict the presence of signal peptide in its amino acid sequence, while the androgen dependency analysis was performed by quantitative real-time RT-PCR using RNA samples from gonadectomized mice and gonadectomized mice plus androgen therapy. The result showed that Serpina1f contained signal peptide at the first 27 amino acid sequence, while its expression fluctuated according to androgen level. It can be concluded that Serpina1f encodes a secretory protein and it is an androgen dependent gene."

"Latar Belakang : Proses pematangan sperma terjadi karena adanya interaksi antara sel sperma dan protein yang disekresikan oleh sel epitel yang melapisi saluran epididimis, sehingga menyebabkan perubahan morfologi dan biokimia pada membran spermatozoa. Sekresi protein pada saluran epididimis ditentukan oleh gen-gen yang diekspresikan secara spesifik di region tertentu misalnya pada region initial segmen, caput, corpus atau cauda sehingga pada masing-masing segmen terbentuk lingkungan spesifik (microenvironment) yang diperlukan untuk proses pematangan sperma. Gen yang menyandi protein yang terlibat dalam proses pematangan sperma diekspresikan secara spesifik pada epididimis dan ekspresinya diregulasi oleh androgen. Salah satu gen yang diduga berperan dalam proses pematangan sperma adalah gen Serpina1f. Berdasarkan urutan asam amino, Serpina1f dianggap sebagai anggota baru dari keluarga serpin dengan fungsi putatif sebagai serin protease inhibitor. Karakterisasi Serpina1f pada organ reproduksi pria khususnya epididimis dapat memberikan petunjuk mengenai perannya dalam proses pematangan sperma.Tujuan : Mengkarakterisasi gen Serpina1f di epididimis mencit.Desain : Penelitian ini menggunakan analisis bioinformatika dan eksperimentalMetode : Struktur gen, batas ekson-intron dan domain fungsional serta deteksi signal peptide pada Serpina1f dilakukan analisis bioinformatika. Untuk menganalisis ekspresi SERPINA1F tingkat protein dilakukan western imunoblotting, sedangkan untuk mengetahui lokasi protein SERPINA1F dilakukan imunohistokimia dan imunositokimia.Hasil : SERPINA1F merupakan anggota family SERPIN. Berdasarkan analisis Signal peptide, SERPINA1F merupakan protein sekretori. Hasil imunohistokimia pada jaringan epididimis mencit menunjukkan adanya reaksi antibodi dengan terwarnainya nukleus dan sitoplasma pada sel epitel initial segment dan caput. Sedangkan pada corpus dan cauda SERPINA1F terdeteksi hanya pada sitoplasma. Hasil analisis western imunoblotting dan imunositokimia pada protein sperma menunjukkan adanya asosiasi SERPINA1F dengan spermatozoa dan terdapat di seluruh bagian spermatozoa.Kesimpulan : SERPINA1F memiliki signal peptide pada asam amino 1 - 27 dan termasuk protein sekretori. Berdasarkan urutan asam aminonya, SERPINA1F yang termasuk famili SERPIN. Protein SERPINA1F diekspresikan di sel epitel initial segment, caput, corpus dan cauda. SERPINA1F berasosiasi dengan spermatozoa dan terdapat pada seluruh bagian spermatozoa.

---

Background: Sperm maturation occur due to the interaction between the sperm cell and the proteins secreted by the epithelial cells lining the epididymis duct, causing morphological and biochemical changes in the sperm membrane. The secretion of proteins in epididymis duct is determined by genes that are expressed specifically in certain regions, for example in the region of the initial segment, caput, corpus or cauda that each segment forms microenvironment that is required for sperm maturation process. Genes that encode proteins involved in the process of sperm maturation in the epididymis specifically expressed and its expression is regulated by androgens. One of the genes thought to play a role in sperm maturation process is Serpina1f. Based on the amino acid sequence, Serpina1f considered as a new member of the serpin family with putative functions as a serine protease inhibitor. Characterization Serpina1f on male reproductive organs, especially the epididymis may provide a clue as to its role in sperm maturation process.Objective: To characterize Serpina1f in the epididymis of mice.Design: This study used a bioinformatics analysis and experimental.Methods: Bioinformatics analysis were used to know gene structure, exon-intron boundaries and functional domains as well as the detection of signal peptide on Serpina1f. To analyze protein expression levels SERPINA1F performed western immunoblotting, whereas for the location of the protein immunohistochemistry and immunocytochemistry SERPINA1F done.Results: SERPINA1F a member of the serpin family. Based on the analysis of signal peptide, a protein secretory SERPINA1F. The results of immunohistochemistry on epididymis tissue of mice showed an antibody reaction with colored nucleus and cytoplasm in epithelial cells of the initial segment and caput. While SERPINA1F detected only in the cytoplasm corpus and cauda. The results of western imunoblotting analysis and immunocytochemistry showed SERPINA1F associated with spermatozoa and found in all parts of the spermatozoa.Conclusion: SERPINA1F has a signal peptide at amino acids 1-27 and include secretory proteins. Based on their amino acid sequence, which includes SERPINA1F serpin family. The protein is expressed in epithelial cells SERPINA1F initial segment, caput, corpus and cauda. SERPINA1F associated with spermatozoa and found on all parts."

"Epididimis adalah bagian dari alat reproduksi laki-laki yang berfungsi dalam pematangan sperma. Proses ini terjadi melalui interaksi antara sperma dan protein yang disekresikan oleh sel-sel epitel di epididimis. Protein-protein tersebut dikode oleh gen yang terekspresi secara spesifik di epididimis, salah satunya adalah Serpina1f. Akan tetapi, kebanyakan dari regulasi gen diatas belum dipahami dan perlu ditelilti, lebih lanjut. Serpina1f adalah salah satu gen yang menarik untuk di karakterisasikan. Gen ini diregulasi oleh androgen dan sudah dibuktikan oleg data yang diambil menggunakan mikroaray analisis. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisa struktur gen dari Serpina1f sebagai dasar untuk mempelajari fungsi dari gen tersebut lebih lanjut, dan juga distribusi jaringan untuk menyeleksi apakah gen Serpina1f hanya terekspresi di epididymis yang pada akhirnya akan menentukan apakah gen ini cocok dikembangkan menjadi kontrasepsi non-hormonal bagi pria. Penelitian ini dilakukan sejak Mei 2012 sampai Februari 2013 di Laboratorium Departemen Biologi Universitas Indonesia dan dilaksanakan dengan menggunakan analisa bioinformatika dan analisa ekspresi gen. Hasil penelitian menunjukan bahwa gen Serpina1f sangat dominan pada daerah initial segment pada epididimis mencit sehingga cocok untuk dikembangkan menjadi kontrasepsi non-hormonal bagi pria.

---

Epididymis is a part of male reproductive system which functions in the process of sperm maturation. This process is occurs by interaction between sperm and proteins that secreted by epithelial cells in the epididymis. Those proteins are encoded by epididymis specific genes, one of them is Serpina1f. However, many of those genes are not entirely well-characterized and need to be elaborated further. Serpina1f is one of the attractive genes to be characterized. It is regulated by androgen and has been proved by previous data obtained by microarray analysis.

This research was aimed to analyze gene structure of Serpina1f gene as a basis for more exploration regarding the function of this gene, and also to identify tissue distribution to determine whether Serpina1f gene is expressed only in epididymis, so that this gene is suitable to be developed as a target for non-hormonal male contraception.

This experiment was conducted from May 2012 to February 2013 in the Laboratory of Department of Biology Universitas Indonesia and it was performed by in-silico analysis and gene expression analysis. The result shows that Serpina1f gene is very dominant in initial segment in epididymis, thus suitable as a candidate for non-hormonal male contraception."