Ditemukan 3 dokumen yang sesuai dengan query
Gianinna Ardaneswari
"
Dalam bioinformatika penelusuran basis data sekuens digunakan untuk mencari kemiripan antara sebuah sekuens dengan sekuens lainnya pada suatu basis data sekuens Salah satu algoritma untuk menghitung skor kemiripan yang optimal adalah algoritma Smith Waterman yang menggunakan pemrograman dinamik Algoritma ini memiliki kompleksitas waktu kuadratik yaitu O n2 sehingga untuk data yang berukuran besar membutuhkan waktu komputasi yang lama Komputasi paralel diperlukan dalam penelusuran basis data sekuens ini agar waktu yang dibutuhkan lebih cepat dan memiliki ...
"
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2013
S52395
UI - Skripsi Membership Universitas Indonesia Library
Dion Ogi
"
Perkembangan teknologi prosesor seperti multicore menjadi bagian dari pengembangan HPC. Pengujian terhadap algoritma paralel dengan MPICH2 dan Cilk++ menggunakan variabel jumlah proses dan core diharapkan dapat menunjukkan perbedaan kinerja (waktu proses) yang signifikan.
Analisis yang dilakukan pada hasil eksperimen menunjukkan implementasi algoritma paralel dengan MPICH2 memberikan speed-up hingga 5,987 pada perkalian matriks dan 4,175 pada pengurutan data (sorting) serta efisiensi hingga 0,967 dan 0,721 pada masing-masing aplikasi.
Sedangkan implementasi algoritma paralel dengan Cilk++ memberikan speed-up relatif hingga ...
"
Depok: Fakultas Teknik Universitas Indonesia, 2010
T 27918
UI - Tesis Open Universitas Indonesia Library
Dion Ogi
2010
T40944
UI - Tesis Open Universitas Indonesia Library