Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 2 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Novrina Ariij Aisyti
Studi Komparatif dan Permodelan In Silico Senyawa Propolis Tetragonula biroi aff. Sulawesi sebagai Inhibitor ALK, HER2, dan BTK dalam Target Terapi Kanker = Comparative Study and In Silico Modelling of Sulawesi Tetragonula biroi aff. Propolis Compounds as ALK, HER2, and BTK Inhibitors in Cancer Targeted Therapy
"Salah satu perkembangan menarik dalam pengobatan kanker adalah target terapi kanker, yaitu pemberian obat yang ditargetkan secara molekuler untuk menginhibisi protein onkogenik tirosin kinase. Tirosin kinase adalah enzim kinase yang berperan dalam proses seluler seperti pertumbuhan, diferensiasi, migrasi, dan apoptosis sebuah sel. Mutasi atau ekspresi berlebih dari tirosin kinase dapat mengakibatkan perubahan fungsi seluler tirosin kinase yang memicu pembentukan sel tumor dan kanker, sehingga inhibisi dari protein tersebut dapat memperlambat proliferasi dan angiogenesis dari sel kanker. Pada penelitian ini, permodelan secara in silico digunakan untuk mengetahui aktivitas inhibisi senyawa propolis yang berasal dari lebah tak bersengat Tetragonula biroi aff. Indonesia pada target protein tirosin kinase penyebab non-small cell lung cancer (NSCLC), kanker payudara, dan leukemia myeloid. 18 senyawa uji propolis yang memiliki potensi antikanker diujikan sebagai inhibitor untuk menghambat aktivitas protein Anaplastic Lymphoma Kinase (ALK), Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 (HER2), dan Brutons Tyrosine Kinase (BTK) penyebab NSCLC, kanker payudara, dan leukemia myeloid secara berturut-turut. Penambatan dikomputasikan menggunakan AutoDock Vina®, dengan LigPlot+ dan PyMOL untuk memvisualisasikan interaksi molekuler antara kompleks inhibitor-protein yang dihasilkan. Hasil menunjukkan bahwa kurarinon adalah inhibitor yang paling kuat terhadap ALK dengan skor -8,8 kkal/mol, yang berinteraksi dengan Met1199 sebagai residu utama untuk menghambat ALK. Sementara itu macarangin memiliki skor penambatan tertinggi untuk target HER2 dengan nilai sebesar -11,3 kkal/mol, dan Derrubone sebagai inhibitor paling kuat untuk BTK dengan skor -9,4 kkal/mol. Maka dari itu, studi ini menunjukkan bahwa kurarinon berpotensi untuk menjadi inhibitor ALK, dengan macarangin berpotensi sebagai inhibitor HER2, dan derrubone berpotensi untuk menjadi inhibitor BTK sehingga ketiga senyawa tersebut dapat diteliti dan dievaluasi lebih lanjut untuk studi in-vitro dan in-vivo sebagai novel inhibitor ALK, HER2, dan BTK.

 

One of the interesting developments in cancer treatment is the use of cancer targeted therapy, a molecular targeted drugs that are given to inhibit the oncogenic protein of tyrosine kinases. The tyrosine kinases is a group of kinase enzyme that plays a role in cellular processes such as cell growth, differentiation, migration, and apoptosis. Mutation or overexpression of tyrosine kinases can result in disruption of tyrosine kinase cellular function which triggers the formation of tumor and cancerous cells, where the inhibition of these proteins can slow down the proliferation and angiogenesis of cancer cells. In this study, in-silico modeling was used to determine the inhibitory activity of propolis compounds derived from Indonesian Tetragonula biroi aff. targeting tyrosine kinase protein that causes non-small cell lung cancer (NSCLC), breast cancer, and myeloid leukemia. 18 propolis compounds that have anticancer potential are tested as inhibitors to block the activity of Anaplastic Lymphoma Kinase (ALK), Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 (HER2), and Bruton's Tyrosine Kinase (BTK) protein that causes NSCLC, breast cancer, and myeloid leukemia respectively. Docking was computed using AutoDock Vina®, with LigPlot+ and PyMOL to visualize molecular interactions between the resulting inhibitor-protein complex. The result show that kurarinone is the most potent inhibitor towards ALK with a score -8,8 kcal/mol, interacting with Met1199 as a key residues for inhibiting ALK. Meanwhile macarangin has the highest docking score for HER2 target resulting in -11,3 kcal/mol, and derrubone as the most potent inhibitor for BTK with a score of -9,4 kcal/mol. This study suggest that kurarinone has the potential as ALK inhibitor, with macarangin has the potential to inhibit HER2, and derrubone has the potential as BTK inhibitor so that the three compounds can be further investigated and evaluated for in-vitro and in-vivo studies as novel ALK, HER2, and BTK inhibitors.

"

Depok: Fakultas Teknik Universitas Indonesia, 2020
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Lany Nurhayati
Bioaugmentasi tanah sawah tercemar heptaklor oleh bakteri tempatan dan biochar tempurung kelapa = Bioaugmentation of heptachlor in paddy field by indigenous bacteria and biochar coconut shell
"ABSTRAK
Undang-undang RI No. 19 tahun 2009, pengesahan konvensi Stockholm tentang bahan pencemar organik yang persisten, dan telah melarang penggunaan kategori insektisida yaitu aldrin, klordan, dieldrin, endrin, heptaklor, heksaklorobenzena, mirex, toxaphene dan poliklorinatbifenil (PCB), serta membatasi penggunaan insektisida diklorodifenildikloroetana (DDT). Faktanya, keberadaan insektisida organoklorin tersebut masih ditemukan di tanah sawah Kabupaten Karawang yaitu aldrin, DDT, endosulfan, endrin, heptaklor dan lindan dengan konsentrasi berkisar antara 1,5 ng/g sampai dengan 5,37 ng/g. Teknologi pengendalian residu pestisida dapat dilakukan melalui ameliorasi secara biologi dengan bioremediasi, secara fisika dengan adsorpsi arang aktif, sedangkan, secara kimia melalui penambahan alum dan lain-lain. Bioaugmentasi adalah introduksi mikroba tertentu pada daerah yang akan diremediasi. Bakteri tempatan potensial pendegradasi heptaklor hasil isolasi adalah Citrobacter sp. Setelah diidentifikasi dengan 16S rRNA, bakteri tersebut adalah Raoultella ornithinolytica B4, bakteri ini golongan Enterobacteriaceae, Gram negatif, dan menghasilkan enzim katalase. Biochar tempurung kelapa (BTK) memiliki sifat adsorben berdasarkan nilai daya serap iod sebesar 570,22 mg/g, luas permukaannya 371,943 m2/g, dan diameter pori 0,4-7,0 mm karena proses karbonasi 300 oC menghasilkan ukuran makropori. Hasil uji adsorpsi BTK 5% (b/b) terhadap heptaklor 2 mg/L secara adsorpsi fisik, terlihat dari persamaan Langmuir memiliki linearitas y=1,704x ? 0,002, kapasitas adsorpsinya 1,704 mg/g, dengan efisiensi adsorpsinya sebesar 75,01%. Proses bioaugmentasi tanah sawah tercemar heptaklor oleh bakteri tempatan Raoultella ornithinolytica B4 dengan bantuan BTK 5%, menghasilkan degradasi heptaklor (Rt 11,31 menit) menjadi 1-hidroksiklordene (Rt 12,38 menit), dengan nilai efisiensi remediasi sebesar 75,38%.
ABSTRACT
The regulation of Republic of Indonesia No. 19 in 2009, about the ratification of the Stockholm Convention on Persistent Organic Pollutans (POPs), that bann the use of insecticides category, namely aldrin, chlordane, dieldrin, endrin, heptachlor, hexachlorobenzene, mirex, toxaphene and polychlorinated biphenyls (PCB), and as well as the restriction use of insecticide dichlorodiphenyldichloroethane (DDT). In fact, the presence of insecticides organochlorine are still found on paddy filed, from nine villages and sub-districts in Karawang contained seven types, they are aldrin, DDT, endosulfan, endrin, heptachlor and lindane concentrations in the district ranges from 0.3 ng/g in up to 5.37 ng/g. Bioaugmentation is the applications of indigenous or allochthonous wide type or genetically modified microorganisms to hazardous waste polluted sites in order to accelerate the removal of undesired compounds. Indigenous Bacteria that is potential to degrade heptachlor is obtained from the isolation of Citrobacter sp and finally identified by 16S rRNA identification technique, that this bacteria is Raoultella ornithinolytica B4 which is classified as a group of bacteria of Enterobacteriaceae, as a Gram-negative, and produce the enzyme catalase. Biochar coconut shell (BCS) as adsorbent was tested for its quality by SNI-06-3730-1995 method. It has a water content of 11.88% (w/w), ash content of 3.32%, an easily evaporated substance content of 13.61%, bounded carbon to 71.20%, and iod number of 570.22 mg/g. The adsorption result of BCS 5% (w/w) to heptachlor was 2 mg/L which was fit with physical adsorption of Langmuir equation with adsorption linearity y = 1,704x - 0,002, adsorption capacity of 1.704 mg / g, so BCS can adsorb heptachlor well. Bioaugmentation using single strain of R. ornithinolytica B4 successful for removal of heptachlor with efficiency was observed in 35 days incubation was 75.38%, and heptachlor (11,31 minute) degraded to 1-hydroxychlordene (12,38 minute).
"
2016
D2256
UI - Disertasi Membership  Universitas Indonesia Library