Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Kapang tanah adalah salah satu mikroorganisme yang dapat diisolasi dari tanah. Beberapa genus kapang tanah dapat menghasilkan senyawa antimikroba yang memiliki kemampuan menghambat pertumbuhan mikroba patogen. Penelitian ini dilakukan untuk menapis isolat kapang tanah yang memiliki aktivitas antimikroba terhadap mikroba uji Escherichia coli ATCC 25922, Salmonella typhimurium ATCC 14028, Streptococcus sp., dan Candida albicans. Metode yang digunakan adalah metode cross – streak dan metode cakram. Larutan uji yang digunakan pada uji cakram berasal dari isolat kapang tanah yang difermentasi dalam media cair Potato Dextrose Yeast. Hasil uji diperoleh 10 isolat kapang memiliki kemampuan menghambat pertumbuhan mikroba uji, yaitu BioMCC-F.001, BioMCC-F.006, BioMCC-F.018, BioMCC-F.027, BioMCC-F.029, BioMCC-F.050, BioMCC-F.051, BioMCC-F.055, BioMCC-F.082, dan BioMCC-F.086 dengan diameter daerah hambatan dari 8,34 – 19,27 mm. Diameter daerah hambatan terbesar diperoleh isolat BioMCC-F.006 dari genus Penicillium sebesar 19,27 mm terhadap Escherichia coli ATCC 25922. Isolat ini juga memiliki spektrum yang luas karena dapat menghambat pertumbuhan Escherichia coli.

---

Soil fungi is one of the microorganism which can be isolated from soil. Some of them can produce antimicrobial compounds which have ability to inhibit the growth of pathogen microbes. This research was done to screen soil fungi isolates which had antimicrobial activity againts Escherichia coli ATCC 25922, Salmonella typhimurium ATCC 14028, Streptococcus sp., and Candida albicans, using cross – streak method and disc method. The liquid extract for disc test was obtained from the fermentation using Potato Dextrose Yeast broth. Result showed that 10 isolates inhibit test microbes growth. They were BioMCC-F.001, BioMCC-F.006, BioMCC-F.018, BioMCC-F.027, BioMCC-F.029, BioMCC-F.050, BioMCC-F.051, BioMCC-F.055, BioMCC-F.082, and BioMCC-F.086, inhibition zone diameter were from 8,34 – 19,27 mm. The biggest inhibition zone (19,27 mm) toward Escherichia coli ATCC 25922 was obtained from BioMCC-F.006 isolate belonging to genus Penicillium. This isolate also has wide spectrum inhibition because it could inhibit the growth of Escherichia coli ATCC 25922, Salmonella typhimurium ATCC 14028, and Streptococcus sp."

"Abstrak Keunggulan enzim adalah spesifisitasnya pada suatu substrat. Salah satu enzim yang banyak dimanfaatkan adalah glukosa oksidase (GOD). GOD merupakan enzim yang bereaksi secara spesifik dalam mengkatalisis reaksi oksidasi b-D-glukosa menjadi senyawa D-glukonolakton dan hidrogen peroksida. Enzim ini banyak dihasilkan kapang dari genus Aspergillus dan Penicillium. Enzim dari genus Aspergillus umumnya intraseluler, sementara yang dari genus Penicillium umumnya ekstraseluler.Pada penelitian ini akan diisolasi GOD dari Penicillium notatum 727. Mula-mula dilakukan penentuan waktu inkubasi optimum dan pH media optimum untuk produksi enzim GOD. Selanjutnya, isolasi dilakukan pada waktu inkubasi optimum, yaitu 45 jam dan pH media optimum, yaitu 5,4. Dari hasil isolasi diperoleh ekstrak kasar enzim dengan aktivitas spesifik 0,2138 U/mg protein. Selanjutnya ekstrak enzim yang dihasilkan dimurnikan lebih lanjut. Langkah awal adalah dengan pengendapan secara terfraksi dengan (NH4)2SO4. Enzim dengan aktivitas spesifik paling tinggi diperoleh dari fraksi 60-80 % (NH4)2SO4 yaitu sebesar 2,0968 U/mg protein. Selanjutnya enzim dimurnikan lebih lanjut dengan dialisis. Dari hasil dialisis diperoleh enzim dengan aktivitas spesifik lebih tinggi yaitu 2,4909 U/mg protein. Enzim hasil dialisis kemudian ditentukan pH dan suhu optimum aktivitas katalitiknya. Diperoleh pH optimum enzim pada pH 6,0 dan temperatur optimum 40 ?C.Penentuan aktifitas enzim dilakukan dengan metode spektroskopi UV-Visibel yang dimodifikasi oleh Markwell et al dengan menggunakan benzokuinon. Metode ini didasari oleh prinsip reduksi enzimatis benzokuinon menjadi hidrokuinon yang diukur kenaikan absorbansinya pada 290 nm. Sedangkan penentuan kadar protein dilakukan dengan metode Lowry. Kata kunci: Penicillium notatum, enzim, glukosa oksidase, isolasi, purifikasi. xv + 55 ; tabel 4; gambar 7; lampiran 7 Bibliografi : 20 (1959-2004)"

"[Penicillium marneffei merupakan fungi patogen yang ditemukan di AsiaTenggara, khususnya Thailand. Penisiliosis dapat menyebabkan mikosis sistemiksehingga membahayakan nyawa penderita immunocompromised, khususnyapenderita HIV/AIDS. Antifungi seperti Fluconazole dan Ketoconazole, digunakanuntuk mengatasi infeksi P. marneffei. Akan tetapi, penggunaan antifungi secarajangka panjang dapat memicu kemungkinan munculnya mutan resisten P.marneffei. Resistensi pada fungi dapat dipengaruhi beberapa faktor, salah satunya,overekspresi transporter pengeluaran obat (drug efflux transporter). Mekanismepompa pengeluaran obat diatur oleh berbagai transporter. Transporter yang palingumum diketahui ialah transporter ABC (ATP-binding-cassette) dan MFS (MajorFacilitator Superfamily). Transporter ABC multidrug (MDR) pada P. marneffeitelah dipelajari dengan baik, sedangkan transporter MFS MDR pada fungitersebut, belum mendapatkan perhatian yang sama. Penelitian ini fokus pada satutransporter MFS MDR P. marneffei, yakni PMAA 067100, yang diekspresikanpada Saccharomyces cerevisiae ADΔ; sistem ekspresi yang sangat rentan terhadapberbagai macam antifungi. Pengamatan melalui mikroskop konfokal dan uji DiskDiffusion menunjukkan bahwa transporter PMAA 067100 terlokalisasi padamembran sel S. cerevisiae ADΔ dan resisten terhadap Fluconazole danTerbinafine.;Penicillium marneffei has been known as a pathogenic fungi which isfound in Southeast Asia, especially Thailand. The infection by this fungirecognized as Penicilliosis, that caused systemic mycosis, might be lethal inimmunocompromised patient, specifically HIV/AIDS patient. Antifungal such asFluconazole and Ketoconazole, had been used against P. marneffei infection.However, the long-term-use of antifungal might cause an emerging resistant strainof P. marneffei. The resistance phenomenon in fungi is caused by several factors,one of it is the overexpression of drug efflux transporter. Mechanism of this effluxpump is regulated by some of transporters such as ABC (ATP-binding-cassette)and MFS (Major Facilitator Superfamily) transporter. The ABC multidrug (MDR)transporter of P. marneffei has been studied well, yet the underrated MFS MDRtransporter of the same fungi has not received the same attention. This study focuson one of P. marneffei MFS MDR transporter, known as PMAA 067100, whichwas expressed in Saccharomyces cerevisiae ADΔ; an expression system which isvery susceptible to many kind of antifungal. Observation through confocalmicroscope and Disk Diffusion test showed that PMAA 067100 transporter waslocalized in S. cerevisiae ADΔ cell membrane and resistant against Fluconazoleand Terbinafine., Penicillium marneffei has been known as a pathogenic fungi which isfound in Southeast Asia, especially Thailand. The infection by this fungirecognized as Penicilliosis, that caused systemic mycosis, might be lethal inimmunocompromised patient, specifically HIV/AIDS patient. Antifungal such asFluconazole and Ketoconazole, had been used against P. marneffei infection.However, the long-term-use of antifungal might cause an emerging resistant strainof P. marneffei. The resistance phenomenon in fungi is caused by several factors,one of it is the overexpression of drug efflux transporter. Mechanism of this effluxpump is regulated by some of transporters such as ABC (ATP-binding-cassette)and MFS (Major Facilitator Superfamily) transporter. The ABC multidrug (MDR)transporter of P. marneffei has been studied well, yet the underrated MFS MDRtransporter of the same fungi has not received the same attention. This study focuson one of P. marneffei MFS MDR transporter, known as PMAA 067100, whichwas expressed in Saccharomyces cerevisiae ADΔ; an expression system which isvery susceptible to many kind of antifungal. Observation through confocalmicroscope and Disk Diffusion test showed that PMAA 067100 transporter waslocalized in S. cerevisiae ADΔ cell membrane and resistant against Fluconazoleand Terbinafine.]"

"Frukto-oligosakarida (FOS) merupakan suatu oligosakarida yang memiliki fungsi prebiotik dan dapat dimanfaatkan dalam bidang kesehatan. Penicillium notatum merupakan mikoorganisme jenis kapang yang diketahui memiliki kemampuan untuk mensintesis senyawa FOS. Dalam penelitian ini dilakukan fermentasi cair dengan menggunakan sukrosa 20% sebagai substrat dalam pembentukan FOS. Fermentasi dilakukan selama 7 hari. Selama fermentasi berlangsung jumlah sukrosa, fruktosa, glukosa, dan FOS diamati dan dianalisis dengan HPLC. Hasil analisis menunjukkan bahwa jumlah sukrosa menurun seiring berjalannya waktu diikuti dengan meningkatnya jumlah glukosa dan FOS. Jumlah optimum FOS, diperoleh pada waktu fermentasi antara 70-75 jam. Komponen dari FOS dianalisis dengan menghidrolisis FOS murni yang telah diisolasi. Hasil menunjukkan bahwa FOS terdiri dari glukosa dan fruktosa.

---

Frukto-oligosaccharides (FOS) is an oligosaccharide which has a function as prebiotic and can be used as health food. Penicillium notatum is fungi which is know to have the ability to synthesize FOS. In this study, liquid fermentation of 20% sucrose was used as substrate. Fermentation was carried out for 7 days. During the fermentation, the amount of sucrose, fructose, glucose, and FOS were observed by HPLC analysis.

The analysis showed that the concentration of sucrose reduced where as the concentration of glucose and FOS increased. The optimum amount of FOS was obtained between 70-75 hours. The component of FOS was analyzed by hydrolyzed from isolated FOS with 1M HCl. The results shows that FOS consist of glucose and fructose."

"ABSTRAKPenicillium chrysogenum diketahui menghasilkan metabolit sekunder yang bersifat antibiotik. Penelitian ini bertujuan untuk menguji aktivitas antibiotik dari strain P. chrysogenum hasil isolasi dan daun pisang terhadap beberapa kapang: Aspergillus clavatus UICC 153, A. fumisatus CBS 192.65, Geotnichum candidum UICC 255, dan Rhizonus microsrorus UICC 9; khamir: Candida albicans UICC Y-29, 1. tronicalis UICC Y-7, Pichia membrsnaefaciens UICC Y-5, Rhodotorula glutinis UICC Y-18, dan Saccharomyces cérevisiae UICC Y-3; serta bakteri: Aicali genes faecalis UICC B-5, Bacillus subtilib UICC B-il, Eschenichia coIl UICC B-15, Micrococcus luteus UICC B-25, Proteus vulganis UICC B-39, Serratis.marcescens UICC B-27, dan Starhylococcus aureus UICC B-28. Strain P. chrysogenum yang akan diuji ditumbuhkan pada PDB, tanpa pengocokan (30°C). uji aktivitss antibiotik dilakukan dengan 'cylinder assay method' s Aktivitas antibiotik diketahui dengan mengukur diameter zona bening yang terjadi.Penelitian membuktikan bahwa P. chrysogenum hasil isolasi daun pisang tidak mempunyai aktivitas antibiotik terhadap kapang dan khamir, kecuali terhadap semua jenis bakteni penguji. Besarnya aktivitas antibiotik P.chrysogenum tersebut tergantung dari jenis bakteri.ABSTRACT"

"Produksi penisilin secara alamiah dan biosintesis memerlukan seleksi galur mikroorganisme penghasil penisilin (Penicillium chrysogenum dan P. notatum) berdasarkan aktivitas antibiotiknya. Penelitian ini bertujuan membandingkan aktivitas antiobiotik galur P. chrysogenum ATCC 9480, CBS Engel, dan hasil isolasi dari daun pisang. Tiap-tiap galur yang diuji aktivitas antibiotiknya ditumbuhkan pada medium Potato Dextrose Broth, tanpa pengocokan, dengan suhu inkubasi 30 0C. Uji aktivitas antibiotik dilakukan dengan menggunakan ?cylinder assay method? terhadap bakteri penguji Bacillus subtilis UICC B-11, Escherichia coli UICC B-15, dan Staphylococcus aureus UICC B-28. Aktivitas antibiotik tiap-tiap galur P. chrysogenum diketahui dengan mengukur diameter zona bening yang terjadi dikurangi diameter terluar silinder kaca (8 mm). Dari hasil penelitian, disimpulkan bahwa aktivitas antibiotik galur P. chrysogenum ATCC 9480 dan hasil isolasi dari daun pisang lebih besar dari CBS Engel terhadap P. subtilis dan S. aureus, tetapi aktivitas antibiotik semua galur terhadap E. coli sama."

"Telah dilakukan penelitian untuk memperoleh, mengidentifikasi, dan menguji kemampuan kapang-kapang selulolitik dari empat manuskrip kuno kertas daluang asal Keraton Kasepuhan di Cirebon. Sebanyak 12 isolat kapang diperoleh dan dapat tumbuh pada potongan kertas daluang. Enam isolat kapang memiliki kemampuan selulolitik karena menghasilkan zona bening pada medium Czapek's Dox Agar (CDA) dengan penambahan Carboxymethyl Cellulose (CMC). Identifikasi secara konvensional menghasilkan genus Aspergillus (4 isolat), genus Eurotium (1 isolat), dan genus Penicillium (7 isolat). Jumlah isolat paling banyak diperoleh dari manuskrip kuno dengan kondisi paling buruk.

---

This research was to obtain, identify, and investigate cellulolytic fungi from four old manuscripts of daluang papers from Keraton Kasepuhan Cirebon. Twelve mould isolates were obtained and were able to grow on daluang paper. Six mould isolates were able to use Carboxymethyl Cellulose (CMC) as substrate which was indicated by clear zone formed on Czapek's Dox Agar (CDA) medium added with CMC. Conventional identification resulted in the genus Aspergillus (4 isolates), Eurotium (1 isolate), and Penicillium (7 isolates). Highest number of isolates was obtained from the old manuscript with the worst condition."

"[ABSTRAKIsolat Penicillium sp. ID10-T065 dimutasi menggunakan sinar Ultraviolet(UV), Etil Metil Sulfonat (EMS), dan kombinasi UV-EMS. Hasil mutasimenunjukkan bahwa aktivitas enzim β-glukosidase pada mutan lebih tinggidibandingkan wild-type (1,78 U/ml), kecuali pada mutan UM23. Mutan UV13mengalami peningkatan aktivitas β-glukosidase tertinggi (1,88 U/ml padaselobiosa 0,1% dan 5,53 U/ml pada selobiosa 1%), sedangkan mutan UM23menunjukkan aktivitas terendah (1,80 U/ml pada selobiosa 0,1% dan 1,75 U/mlpada selobiosa 1%). Aktivitas β-glukosidase pada mutan EM31 sebesar 1,86 U/mlpada selobiosa 0,1% dan 4,26 U/ml pada selobiosa 1%. Hasil analisis sekuen genβ-glukosidase 1 (bgl1) menunjukkan bahwa seluruh mutan mengalami mutasisubstitusi ketika dibandingkan dengan sekuen wild-type. Mutan UV13 mengalamiperubahan basa nukleotida paling banyak (7 basa) dibandingkan mutan EM31(5basa) dan UM23 (2 basa). Perubahan basa juga mengakibatkan gen mengalamimissense mutation sehingga terjadi kesalahan dalam penerjemahan kode asamamino, kecuali pada basa ke-2037 dari mutan UV13 dan basa ke-2034 serta 2037mutan EM31. Perubahan basa pada posisi tersebut tidak mengubah translasi asamamino (silent mutation). Hasil analisis sekuen gen bgl1 dan aktivitas enzimmenunjukkan bahwa sinar UV merupakan mutagen efektif untuk peningkatanaktivitas β-glukosidase pada isolat Penicillium sp. ID10-T065. Hasil identifikasisecara molekuler dan analisis pohon filogenetik, isolat Penicillium sp. ID10-T065memiliki kemiripan dan kekerabatan terdekat dengan spesies Penicilliumoxalicum.

---

ABSTRACTThe Penicillium sp. isolate ID10-T065 was mutated using Ultravioletirradiation (UV), Ethyl Methyl Sulfonate (EMS), and combination of UV -EMS.The results showed that β-glucosidase activity in the mutant was higher than thatof wild-type (1,78 U/ml), except for the mutant UM23. The β-glucosidase activityin mutant UV13 showed the highest activity (1,88 U/ml at cellobiose 0,1% and5,53 U/ml at cellobiose 1%), while mutant UM23 showed the lowest activity (1,80U/ml at cellobiose 0,1% and 1,75 U/ml at cellobiose 1%). The β-glucosidaseactivity of EM31 was 1,86 U/ml at cellobiose 0,1% and 4,26 U/ml at cellobiose1%. The results of the DNA sequence analysis of β-glucosidase 1 (bgl1) showedthat all mutants had substitution mutations when compared to the wild-typesequences. Mutant UV13 had the most base alteration (7 bases) compared to themutant EM31 (5 bases) and UM23 (2 bases). The bases alteration was leading tomissense mutation, except for the sequence of mutant UV13 at position 2037 andmutant EM31 at position 2034 and 2037. The base alteration of the sequence didnot change the amino acid translation (silent mutation). The results of the DNAsequences analysis of bgl1 and enzyme activities showed that UV light is aneffective mutagen to increase β-glucosidase activity in Penicillium sp. ID10-T065.The molecular identification and phylogenetic analysis showed that Penicilliumsp. ID10-T065 was closely related with Penicillium oxalicum., The Penicillium sp. isolate ID10-T065 was mutated using Ultravioletirradiation (UV), Ethyl Methyl Sulfonate (EMS), and combination of UV -EMS.The results showed that β-glucosidase activity in the mutant was higher than thatof wild-type (1,78 U/ml), except for the mutant UM23. The β-glucosidase activityin mutant UV13 showed the highest activity (1,88 U/ml at cellobiose 0,1% and5,53 U/ml at cellobiose 1%), while mutant UM23 showed the lowest activity (1,80U/ml at cellobiose 0,1% and 1,75 U/ml at cellobiose 1%). The β-glucosidaseactivity of EM31 was 1,86 U/ml at cellobiose 0,1% and 4,26 U/ml at cellobiose1%. The results of the DNA sequence analysis of β-glucosidase 1 (bgl1) showedthat all mutants had substitution mutations when compared to the wild-typesequences. Mutant UV13 had the most base alteration (7 bases) compared to themutant EM31 (5 bases) and UM23 (2 bases). The bases alteration was leading tomissense mutation, except for the sequence of mutant UV13 at position 2037 andmutant EM31 at position 2034 and 2037. The base alteration of the sequence didnot change the amino acid translation (silent mutation). The results of the DNAsequences analysis of bgl1 and enzyme activities showed that UV light is aneffective mutagen to increase β-glucosidase activity in Penicillium sp. ID10-T065.The molecular identification and phylogenetic analysis showed that Penicilliumsp. ID10-T065 was closely related with Penicillium oxalicum.]"

"Kapang menyebabkan deteriorasi pada manuskrip dluwang lama di Indonesia. Penelitian bertujuan untuk mengetahui kemampuan kapang asal manuskrip dluwang lama dari Cirebon (Keraton Kasepuhan dan Mertasinga) dalam menggunakan kertas merang sebagai substrat. Deskripsi empat strain kapang yang telah diidentifikasi secara molekuler pada penelitian sebelumnya, dikonfirmasi berdasarkan karakterisasi morfologi pada Potato Dextrose Agar (PDA) dan Malt Extract Agar (MEA). Biakan kapang dalam PDA miring di suhu 26,5 oC, umur 7 hari digunakan untuk pembuatan suspensi sel dalam akuades steril 5 ml. Tiga ml suspensi sel diinokulasikan ke dalam 27 ml Czapek Dox Broth (CDB) tanpa sumber karbon dengan penambahan kertas merang (diameter 5,2 cm) sebagai substrat, dan pada 27 ml CDB tanpa kertas merang sebagai kontrol, inkubasi di suhu ruang (28 oC), selama 30 hari. Hasil karakterisasi morfologi mengkonfirmasi empat strain kapang adalah Penicillium rubens Biourge UICC 1062, Aspergillus jensenii Jurjević, S.W. Peterson & B.W. Horn UICC 1069, Cladosporium colocasiae Sawada UICC 1071, dan Eurotium rubrum Jos. König, E. Spieckermann & W. Bremer UICC 1006. Semua kapang menggunakan kertas merang sebagai substrat untuk sumber karbon dan nutrien berdasarkan adanya pertumbuhan (hifa dan sporulasi), perubahan kondisi kertas (kertas menjadi robek, rapuh, adanya titik sporulasi berwarna kehijauan dan cokelat kehitaman), dan persentase pengurangan berat kering kertas (3,44--15,92%).

---

Moulds causes deterioration on old dluwang manuscripts in Indonesia. This study aims to determine the ability of moulds from the old dluwang manuscripts from Cirebon (Keraton Kasepuhan and Mertasinga) in using rice straw paper as a substrate. Four mould strains which were identified by molecular method in previous study, were described to confirm their species identities based on morphology characterisation on Potato Dextrose Agar (PDA) and Malt Extract Agar (MEA). Seven days-old mould cultures in PDA slants, at 26.5 oC, were used for cell suspensions in 5 ml sterile water. Three ml cell suspensions were inoculated into 27 ml Czapek Dox Broth (CDB) without a carbon source with the addition of rice straw paper (5.2 cm in diameter) as a substrate, and into 27 ml CDB without a carbon source and rice straw paper as a control, incubated at room temperature (28 oC), for 30 days. The results showed that description of four mould strains was confirmed as Penicillium rubens Biourge UICC 1062, Aspergillus jensenii Jurjević, S.W. Peterson & B.W. Horn UICC 1069, Cladosporium colocasiae Sawada UICC 1071, and Eurotium rubrum Jos. König, E. Spieckermann & W. Bremer UICC 1006. All mould strains were able to use rice straw paper as a substrate to obtain carbon source and nutrient for growth based on the presence of hyphae and sporulation, changes in paper conditions (tear, fragile, sporulation spots in light green and brownish-black) and percentage of paper dry weight loss (3.44--15.92%)."