Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 11 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Heru Suhartanto
Performance Analysis of Molecular Dynamics Simulation of PfENR Enzyme using AMBER on Cluster and GPU computing environment
" ABSTRACT
One of the processes requiring HPC environments is Molecular Dynamics ( MD ) . In tropical countries, the MD process is very important in the preparation of virtual screening experiments for anti-malaria search. Previous works on the virtual screening project for anti-malaria search conducted by WISDOM project uses grid infrastructure with 1,700 CPUs of various infrastructure provided in 15 countries [13]. In silico anti malaria compounds searching from Indonesian medical plants ... "
2014
MK-Pdf
Artikel Jurnal  Universitas Indonesia Library
cover
Heru Suhartanto
Using Dedicated and Non Dedicated HPC Cluster and GPU NVIDIA Tesla C2070 Cloud computing environment to simulate Molecular Dynamics of PfENR Enzyme with AMBER
" ABSTRACT
Molecular Dynamics (MD) is one of processes that requires High Performance Computing environments to complete its jobs. In the preparation of virtual screening experiments, MD is one of the important processes particularly for tropical countries in searching for anti-Malaria drugs. The search for anti-Malaria has previously conducted, for example by WISDOM project utilizing 1,700 CPUS. This computing infrastructure will be one of the limitation for country like Indonesia that also needs in silico anti malaria compounds searching from the country ... "
2015
MK-Pdf
Artikel Jurnal  Universitas Indonesia Library
cover
Heru Suhartanto
The performance of a molecular dynamics simulation for the plasmodium falciparum enoyl-acyl carrier-protein reductase enzyme using amber and gtx 780 and 970 double graphical processing units
" The invention of graphical processing units (GPUs) has significantly improved the speed of long processes used in molecular dynamics (MD) to search for drug candidates to treat diseases, such as malaria. Previous work using a single GTX GPU showed considerable improvement compared to GPUs run in a cluster environment. In the current work, AMBER and dual GTX 780 and 970 GPUs were used to run an MD simulation on the Plasmodium falciparum enoyl-acyl carrier protein ... "
Depok: Faculty of Engineering, Universitas Indonesia, 2018
UI-IJTECH 9:1 (2018)
Artikel Jurnal  Universitas Indonesia Library
cover
Sandra Hermanto
Sintesis, karakterisasi dan studi in silico radioimunokonjugat 177lu-dota-f ab 2 trastuzumab sebagai agen teranostik kanker payudara = Synthesis characterization and in silico study of radioimmunoconjugate 177lu dota f ab 2 trastuzumab as theranostic agent of breast cancer
" Penggunaan radioimunokonjugat berbasis antibodi trastuzumab sebagai agen teranostik kanker payudara positif HER2 masih kurang ideal karena ukuran molekul yang relatif besar sehingga laju biodistribusi dan laju clearance relatif lambat dan mengakibatkan akumulasi dalam jaringan normal hati/ginjal dan darah. Berdasarkan fakta ini, fragmentasi trastuzumab menjadi F ab 39; 2 dan penandaan fragmen oleh radionuklida Lutetium-177 pemancar partikel ? dan ? telah dilakukan. Penyiapan fragmen F ab rsquo; 2 dilakukan melalui fragmentasi enzimatik oleh pepsin dan fraksinasi ... "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2016
D1700
UI - Disertasi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Agus Limanto
Analisis in silico mutasi hemaglutinin, neuraminidase, dan matrix-matrix virus H5N1 indonesia terkait dengan tingkat patogenitasnya yang tinggi
" Pada tahun 2007, terjadi waban avian influenza di Indonesia yang menyebabkan tingkat kematian nampir 85%. Melinat tingginya tingkat kematian yang terjadi di Indonesia dibandingkan dengan negara Iainnya yang mengalami waban avian influenza, WHO kemudian mengumumkan banwa virus HPAI H5N1 Indonesia memiliki tingkat patogenisitas tertinggi. Hal ini menjelaskan banwa mutasi yang terjadi baik berupa antigenic drift maupun antigenic shift dapat mempengaruhi tingkat patogenisitas dari virus influenza. Studi dilakukan terhadap hemagglutinin (HA), neuraminidase (NA), dan matrix2 (M2) karena ketiga protein ini mempunyai peranan penting ... "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2009
S30461
UI - Skripsi Open  Universitas Indonesia Library
cover
Katarina Tetra Wuriyani
Perancangan peptida siklis disulfida sebagai inhibitor potensial enzim NS3-NS2B protease virus dengue melalui molecular docking
" Penyakit demam berdarah dengue merupakan penyakit yang telah menjadi endemik di lebih dari 100 negara, dengan lebih dari 2,5 miliar orang dalam kondisi beresiko untuk terjangkit penyakit ini secara epidemik. Hingga saat ini belum tersedia vaksin atau pengobatan yang efektif. Pada penelitian ini dilakukan studi in silico untuk merancang ligan peptida siklis disulfida yang dapat berperan sebagai inhibitor potensial untuk enzim NS3-NS2B protease virus dengue sehingga diharapkan dapat menghambat replikasi virus tersebut dalam tubuh. Struktur ... "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2009
S30504
UI - Skripsi Open  Universitas Indonesia Library
cover
Ihsan Ahmad Zulkarnain
Optimasi struktur material adsorben karbon nanostruktur sebagai media penyimpanan hidrogen : studi termodinamika molekuler = Optimizing structure of nanostructured carbon adsorbent material as hydrogen storage medium molecular thermodynamics study
" Potensi gas hidrogen untuk diimplementasikan sebagai pembawa energi tanpa emisi sangat menjanjikan. Namun ada beberapa kendala yang harus dihadapi dalam pengimplementasiannya, yakni pengembangan teknologi penyimpanan gas hidrogen. Penyimpanan gas hidrogen dalam suatu adsorben karbon nanostruktur seperti carbon nanotube menjadi salah satu pilihan untuk dapat meningkatkan kapasitas penyimpanannya. Namun, banyaknya penelitian eksperimen yang tidak memberikan hasil yang reproducible menyebabkan perlunya ada pengembangan penelitian teoritis adsorpsi gas hidrogen dengan pendekatan termodinamika molekuler. Dengan kalkulasi struktur elektronik ab ... "
Depok: Fakultas Teknik Universitas Indonesia, 2014
T42544
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Abdul Jabbar
Simulasi dinamika molekuler adsorpsi hidrogen pada Carbon Nanotube dengan variasi temperatur
" Krisis energi merupakan salah satu permasalahan serius yang dihadapi saat ini. Kebutuhan akan sumber energi yang dapat diperbaharui dan bebas dari polusi menjadikan hidrogen sebagai salah satu sumber energi alternatif yang sangat berpotensi untuk dikembangkan. Namun, dalam penggunaan hidrogen sebagai sumber energi masih menemui kendala dalam proses penyimpanannya. Yakni, membutuhkan tangki bertekanan tinggi atau disimpan dalam keadaan dicairkan hingga suhu cryogenik. Salah satu cara mengatasi kendala tersebut adalah dengan sistem adsorpsi. Carbon Nanotube (CNT) merupakan ... "
Depok: Fakultas Teknik Universitas Indonesia, 2012
S1754
UI - Skripsi Open  Universitas Indonesia Library
cover
Erwin Prasetya Toepak
Perancangan antiviral berbasis penautan fragmen secara in silico sebagai inhibitor enzim alpha glukosidase i untuk terapi infeksi virus dengue = Fragment linking based antiviral design through in silico approach as alpha glucosidase i inhibitor for dengue virus infection therapy
" ABSTRAK
Deman dengue merupakan penyakit viral pada manusia yang disebabkan oleh infeksi virus dengue DENV . Infeksi ini pada beberapa orang juga dapat berkembang ke fase demam yang lebih akut yakni pada fase dengue hemorrhagic fever DHF dan dengue shock syndrome. DHF dan DSS dilaporkan menyebabkan 2,5 kematian dari 500.000 kasus klinis yang telah diketahi. Pengembangan antiviral untuk infeksi DENV seringkali mengalami kendala. Hal ini disebabkan karena DENV memiliki lebih dari satu jenis serotipe. Pengembangan sebuah ... "
2017
T48358
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Muhamad Fikri Ihsan
Simulasi dinamika molekuler beberapa senyawa terpilih dari pangkalan data herbal Indonesia hasil penambatan molekuler terhadap enzim DNA metiltransferase (DNMT) = Molecular dynamic simulations of several selected compounds from herbal database Indonesia results of molecular docking against DNA methyltransferase (DNMT) enzyme
" Kanker merupakan penyebab kematian utama di seluruh dunia. Salah satu faktor terjadinya kanker adalah modifikasi epigenetik yang abnormal (hipermetilasi). Hipermetilasi yang terjadi pada gen diyakini bahwa yang berperan besar dalam proses karsinogenesis adalah enzim DNA metiltransferase (DNMT). Penelitian-penelitian yang dilakukan saat ini untuk menemukan senyawa inhibitor DNMT dari bahan alam. Salah satu metode yang mendukung untuk analisis ini adalah metode in silico. Dalam penelitian ini, diteliti beberapa senyawa pilihan dari basis data herbal Indonesia hasil ... "
Depok: Fakultas Farmasi Universitas Indonesia, 2017
S66313
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
<<   1 2   >>