Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Chronic pulmonary aspergillosis (CPA) merupakan penyakit infeksi akibat Aspergillus spp. yang banyak ditemukan pada penderita pasca tuberkulosis paru (TB paru). Identifikasi Aspergillus tingkat spesies dibutuhkan untuk keperluan diagnosis dan perencanaan pengobatan. Gen β-tubulin (benA) direkomendasikan sebagai DNA barcode dalam identifikasi Aspergillus spp. Penelitian ini bertujuan untuk menguji β-tubulin sebagai DNA barcode dan untuk mengonfirmasi identifikasi molekuler Aspergillus spp. menggunakan gen β-tubulin sebagai kandidat penegak diagnosis CPA dari sampel sputum TB paru. Penelitian dilakukan dengan mengamplifikasi sekuens β-tubulin dari 31 isolat Aspergillus spp. yang telah diamati secara morfologi lalu dilakukan pencocokan sekuens hasil sekuensing dengan pangkalan data NCBI. Multiple alignment dilakukan untuk melihat variasi sekuens dan Needle pairwise alignment dilakukan untuk mengetahui kemiripan antarsekuens. Hasil menunjukkan terdapat isolat Aspergillus spp. teridentifikasi sesuai dengan pengamatan morfologi (n=17), spesies berbeda (n= 12), dan fungi bukan Aspergillus (n=2). Aspergillus fumigatus, A. flavus, A. tamarii, A. niger, A. tubingensis, A. welwitschiae, dan A. brunneoviolaceus berhasil teridentifikasi. Gen β-tubulin memiliki variasi intraspesifik rendah dan interspesifik tinggi sehingga dapat digunakan dalam mengidentifikasi Aspergillus spp. serta berpotensi menjadi kandidat diagnosis CPA.

---

Chronic pulmonary aspergillosis (CPA) is an infectious disease caused Aspergillus spp. that is often found in post-pulmonary tuberculosis (PTB) patients. Species-level identification of Aspergillus spp. is required for diagnosis and treatment planning purposes. The β-tubulin (benA) gene is recommended as a DNA barcode in identifying Aspergillus. This study aims to test β-tubulin as DNA barcode and to confirm Aspergillus spp. identification using β-tubulin as CPA diagnosis candidate from pulmonary TB sputum samples. The study was conducted by amplifying β-tubulin sequences from 31 samples of Aspergillus spp. which have been morphologically identified then proceed to compare sequencing result with NCBI database. Multiple alignment is performed to see sequence variations and Needle pairwise alignment is perfomed to determine sequences similarity. Results show the presence of Aspergillus spp. isolates that correspond to morphological observations (n=17), different species (n=12), and non-Aspergillus fungi (n=2). Aspergillus fumigatus, A. flavus, A. tamarii, A. niger, A. tubingensis, A. welwitschiae, and A. brunneoviolaceus were successfully identified. The β-tubulin gene shows low intraspecific and high interspecific variations that is useful for Aspergillus spp. identification and is a potential candidate for CPA diagnosis."