Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Chronic pulmonary aspergillosis (CPA) merupakan penyakit infeksi akibat Aspergillus spp. yang banyak ditemukan pada penderita pasca tuberkulosis paru (TB paru). Identifikasi Aspergillus tingkat spesies dibutuhkan untuk keperluan diagnosis dan perencanaan pengobatan. Gen β-tubulin (benA) direkomendasikan sebagai DNA barcode dalam identifikasi Aspergillus spp. Penelitian ini bertujuan untuk menguji β-tubulin sebagai DNA barcode dan untuk mengonfirmasi identifikasi molekuler Aspergillus spp. menggunakan gen β-tubulin sebagai kandidat penegak diagnosis CPA dari sampel sputum TB paru. Penelitian dilakukan dengan mengamplifikasi sekuens β-tubulin dari 31 isolat Aspergillus spp. yang telah diamati secara morfologi lalu dilakukan pencocokan sekuens hasil sekuensing dengan pangkalan data NCBI. Multiple alignment dilakukan untuk melihat variasi sekuens dan Needle pairwise alignment dilakukan untuk mengetahui kemiripan antarsekuens. Hasil menunjukkan terdapat isolat Aspergillus spp. teridentifikasi sesuai dengan pengamatan morfologi (n=17), spesies berbeda (n= 12), dan fungi bukan Aspergillus (n=2). Aspergillus fumigatus, A. flavus, A. tamarii, A. niger, A. tubingensis, A. welwitschiae, dan A. brunneoviolaceus berhasil teridentifikasi. Gen β-tubulin memiliki variasi intraspesifik rendah dan interspesifik tinggi sehingga dapat digunakan dalam mengidentifikasi Aspergillus spp. serta berpotensi menjadi kandidat diagnosis CPA.

---

Chronic pulmonary aspergillosis (CPA) is an infectious disease caused Aspergillus spp. that is often found in post-pulmonary tuberculosis (PTB) patients. Species-level identification of Aspergillus spp. is required for diagnosis and treatment planning purposes. The β-tubulin (benA) gene is recommended as a DNA barcode in identifying Aspergillus. This study aims to test β-tubulin as DNA barcode and to confirm Aspergillus spp. identification using β-tubulin as CPA diagnosis candidate from pulmonary TB sputum samples. The study was conducted by amplifying β-tubulin sequences from 31 samples of Aspergillus spp. which have been morphologically identified then proceed to compare sequencing result with NCBI database. Multiple alignment is performed to see sequence variations and Needle pairwise alignment is perfomed to determine sequences similarity. Results show the presence of Aspergillus spp. isolates that correspond to morphological observations (n=17), different species (n=12), and non-Aspergillus fungi (n=2). Aspergillus fumigatus, A. flavus, A. tamarii, A. niger, A. tubingensis, A. welwitschiae, and A. brunneoviolaceus were successfully identified. The β-tubulin gene shows low intraspecific and high interspecific variations that is useful for Aspergillus spp. identification and is a potential candidate for CPA diagnosis."

"Hubungan infeksi fungi pada penderita asma ditemukan pada sekitar satu per tiga kasus asma. Spesies yang paling umum menyerang saluran pernapasan adalah Aspergillus fumigatus, diikuti oleh A. flavus, A. niger, dan A. terreus. Metode identifikasi yang dapat dilakukan adalah identifikasi molekuler, namun, standar identifikasi fungi pada sampel klinis belum ditetapkan. Gen calmodulin (CaM) direkomendasikan sebagai barcode untuk identifikasi fungi pada genus Aspergillus karena kemampuan membedakan antarspesies yang tinggi. Pada penelitian ini, kemampuan CaM sebagai DNA barcode Aspergillus spp. dan kandidat diagnosis molekuler aspergillosis dianalisis dengan melakukan identifikasi spesies dan analisis variasi sekuens CaM pada isolat klinis asma. Metode yang dilakukan adalah kultur isolat menggunakan sabouraud dextrose agar (SDA) dan sabouraud dextrose broth (SDB), ekstraksi DNA menggunakan phenol chloroform isoamyl alcohol (PCI), amplifikasi CaM, visualisasi menggunakan elektroforesis, sekuensing, dan analisis sekuens. Hasil penelitian menunjukkan bahwa CaM dapat mengidentifikasi 13 isolat. Gen CaM juga berhasil membedakan A. niger dan A. welwitschiae yang memiliki kemiripan genetik tinggi. Multiple alignment dari sekuens isolat menunjukkan variasi yang tinggi dengan persentase kemiripan antarspesies Aspergillus sebesar 55—65,5% dan 79,2—86,4% khusus untuk kemiripan antarspesies kelompok Nigri. Tingkat diskriminasi CaM pada genus Aspergillus juga mendukung potensi sebagai kandidat diagnosis molekuler fungal asthma atau aspergillosis secara umum.

---

Fungal infection on asthmatic patients is found about one third of asthma cases. The main species infecting respiratory organs is Aspergillus fumigatus, followed by A. flavus, A. niger, and A. terreus. Fungal on clinical isolate can be identified through molecular identification, however, there is no standardized method. Calmodulin gene (CaM) is a barcode recommended for Aspergillus identification because of its ability to differentiate between species. In this research, CaM ability as DNA barcode and candidate for aspergillosis molecular diagnosis is analyzed through species identification and CaM sequence variation analysis on clinical isolate derived from asthmatic patients. The procedures include isolate culture using sabouraud dextrose agar (SDA) and broth (SDB), DNA extraction using phenol chloroform isoamyl alcohol (PCI), CaM amplification, visualization using electrophoresis, sequencing, and sequence analysis. Results show that CaM is able to identify all of 13 isolates. CaM is also able to differentiate A. niger and A welwitschiae that have high genetic similarity. Multiple alignment of isolate sequence shows high variation with interspecies similarity of 55—65,5% and 79,2—86,4% for interspecies similarity of Nigri section. Discriminate level of CaM on the genus Aspergillus also promotes the potential as a candidate for molecular diagnosis of fungal asthma or aspergillosis."

"Infeksi jamur paru dapat disebabkan Aspergillus spp. menyebabkan aspergillosis paru kronik (APK) yang sering mengikuti penyakit kronik lain, termasuk tuberkulosis (TB) paru. Data APK dan metode diagnosisnya pada pasien TB paru di Indonesia masih terbatas. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui perbandingan sensitivitas deteksi antibodi spesifik Aspergillus pada pasien TB paru. Penelitian berdesain nested case-control ini merupakan bagian dari penelitian payung tentang diagnosis APK pada pasien TB paru di Jakarta. Serum pasien yang memenuhi kriteria inklusi diperiksa menggunakan imunokromatografi kit ICT LDBio Aspergillus sebanyak 2 kali, yaitu saat awal dan akhir pengobatan TB. Pemeriksaan dilakukan pada Maret-Oktober 2022 sesuai protokol di Laboratorium Parasitologi FKUI. Dari 71 pasien TB paru yang memenuhi kriteria inklusi, rerata usia 44,35 ± 17,43. Pemeriksaan ICT LDBio Aspergillus pada awal terapi OAT menunjukkan hasil positif pada 4 dari 71 (5,6%) pasien, dengan sensitivitas 11,54%, spesifisitas 97,78%. Pada akhir terapi OAT, pemeriksaan ICT LDBio Aspergillus juga menunjukkan hasil positif pada 5,6% pasien, dengan sensitivitas 25% serta spesifisitas 96,83%. Hasil ICT LD Bio Aspergillus pada 71 pasien TB paru dalam penelitian ini menunjukkan hasil positif yang setara pada awal dan akhir OAT (5,6%), dengan sensitivitas yang lebih rendah pada awal OAT (11,54%) dibandingkan akhir OAT (25%).

---

Lung fungal infection can be caused by Aspergillus spp. causes chronic pulmonary aspergillosis (CPA) which often follows other chronic diseases, including pulmonary tuberculosis (TB). CPA data and its method of diagnosis in pulmonary TB patients in Indonesia are still limited. This study aims to compare the sensitivity of Aspergillusspecific antibody detection in pulmonary TB patients. This nested case-control design study is part of an umbrella study on the diagnosis of CPA in pulmonary TB patients in Jakarta. Sera of patients who met the inclusion criteria were examined using the ICT LDBio Aspergillus kit 2 times, namely at the beginning and at the end of TB treatment. The examination was carried out in March-October 2022 according to the protocol at the FKUI Parasitology Laboratory. Of the 71 pulmonary TB patients who met the inclusion criteria, the mean age was 44.35 ± 17.43. The result of ICT LDBio Aspergillus examination at the start of anti-tuberculosis therapy showed positive results in 4 of 71 (5.6%) patients, with a sensitivity of 11.54%, a specificity of 97.78%. At the end of antituberculosis therapy, the result of ICT LDBio Aspergillus examination also showed positive results in 5.6% of patients, with a sensitivity of 25% and a specificity of 96.83%. ICT LDBio Aspergillus results in 71 pulmonary TB patients in this study showed equivalent positive results at the beginning and end of anti-tuberculosis (5.6%), with lower sensitivity at the start of anti-tuberculosis (11.54%) than at the end of anti-tuberculosis (25%)."

"Aspergilosis paru merupakan infeksi oportunistik yang disebabkan oleh jamur Aspergillus spp. Insidensi aspergilosis paru cenderung semakin meningkat seiring dengan peningkatan penggunaan obat-obatan imunosupresan seperti kortikosteroid dan terapi sitotoksik. Sulitnya penegakan diagnosis aspergilosis paru menjadi tantangan disebabkan tanda dan gejala klinis yang tidak spesifik serta biopsi jaringan sebagai baku emas yang bersifat invasif. Pemeriksaan kultur sputum dan deteksi antibodi merupakan pemeriksaan yang rutin dilakukan pada pasien suspek aspergilosis paru yang dikirim ke Laboratorium Mikologi Departemen Parasitologi FKUI, namun belum tersedia data mengenai nilai diagnostik deteksi antibodi dalam mendiagnosis aspergilosis paru. Tujuan penelitian ini adalah membandingkan pemeriksaan deteksi antibodi dengan crude antigen Aspergillus dengan metode imunodifusi dengan kultur sputum sebagai tes rujukan. Penelitian berdesain potong lintang dengan sampel berjumlah 689 rekam medis dari pasien suspek aspergilosis paru yang melakukan pemeriksaan kultur sputum dan deteksi antibodi di Laboratorium Mikologi Departemen Parasitologi FKUI tahun 2008-2015. Dari analisis deskriptif didapatkan prevalensi aspergilosis paru berdasarkan hasil positif kultur sebesar 0,4. Dari uji diagnostik deteksi antibodi dengan tabel 2x2, nilai sensitivitas 33,33 dan spesifisitas 95,62 serta terdapatnya perbedaan yang bermakna.

---

Pulmonary aspergillosis is an opportunistic infection caused by Aspergillus spp mold. The incidence of this infection has dramatically increased which is related to the increasing utilization of immunosuppressive drugs such as corticosteroids and cytotoxic therapy. Diagnosis of pulmonary aspergillosis has been challenging since not only the signs and symptoms of the disease are nonspecific, but also tissue biopsy as gold standard is considered invasive. Sputum culture and antibody detection has been routine examinations done to the patient with suspected pulmonary aspergillosis sent to the Mycology Laboratory of Department of Parasitology FMUI, but the diagnostic value of antibody detection is not available.

The aim of this study is to compare antibody detection with immunodiffusion method using crude antigen of Aspergillus with sputum culture as reference test. This cross sectional study used 689 samples obtained from medical records of patients with suspected pulmonary aspergillosis who undergo both sputum culture examination and antibody detection in Mycology Laboratory of Department of Parasitology FMUI in 2008 2015. Descriptive analysis showed the prevalence of pulmonary aspergillosis based on positive culture result is 0,4. The sensitivity and specificity of antibody detection are 33,33 and 95,62 respectively, resulted from diagnostic test using 2x2 table. Statistical analysis using McNemar rsquo. test shows significant difference between mentioned examinations and low level of agreement Kappa 0,026."

"ABSTRACTTuberkulosis adalah penyakit infeksi yang diderita oleh banyak orang di dunia termasuk Indonesia. Konversi sputum adalah salah satu cara untuk mengevaluasi respon pasien tuberkulosis, namun konversi sputum dipengaruhi oleh banyak faktor salah satunya adalah grading sputum yang tinggi. Pada penelitian ini dilakukan penelitian mengenai keberhasilan konversi sputum dihubungkan dengan sputum smear grading. Studi ini dilakukan di tiga puskesmas di Depok dan menggunakan 293 formulir TB.01. Terdapat 25 kejadian gagal konversi dimana 16 dari kejadian itu didapatkan pada kelompok dengan sputum smear grading yang tinggi. Analisis statistik dari data yang didapat menunjukkan bahwa ada hubungan antara sputum smear grading yang tinggi dengan kegagalan konversi dengan RR 3.380 yang memiliki indeks kepercayaan 95 1.549 hingga 7.375. Kesimpulan dari hasil penelitian ini adalah sputum smear grading merupakan salah satu faktor penting yang memengaruhi keberhasilan konversi pada pasien TB.

---

ABSTRACTTuberculosis is an infectious disease suffered by many people in the world including Indonesia. Sputum conversion is an indicator to evaluate patient rsquo s response against Tuberculosis drug, but sputum conversion is influenced by many factors and high sputum grading is one of them. In this research, we seek the relation between sputum smear grading and the success of sputum conversion. This study is done in three public health center in Depok and using 293 TB.01 formulir. There are 25 incidence of failure in sputum conversion and 16 of it is from the group whose sputum smear grading is high. Statistical analysis from the data showed that there is a relation between high sputum smear grading and sputum conversion. The RR is 3.380 with 95 confidence interval 1.549 to 7.375. The conclusion from this study is that sputum smear grading is an important factor that influence success rate of conversion of sputum in tuberculosis patient."

"Latar belakang: Aspergilosis paru kronik (APK) merupakan penyakit paru destruktif yang bersifat progresif terutama disebabkan infeksi Aspergillus fumigatus. Penyakit ini dapat menjadi komplikasi infeksi tuberkulosis (TB) dan menyebabkan morbiditas serta mortalitas signifikan. Diagnosis APK masih menjadi tantangan karena gejala klinis tidak khas, serta belum ada alat diagnosis yang cepat dan akurat. Deteksi IgG Aspergillus berbasis lateral flow assay (LFA) menggunakan metode imunokromatografi (ICT) merupakan uji cepat dan sederhana untuk membantu diagnosis APK. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui hubungan uji ICT Aspergillus dengan karakteristik klinis dan radiologis APK pada pasien terkait TB paru.Metode: Penelitian berdesain potong lintang ini dilaksanakan pada April 2019-Juli 2023 dan merupakan bagian dari penelitian sebelumnya tentang diagnosis APK di Indonesia. Serum pasien APK diperiksa di Laboratorium Mikologi Departemen Parasitologi FKUI untuk deteksi ICT Aspergillus, kemudian dilanjutkan dengan analisis hasil penelitian.Hasil: Sebanyak 29 dari 54 (54%) serum pasien yang diteliti menunjukkan hasil uji ICT Aspergillus positif. Proporsi jenis kelamin perempuan (63%) lebih banyak dibandingkan laki-laki, sedangkan usia terbanyak 30-60 tahun (74%). Gejala klinis terbanyak adalah fatigue (57%), batuk ≥ 3 bulan (42%), hemoptisis (41%) diikuti sesak napas (24%), dan nyeri dada (20%). Adapun penyakit penyerta terbanyak adalah diabetes melitus (20%), penyakit kardiovaskular (11%), dan PPOK (9%). Gambaran radiologi paling dominan adalah kavitas (94%), diikuti infiltrat (72%), dan penebalan pleura (55%). Analisis statistik menunjukkan kaitan bermakna antara hasil ICT Aspergillus positif dengan gambaran radiologi berupa infiltrat, fibrosis parakavitas, fibrosis, efusi pleura, konsolidasi dan bronkiektasis (p <0,005). Hasil ICT Aspergillus tidak menunjukkan kemaknaan statistik dengan karakteristik klinis.Simpulan: Deteksi IgG spesifik Aspergillus metode ICT pada 54 pasien APK pada penelitian ini menunjukkan hasil positif 54%. Pada penelitian ini hasil ICT Aspergillus menunjukkan kaitan bermakna secara statistik dengan gambaran radiologi, tetapi tidak menunjukkan kaitan bermakna dengan karakteristik klinis pasien.

---

Background: Chronic pulmonary aspergillosis (CPA) is a progressive, destructive lung disease mainly caused by Aspergillus fumigatus infection. The disease can be a complication of tuberculosis (TB) infection and cause significant morbidity and mortality. Diagnosis of CPA is still challenging because the clinical symptoms are not typical, and there are no fast and accurate diagnostic tools. Detection of IgG-specific Aspergillus using the immunochromatography (ICT) method is a quick and simple test to assist CPA diagnosis. The study aimed to determine the correlation between the ICT Aspergillus test and the clinical and radiological characteristics of CPA in TB-related patients.

Method: This cross-sectional study was carried out in April 2019-July 2023 and was part of a previous study on CPA diagnosis in Indonesia. All sera of CPA patients were examined at the Clinical Parasitology Laboratory, Faculty of Medicine Universitas Indonesia for ICT Aspergillus detection, followed by analysis of the study results.

Result: Twenty-nine of the 54 patient sera showed positive results of ICT Aspergillus. There were more female (76%) than male patients, with the majority aged 30–60 years (74%). The most common clinical symptoms were fatigue (57%), cough ≥3 months (42%), hemoptysis (41%), shortness of breath (24%), and chest pain (20%). The most common comorbidities were diabetes mellitus (20%), cardiovascular diseases (11%), and COPD (9%). The dominant of radiological features were cavities (94%), followed by infiltrates (72%), and pleural thickening (55%). The statistical analysis showed a significant correlation between positive ICT Aspergillus results and radiological features, including infiltrates, paracavity fibrosis, fibrosis, pleural effusion, consolidation, and bronchiectasis. However, the ICT Aspergillus did not show statistical significance with clinical characteristics.

Conclusion: The ICT Aspergillus detection in this study showed positive results of 54%. There was a significant correlation between ICT Aspergillus positive result with radiology features, but no significant correlation with clinical characteristics."

"Latar belakang: Penemuan kasus tuberkulosis TB paru berperan penting dalam mengurangi angka komplikasi dan mortalitas. Diagnosis TB paru bakteriologis ditegakkan dengan pemeriksaan sputum sehingga spesimen yang diperiksa harus representatif dalam menggambarkan produk sekresi saluran napas bawah. Hal tersebut dapat dilihat dari kualitas sputum yang baik sehingga diharapkan memiliki tingkat kepositifan yang lebih tinggi dalam konfirmasi penyakit secara bakteriologis. Saat ini masih dirasakan kesulitan pada beberapa kasus dalam pengumpulan sampel sputum yang representatif sehingga dibutuhkan metode baru ekpektorasi sputum pada pasien TB paru, seperti metode active cycle breathing technique ACBT . Tujuan utama penelitian ini yaitu untuk mengetahui perbandingan efektifitas ACBT 2 jenis metode ACBT terhadap hasil sputum pasien TB paru, baik dalam hal kualitas sputum maupun tingkat kepositifan bakteriologis sputum.Metode: Desain penelitian ini yaitu uji klinis randomisasi pre-post study dengan membandingkan kualitas sputum dan kepositifan bakteriologis sputum sebelum dan setelah individually-guided ACBT dan video-guided ACBT. Setelah itu dilakukan perbandingan efektifitas kedua teknik tersebut. Subjek yang memenuhi kriteria penelitian akan dirandomisasi untuk dibagi dalam 2 kelompok perlakuan. Setiap subjek akan diminta untuk ekspektorasi sputum sewaktu sebanyak dua kali yaitu sebelum dan setelah ACBT dan selanjutnya akan dilakukan identifikasi kualitas sputum, pemeriksaan basil tahan asam BTA dan biakan mycobacterium tuberculosis MTB .Hasil: Terdapat peningkatan yang bermakna setelah intervensi individually-guided ACBT dalam hal tingkat kualitas sputum p=0,000 , kepositifan BTA p=0,000 dan biakan MTB sputum p=0,000 . Namun 3 hasil tersebut tidak didapatkan setelah intervensi video-guided ACBT p=0,157; p=0,072; p=0,061 . Hasil tersebut diperkuat dengan analisis perbandingan antara kedua kelompok tersebut yang menyatakan bahwa intervensi individually-guided ACBT menyebabkan peningkatan kualitas sputum p=0,000 , kepositifan BTA p=0,000 dan biakan MTB p=0,000 yang bermakna dibandingkan dengan intervensi video-guided ACBT.Kesimpulan: Individually-guided ACBT merupakan teknik yang lebih efektif dibandingkan dengan video-guided ACBT dalam peningkatan kualitas sputum dan kepositifan bakteriologis sputum pasien TB paru.Kata kunci: Active cycle breathing technique, sputum, kualitas, bakteriologi, tuberkulosis.

---

Background Identification of new tuberculosis TB cases plays an important role in decreasing complication and mortality rate. Sputum specimen is an integral part for bacteriological diagnosis of pulmonary tuberculosis so it should be represent lower respiratory tract secretion. It could be described by good sputum quality so hopefully it will have a higher positivity rate in bacteriological confirmation of the disease. Nowdays, it still felt quite hard in few cases for getting representative sputum specimen for diagnostic procedure so it is needed a new method for increasing sputum expectoration in tuberculosis patient, such as active cycle breathing technique ACBT method. So the primary aim of this research is to evaluate the effectivity comparison of ACBT 2 type ACBT methods in sputum result of pulmonary TB patient, both regarding sputum quality and also bacteriological positivity level.Method It is a clinical trial pre post study to compare quality of expectorated sputum and bacteriological positivity level before and after individually guided ACBT and video guided ACBT. After that, both intervention will be compared by their effectivity. Subjects who fulfill the study criteria will randomized into two study group. Each subject were asked to expectorate spot sputum twice, before and after ACBT and it will be identified for sputum quality, direct smear of acid fast bacili AFB and mycobacterium tuberculosis MTB culture. Results There is a significantly increased after intervention individually guided ACBT in terms of the quality sputum p 0.000 , positivity of AFB smear p 0.000 and MTB culture p 0.000 . However the 3 results are not obtained after the video guided ACBT intervention p 0.157 p 0.072 p 0.061 . These results are reinforced by a comparative analysis between the two treatment groups that claimed individually guided ACBT intervention lead to significantly improved in quality of sputum p 0.000 , positivity of AFB smear p 0.000 and MTB culture p 0.000 compared to video guided ACBT. Conclusion Individually guided ACBT is a technique that is more effective than video guided ACBT in terms of sputum quality and bacteriological positivity level in pulmonary TB patients. Keywords Active cycle breathing technique, sputum, quality, bacteriology, tuberculosis. "

"Tuberkulosis multidrug resistant (TB MDR) merupakan penyakit infeksi yang terus mengalami peningkatan jumlah kasus setiap tahunnya. Indonesia menempati peringkat ke-delapan dari 27 negara dengan kasus TB MDR paling banyak di dunia (WHO, 2013). Pengobatan yang lebih kompleks dengan durasi yang lebih lama, menjadikan pasien TB MDR seringkali mengalami kegagalan konversi sputum. Kegagalan konversi sputum ini dipengaruhi oleh banyak faktor (multifaktorial). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui hubungan antara faktor demografi (usia dan jenis kelamin), riwayat merokok serta penyakit komorbid (diabetes melitus dan HIV/AIDS) terhadap kejadian gagal konversi sputum pasien TB MDR di RSUP Persahabatan Jakarta tahun 2014-2016. Penelitian ini tergolong penelitian potong lintang dengan data sekunder yang diperoleh dari 51 rekam medis di Poli TB MDR RSUP Persahabatan. Hasil penelitian ini menunjukkan prevalensi pasien TB MDR dengan gagal konversi sputum sebesar 5.6%. Hasil analisis univariat menunjukkan pasien TB MDR dengan gagal konversi sputum didominasi oleh laki-laki (62.7%); usia dewasa (80.4%); memiliki kebiasaan merokok (58.8%); tidak memiliki riwayat diabetes melitus (82.4%); dan tidak memiliki riwayat HIV/AIDS (100%). Hasil analisis bivariat menunjukkan hubungan yang tidak bermakna antara usia (p=0.084); jenis kelamin (p=0.421); kebiasaan merokok (p=0.550); riwayat diabetes melitus (p=0.799) dengan kegagalan konversi sputum pasien TB MDR. Dari hasil tersebut, dapat disimpulkan bahwa usia, jenis kelamin, riwayat merokok, diabetes melitus, dan HIV/AIDS tidak memiliki hubungan yang bermakna dengan kejadian gagal konversi sputum pasien TB MDR di RSUP Persahabatan Jakarta tahun 2014-2016.

---

Multidrug resistant tuberculosis (MDR TB) is an infectious disease that continues to increase in the number of cases every year. Indonesia is on 8th rank among 27 countries with the most cases of MDR TB in the world (WHO, 2013). More complex treatment with longer duration, makes MDR TB patients often have sputum conversion failure. This sputum conversion failure is influenced by many factors (multifactorial). The aim of this study is to determine the relationship between demographic factors (age and gender), smoking habit, comorbid diseases (diabetes mellitus and HIV/AIDS) with sputum conversion failure of MDR TB patients at RSUP Persahabatan Jakarta in 2014-2016. The design of this study is a cross-sectional study with secondary data obtained from 51 medical records in MDR TB Polyclinic at Persahabatan Hospital.

The results of this study showed the prevalence of MDR TB patients with sputum conversion failure is 5.6%. The results of univariate analysis showed that MDR TB patients with sputum conversion failure were dominated by men (62.7%); adult age (80.4%); have a smoking habit (58.8%); have no history of diabetes mellitus (82.4%); and have no history of HIV/AIDS (100%). The results of bivariate analysis showed an insignificant relationship between age (p=0.084); gender (p=0.421); smoking habits (p=0.550); history of diabetes mellitus (p=0.799) with sputum conversion failure of MDR TB patients. From these results, it can be concluded that age, gender, smoking habit, diabetes mellitus, and HIV/AIDS do not have significant relationships with sputum conversion failure of MDR TB patients at RSUP Persahabatan Jakarta in 2014-2016."

"Kasus chronic pulmonary aspergillosis (CPA) di Indonesia memiliki prevalensi ±83.000 penderita dengan penambahan kasus baru sebanyak 17.561 pasien dengan riwayat tuberkulosis paru-paru setiap tahunnya, disebabkan oleh kapang Aspergillus spp. Gen calmodulin (CaM) merupakan markah genetik Aspergillus yang memiliki spesifikasi sekuens tinggi untuk membedakan tiap spesies Aspergillus, namun studi mengenai profil sekuensnya pada isolat penderita CPA pasca tuberkulosis di Indonesia belum ditemukan laporannya. Penelitian ini menggunakan gen CaM untuk dianalisis sekuens DNA-nya sekaligus mengidentifikasi dan memantau spesies Aspergillus dari 31 isolat spesimen klinis pasien CPA beriwayat tuberkulosis paru-paru dari 6 rumah sakit umum di Jakarta. Ekstraksi DNA dilakukan menggunakan metode PCI lalu gen CaM diamplifikasi dengan primer Cmd5 dan Cmd6, selanjutnya dilakukan sekuensing DNA. Hasil menunjukkan sekuens gen CaM Aspergillus spp. memiliki wilayah lestari dan polimorfik khas antar spesies intraseksi maupun interseksi (Nigri, Fumigati, dan Flavi). Hasil identifikasi molekuler menunjukkan spesies terdiri dari A. niger (n = 3), A. fumigatus (n = 17), A. flavus (n = 4), A. tubingensis (n = 2), A. welwitschiae (n = 2), A. tamarii (n = 2), dan A. brunneoviolaceus (n = 1). Spesies A. welwitschiae dan A. tamarii dikonfirmasi menjadi salah satu spesies kriptik penyebab CPA pada pasien beriwayat tuberkulosis paru-paru di Jakarta, Indonesia.

---

The number of chronic pulmonary aspergillosis (CPA) cases in Indonesia reached a prevalence number ±83.000 patients with increasing rate of 17.561 patients with lung tuberculosis medical history each year, caused by Aspergillus fungi. Calmodulin (CaM) gene is a biomarker for Aspergillus which has high sequence specifity to distinguish among species within the group, however a report to characterize its sequence profile on post-tuberculosis CPA isolates in Indonesia has not yet been found. The aims of this research are to conduct sequence analysis on Aspergillus CaM genes, also to identify and monitor the species from 31 isolates of post-tuberculosis CPA patient’s clinical specimens obtained from 6 public hospital in Jakarta. The results showed that CaM gene from Aspergillus spp. have unique conserved and polymorphic regions both intra/intersectionally (among Nigri, Fumigati, and Flavi) within the genus. The molecular identification results revealed a species consisiting A. niger (n = 3), A. fumigatus (n = 17), A. flavus (n = 4), A. tubingensis (n = 2), A. welwitschiae (n = 2), A. tamarii (n = 2), and A. brunneoviolaceus (n = 1). A. welwitschiae and A. tamarii are confirmed to be one of cryptic species responsible for causing human post-tuberculosis CPA in Jakarta, Indonesia.

"

"Penyakit TB MDR merupakan salah satu penyakit infeksi yang prevalensinya semakin meningkat dari tahun ke tahun di Indonesia dengan angka keberhasilan pengobatan 45%. Konversi kultur sputum merupakan suatu prediktor kuat dari awal keberhasilan terapi. Waktu konversi yang lambat akan memperpanjang periode penularan dan memprediksi tingkat kegagalan pengobatan yang tinggi. Terdapat beberapa faktor risiko yang berhubungan dengan konversi kultur sputum pasien TB MDR. Penelitian terkait faktor risiko kadar albumin dengan waktu konversi kultur sputum masih sangat terbatas. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui hubungan kadar albumin dengan waktu konversi kultur sputum di poli MDR terpadu RS Paru Dr M Goenawan Partowidigdo tahun 2022. Penelitian ini menggunakan studi cohort retrospektif dengan sampel yang diambil dari catatan rekam medis dan SITB pasien poli MDR. Variabel yang diteliti adalah kadar albumin < 3,5 gram/dl dan ≥ 3,5 gram/dl dengan variabel covariat usia, jenis kelamin, pendidikan, index masa tubuh, status merokok, gradasi sputum bta, komorbid, regimen pengobatan, dan kepatuhan minum obat . Hasil penelitian berdasarkan analisis multivariat menunjukkan kadar albumin < 3,5 mg/dl memiliki kecepatan waktu konversi 41,8% lebih lambat dengan (HR=0,582, 95% CI 0.344-0.984) untuk mengalami konversi dibanding dengan pasien TB MDR dengan kadar albumin ≥ 3,5 mg/dl setelah memperhitungkan status merokok dan kepatuhan minum obat. Perlunya memperbaiki kadar albumin yang rendah pada pasien TB MDR di rumah sakit dan memberikan penyuluhan kepada keluarga pasien agar turut berpartisipasi memantau asupan makan pasien yaitu makanan yang mengandung tinggi protein seperti ikan gabus serta ekstra putih telur untuk membantu meningkatkan kadar albumin pasien yang dapat berguna untuk terjadinya konversi kultur sputum.

---

MDR TB disease is an infectious disease whose prevalence is increasing from year to year in Indonesia with a treatment success rate of 45%. Sputum culture conversion is a strong predictor of initial therapeutic success. Slow conversion time will prolong the period of transmission and predict a high rate of treatment failure. There are several risk factors associated with sputum culture conversion in MDR TB patients. Research related to risk factors for albumin levels and sputum culture conversion time is still very limited. The aim of this study was to determine the relationship between albumin levels and sputum culture conversion time at the integrated MDR polyclinic at Dr M Goenawan Partowidigdo Pulmonary Hospital in 2022. This study used a retrospective cohort study with samples taken from medical records and SITB patients at poly MDR. The variables studied were albumin levels < 3.5 mg/dl and ≥ 3.5 mg/dl with the covariate variables age, sex, education, body mass index, smoking status, sputum gradation, co-morbidities, medication regimens, and drinking adherence drug . The results of the study based on multivariate analysis showed that albumin levels < 3.5 mg/dl had a 41.8% slower conversion time (HR=0.582, 95% CI 0.344-0.984) to experience conversion compared to MDR TB patients with albumin levels ≥ 3.5 mg/dl after taking into account smoking status and medication adherence. It is necessary to improve low albumin levels in MDR TB patients at the hospital and provide counseling to the patient's family to participate in monitoring the patient's food intake, namely foods that contain high protein such as snakehead fish and extra egg whites to help increase the patient's albumin levels which can be useful for the occurrence of sputum culture conversion."