Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"SARS-CoV-2 merupakan virus RNA envelop dengan rantai untai tunggal positif yang menyebabkan COVID-19. Sejak awal teridentifikasi, SARS-CoV-2 menyebar secara luas dan cepat di seluruh dunia, sehingga WHO pada 11 Maret 2020 menyatakan COVID-19 sebagai suatu pandemi. SARS-CoV-2 mampu menginfeksi sel inang melalui proses pengikatan spike glikoprotein terhadap ACE2. Hingga saat ini, metode deteksi RT-PCR menjadi metode terbaik dalam deteksi COVID-19, namun penggunaannya dibatasi oleh reagen dan instrumentasi yang mahal. Oleh karena itu metode alternatif deteksi COVID-19 dapat menjadi solusi, salah satunya adalah sensor elektrokimia. Umifenovir (arbidol) merupakan senyawa elektroaktif yang dapat berinteraksi dengan spike glikoprotein SARS-CoV-2. Simulasi penambatan molekul menggunakan Molecular Operating Environment (MOE) memprediksi interaksi umifenovir-spike glikoprotein S2 SARS-CoV-2 terjadi secara optimum pada pH 7.4 dan temperatur 300K dengan △G binding -7.8414 kcal mol-1. Interaksi dimediasi oleh residu asam amino asam glutamat (Glu780) pada chain A. Uji interferensi menunjukkan kompleks umifenovir-HA H1N1 memberikan nilai △G binding -7.5822 kcal mol-1, namun tidak cukup kompetitif untuk mengganggu kompleks umifenovir-spike glikoprotein S2 SARS-CoV-2. Hasil studi komputasi kemudian menjadi acuan dalam pengukuran elektrokimia. Pada penelitian ini, perilaku elektrokimia umifenovir dipelajari menggunakan elektroda carbon foam (CF) yang dipreparasi secara hidrotermal-karbonisasi dan dikarakterisasi menggunakan instrumentasi XRD, FTIR, Raman, dan SEM-EDS. Elektroda carbon foam memiliki struktur berpori 3D dengan luas permukaan besar yang menyediakan situs reaksi reduksi-oksidasi bagi umifenovir. Melalui teknik cyclic voltammetry (CV) dan amperometri, ditemukan bahwa keberadaan spike glikoprotein S2 SARS-COV-2 menyebabkan penurunan respon arus umifenovir dengan waktu kontak optimum yaitu 5 menit. Pada konsentrasi yang sama, HA H1N1 dan spike glikoprotein S2 SARS-CoV-2 menyebabkan munculnya efek gabungan yang menurunkan respon arus umifenovir secara signifikan. Hasil tersebut mengindikasikan sensor elektrokimia umifenovir bersifat kurang selektif terhadap senyawa interferensi.

---

SARS-CoV-2 is a positive single-stranded RNA envelope virus that causes COVID-19. Since its initial identification, SARS-CoV-2 has spread widely and rapidly throughout the world, so the WHO on March 11, 2020 declared COVID-19 as a pandemic. SARS-CoV-2 is able to infect host cells through the binding process of spike glycoprotein to ACE2. Until now, the RT-PCR detection method has been the best method for detecting COVID-19, but its use is limited by expensive reagents and instrumentation. Therefore, an alternative method of detecting COVID-19 can be a solution, one of which is an electrochemical sensor. Umifenovir (arbidol) is an electroactive compound that can interact with the SARS-CoV-2 spike glycoprotein. Molecular docking simulation using Molecular Operating Environment (MOE) predicts the umifenovir-spike glycoprotein S2 SARS-CoV-2 interaction will occur optimally at pH 7.4 and temperature 300K with △G binding -7.8414 kcal mol-1. The interaction is mediated by the amino acid residue of glutamic acid (Glu780) in chain A. The interference test showed the umifenovir-HA H1N1 complex gave △G binding value of -7.5822 kcal mol-1, but was not competitive enough to interfere with the umifenovir-spike glycoprotein S2 complex of SARS-CoV. -2. The results of computational studies then become a reference in electrochemical measurements. In this study, the electrochemical behavior of umifenovir was studied using carbon foam (CF) electrodes prepared by hydrothermal carbonization and characterized using XRD, FTIR, Raman, and SEM-EDS instrumentation. The carbon foam electrode has a 3D porous structure with a large surface area that provides an oxidation-reduction reaction site for umifenovir. Through cyclic voltammetry (CV) and amperometry techniques, it was found that the presence of the SARS-COV-2 spike glycoprotein S2 caused a decrease in the current response of umifenovir with an optimum contact time of 5 minutes. At the same concentration, HA H1N1 and spike glycoprotein S2 SARS-CoV-2 caused a combined effect that significantly decreased the current response of umifenovir. These results indicate that the umifenovir electrochemical sensor is less selective for interfering compounds."

"SARS-CoV-2 merupakan virus RNA penyebab COVID-19 yang telah menjadi pandemi dunia selama dua tahun terakhir. Hingga saat ini, metode deteksi RT-PCR menjadi metode terbaik dalam deteksi COVID-19. Namun mahalnya biaya reagen dan instrumentasi menyebabkan diperlukannya metode lain yang lebih murah dan praktis. Sementara itu Umifenovir (arbidol) merupakan senyawa elektroaktif yang dapat berinteraksi dengan spike glikoprotein SARS-CoV-2. Pada penelitian ini interaksi umifenovir dan glikoprotein S2 dipelajari dengan studi elektrokimia di permukaan elektroda boron-doped diamond (BDD). Sebelum dilakukan studi elektrokimia, dilakukan studi penambatan molekul dengan Homology Modelling dan Molecular Docking menggunakan umifenovir. Studi interaksi umivenofir terhadap glikoprotein S2 SARS CoV-2 menghasilkan affinity binding sebesar -6,1 kcal/mol. Sedangkan studi elektrokimia umifenovir menggunakan elektroda BDD pada rentang potensial dari (-0,8 V) hingga (+0,8 V) dan scan rate 50 mV/s menunjukkan korelasi linear pada rentang konsentrasi 10- 100 μM. Selanjutnya deteksi spike glikoprotein S2 SARS CoV-2 menggunakan kondisi optimum dengan 100 μM umifenovir dan 0,0025 μg/mL spike glikoprotein melalui perbandingan 20:1 menunjukkan nilai limit deteksi (LoD) dan limit kuantifikasi (LoQ) berturut-turut sebesar 0,001497 μg/mL dan 0,004991 μg/mL. Hasil studi menunjukkan bahwa ode deteksi yang dikembangkan dengan elektroda BDD dapat digunakan untuk sampel klinis SARS-CoV-2.

---

SARS-CoV-2 is RNA virus causing Covid-19 which has become the global pandemic in the last two years. To date, RT-PCR is the best method for Covid-19 detection. However, the costly chemical reagents and instruments for this method suggesting another cheaper and practical method is necessary. Meanwhile, umifenovir (arbidol) is an electroactive compound which can interact with the SARS-CoV-2 glicoprotein spike. In this research, umifenovir interaction with glicoprotein S2 is investigated through the electrochemical study on the electrode surface of boron-doped diamond (BDD). Prior to the electrochemical study, computational study using Homology Modelling dan Molecular Docking was performed for umifenovir. Affinity binding of -6.1 kcal/mol was obtained from the umivenofir against glicoprotein S2 SARS CoV-2. On the other hand, the electrochemical study on umifenovir using BDD electrode in the potential range of -0.8 V to +0.8 Vand scan rate of 50 mV/s shows a linear correltaion in the concentration range of 10-100 μM. Moreover, the detection of S2 SARS CoV-2 glicoprotein spike using the optimum condition of 100 μM umifenovir and 0.0025 μg/mL glicoprotein spike with 20:1 ratio shows the limit of detection (LoD) and limit of quantification (LoQ) are 0.001497 μg/mL and 0.004991 μg/mL, respectively. The results of this study reveal that the detection method developed with BDD electorde can be applied for the real samples of SARS-CoV-2."