Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 148954 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Resisca Anastasya
"Kanker kolorektal (KKR) adalah kanker yang menyerang bagian kolon dan rektum pada usus besar. Kasus KKR menempati posisis keempat di Indonesia. Pada umumnya, KKR didiagnosis menggunakan pemeriksaan standar dengan kolonoskopi, namun metode ini bersifat invasif dan menimbulkan rasa tidak nyaman bagi penderita KKR. Oleh karena itu, diperlukan alternatif yang minim invasif dan mudah dilakukan dengan cara mendeteksi keberadaan Circulating Tumor Cells (CTC) dalam darah. Kelimpahan CTC dalam darah sangat rendah, diperkirakan 1—10 CTC per 10 mL darah, sehingga perlu dilakukan isolasi CTC untuk memperkaya jumlah CTC. Metode yang dapat digunakan untuk mengisolasi CTC, yaitu metode sentrifugasi gradien densitas termodifikasi SepMateTM-15. Dalam mendeteksi CTC diperlukan marker yang memiliki spesifisitas dan sensitivitas baik, serta berasal dari jaringan tumor primer penderita KKR, seperti CK20. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi CTC dengan menggunakan metode gradien densitas termodifikasi SepMateTM-15 dan karakterisasi CTC dengan penanda CK20 dari darah perifer KKR menggunakan Imunofluorosensi. Hasil isolasi CTC menunjukkan seluruh subjek KKR berhasil diisolasi dengan positivitas ≥1 CTC/ mL darah. Single CTC terdeteksi pada subjek 1,2, dan 4. Cluster CTC terdeteksi pada subjek 2,3, dan 5. Diameter rata-rata CTC yang diperoleh 10,82¼m. Sel CTC berhasil dikarakterisasi single CTC dan cluster CTC dengan penanda CK20 dalam analisis Imunofluorosensi.

Colorectal cancer (CRC) is a cancer that affects the colon and rectum in the large intestine. In Indonesia, CRC cases are ranked fourth. Generally, CRC is diagnosed using standard examinations colonoscopy, this procedure is invasive and uncomfortable for CRC patients. Therefore, an alternative that is minimally invasive and easy to perform is needed to detect the presence of Circulating Tumor Cells (CTCs).  The abundance of CTCs in blood is very low, estimated at 1—10 CTC/10 mL. Therefore, CTC isolation is required to increase the quantity of CTCs. A method to isolate CTCs is the SepMateTM-15 modified density gradient centrifugation method. To detect CTCs, markers with good specificity and sensitivity are needed originating from primary tumor tissues in CRC patients, such as CK20. This study aims to isolate CTCs using the SepMateTM-15 modified density gradient method and characterize CTCs with CK20 marker from peripheral blood using immunofluorescence. All CRC subjects were successfully isolated with positivity of  ≥1 CTC/mL. Single CTC in subjects 1, 2, and 4. CTC clusters were identified in subjects 2, 3, and 5. The average diameter of CTCs is 10.82 μm. Cell CTCs were successfully characterized between single CTCs and CTC clusters using a CK20 marker by immunofluorescence analysis."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2024
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Sovya Salwa Salsabila
"Kanker kolorektal menempati urutan kedua dengan jumlah kasus tertinggi di dunia. Kanker kolorektal dapat dideteksi dengan menggunakan kolonoskopi, namun metode tersebut bersifat invasif. Oleh karena itu, penggunaan liquid biopsy dapat digunakan sebagai metode alternatif karena tergolong semi-invasif. Metode liquid biopsy yang digunakan adalah menggunakan darah dari pembuluh perifer. Di dalam darah terdapat beragam komponen penyusun, salah satunya adalah Circulating Tumor Cells (CTC). Circulating Tumor Cells dapat dikarakterisasi dengan menggunakan penanda spesifik sitokeratin 20 (CK20) karena pendaran ekspresinya yang tinggi pada kanker kolorektal. Proses isolasi CTC dari sampel darah dapat dilakukan dengan bervariasi metode, salah satunya dengan red blood cells lysis (eritrolisis). Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi CTC dengan penanda CK20 dari sampel darah perifer serta mengetahui karakteristik dan jumlah CTC yang diperoleh dari subjek kanker kolorektal di RSUPN Dr. Cipto Mangunkusumo. Pada penelitian ini sampel darah diambil dari lima subjek kanker kolorektal. Untuk mengoptimalisasi hasil isolat CTC yang nantinya diperoleh maka dilakukan spike-in experiment dengan penambahan sel HT-29 ke dalam donor sehat. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa CTC ditemukan di seluruh subjek dengan rata-rata perolehan 6 CTC tunggal dan 1 CTC cluster dari 2 mL darah. Dengan demikian, immunofluorescence dapat digunakan untuk mengarakterisasi tipe morfologinya, yaitu CTC tunggal dan CTC cluster.

Colorectal cancer ranks second with the highest number of cases in the world. Colorectal cancer can be detected using colonoscopy, but this method is invasive. Therefore, liquid biopsy can be used as an alternative method because it is classified as semi-invasive. The liquid biopsy method used is using blood from peripheral vessels. In the blood there are various constituent components, one of which is Circulating Tumor Cells (CTCs). Circulating Tumor Cells can be characterized using the specific marker cytokeratin 20 (CK20) due to its high expression in colorectal cancer. The process of isolating CTCs from blood samples can be carried out using various methods, one of which is red blood cells lysis (erythrolysis). This study aims to isolate CTCs with the CK20 marker from peripheral blood samples and determine the characteristics and number of CTCs obtained from colorectal cancer subjects at RSUPN Dr. Cipto Mangunkusumo. In this study, blood samples were taken from five colorectal cancer subjects. To optimize the CTCs isolate results that will be obtained, a spike-in experiment was carried out by adding HT-29 cells to healthy donors. The results of this study showed that CTCs were found in all subjects with an average of 6 single CTCs and 1 cluster CTCs from 2 mL of blood. Thus, immunofluorescence can be used to characterize the morphological types, namely single CTCs and cluster CTCs."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2024
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Nur Azizah
"Kanker kolorektal merupakan jenis kanker dengan jumlah penderita terbanyak ketiga di dunia. Metode deteksi kanker kolorektal yang banyak digunakan yakni kolonoskopi, namun metode tersebut bersifat invasif dan mahal. Salah satu metode deteksi yang dapat digunakan sebagai alternatif adalah melalui deteksi penanda molekuler adalah CK20 pada Circulating Tumor Cells (CTC) yang terdapat dalam darah perifer. Permasalahan muncul akibat rendahnya jumlah CTC dalam darah. Deteksi gen CK20 pada serum darah berpotensi menjadi metode deteksi kanker kolorektal karena serum darah mengandung cell-free nucleic acid (cfNA) yang dilepaskan oleh sel tumor. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendeteksi gen CK20 pada CTC dan serum darah dari penderita kanker kolorektal. Isolat RNA diisolasi dari sampel CTC dan serum darah yang berasal dari empat penderita kanker kolorektal RSUPN Cipto Mangunkusumo kemudian diamplifikasi melalui Quantitave RT-PCR dan dianalisis melalui metode Melt Curve Analysis (MCA). Hasil menunjukkan bahwa gen CK20 memiliki Tm ~81°C dan terdeteksi pada satu sampel serum dan dua sampel jaringan. Berdasarkan hasil yang diperoleh, dapat disimpulkan bahwa gen CK20 tidak terdeteksi pada CTC dan terdeteksi pada satu serum darah penderita kanker kolorektal.

Colorectal cancer occupies the third-highest number of cancer patients worldwide. The most widely used colorectal cancer detection method is colonoscopy. However, colonoscopy is invasive and expensive. One alternative detection method is the detection of molecular markers such as CK20 in circulating tumor cells (CTC) found in the peripheral blood. The problem arises due to the low number of CTCs in the blood. Detection of the CK20 gene in blood serum is potentially used as a colorectal cancer detection method because blood serum contains cell-free nucleic acid (cfNA) released by tumor cells. This study aimed to detect the CK20 gene in CTCs and blood serum from colorectal cancer patients. RNA isolates were isolated from CTC samples and blood serum from four colorectal cancer patients at Cipto Mangunkusumo Hospital and then amplified by quantitative RT-PCR and then analyzed using the Melt Curve Analysis method. The results showed that the CK20 gene had a melting temperature of an average of ~81°C and was detected in one blood serum sample and two cancer tissue samples. Based on the results obtained, it can be concluded that the CK20 gene was undetected in CTCs and detected in one blood serum of colorectal cancer patients."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2023
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Clara Riski Amanda
"Kanker kolorektal (KKR) menempati urutan ketiga sebagai kanker penyebab kematian tertinggi di dunia. Diperkirakan sekitar 63% kematian akibat KKR terjadi karena kurangnya screening dan keterlambatan diagnosis. Saat ini metode standar yang digunakan dalam diagnosis KKR adalah kolonoskopi dan biopsi jaringan. Namun metode tersebut memiliki risiko yang tinggi, besifat invasif, serta tidak efisien untuk monitoring perkembangan tumor. Gen Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) telah umum digunakan sebagai marka prognostik KKR, salah satunya melalui studi ekspresi gen pada Circulating Tumor Cells (CTCs). Namun CTC memiliki beberapa kelemahan, seperti konsentrasi yang rendah dan heterogenitas yang beragam. Di sisi lain, serum darah penderita kanker mengandung cell-free Nucleic Acid (cfNA) yang membawa informasi genetik dari jaringan tumor asal. Hal tersebut menjadikan cfNA berpotensi untuk dikembangkan sebagai salah satu metode alternatif untuk diagnosis dan monitoring KKR. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi gen EGFR dari CTC dan serum darah penderita KKR menggunakan metode quantitative PCR with Melting Curve Analysis (qPCR MCA). Penelitian dilakukan terhadap 4 pasien KKR dengan karakteristik dan stadium kanker yang bervariasi. Hasil penelitian menunjukkan gen EGFR terdeteksi pada seluruh sampel serum dan hanya terdeteksi pada 1 sampel CTC. Oleh karena itu, dapat disimpulkan bahwa deteksi biomarker EGFR pada serum memiliki efektivitas yang lebih baik dibandingkan CTC.<

Colorectal cancer (CRC) ranks as the third leading cause of cancer death in the world. It is estimated that around 63% of deaths from CRC occur due to lack of screening and delay in diagnosis. Currently, the standard methods used in the diagnosis of CRC are colonoscopy and tissue biopsy. However, this method has a high risk, invasive, and inefficient for tumor monitoring. The Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) has been commonly used as a prognostic marker for CRC through gene expression analysis of Circulating Tumor Cells (CTCs). However, CTC have some limitations such as heterogeneity and low concentrations. On the other hand, the blood serum of cancer patients contains cell-free Nucleic Acid (cfNA) which carries genetic information from the original tumor tissue. Hence, cfNA have great potential to be developed as an alternative method for CRC diagnosis and monitoring. This study aims to detect the EGFR gene from CTC and blood serum of CRC patients using the quantitative PCR with the Melting Curve Analysis (qPCR MCA). The study was conducted on 4 CRC patients with various characteristics and stages of cancer. The results showed that the EGFR gene was detected in all serum samples and only in 1 CTC sample. Therefore, the results suggest that the detection of EGFR biomarkers in serum has better effectiveness than CTC."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2023
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Muhammad Altaf Aaron Zakaria
"Circulating tumor cell (CTC) merupakan intermediet proses metastasis kanker yang dapat dimanfaatkan untuk diagnosis, prognosis, dan target pengobatan kanker. Pengembangan pemanfaatan CTC dapat dilakukan dengan penelitian yang umumnya melibatkan proses kultur. Medium bebas serum dinilai lebih baik dibanding medium berserum karena dapat menghasilkan data yang lebih konsisten, sehingga lebih cocok digunakan untuk penelitian yang mengkaji aktivitas fisiologi sel dan persinyalan molekular. Namun, medium bebas serum memerlukan suplemen agar sel dapat tumbuh optimum. Penambahan suplemen insulin-transferrin-selenium (ITS) telah diketahui memiliki peran penting dalam kultur sel keratosit, ovarium, dan keratinosit. Namun, belum diketahui peran ITS dalam medium bebas serum untuk kultur CTC. Penelitian ini mengkaji perbedaan efek FBS dan ITS dengan konsentrasi 1X dan 10X dalam medium bebas serum terhadap CTC yang diisolasi dengan metode eritrolisis. Kultur dilakukan selama 18 hari. Dinamika CTC dan leukosit diamati dengan meninjau viabilitasnya pada 6 hari pertama kutur. Selain itu, observasi morfologi dilakukan seiring dengan pengukuran morfometri sel. Pada hari ke-18, keberadaan CTC diverifikasi dengan imunofluoresens menggunakan marka cytokeratin 20 (CK20) dan plastin 3 (PLS3). Hasil penelitian menunjukkan bahwa CTC yang dikultur pada medium dengan penambahan 10X ITS memiliki diameter sel yang lebih besar dari yang dikultur pada medium dengan penambahan 1X ITS dan 10% FBS. Hal tersebut menunjukkan bahwa ITS memiliki peran penting dalam kultur CTC dalam medium bebas serum dan dalam konsentrasi 10X dapat meningkatkan pertumbuhan CTC kanker kolorektal.

Circulating tumor cells (CTCs) are intermediates in the cancer metastasis process and hold potential for use in cancer diagnosis, prognosis, and treatment targeting. The development of CTC applications typically involves research incorporating cell culture processes. In cell culture, serum-free media are considered superior to serum-containing media as they yield more consistent data, making them more suitable for studies examining cell physiological activity and molecular signaling. However, serum-free media require supplementation to ensure optimal cell growth. The addition of insulin-transferrin-selenium (ITS) supplements is known to play a crucial role in the culture of keratocytes, ovarian cells, and keratinocytes. However, the role of ITS in serum-free media for CTC culture remains unknown. This study investigates the differential effects of fetal bovine serum (FBS) and ITS at concentrations of 1X and 10X in serum-free media on CTCs isolated via erythrolysis. Cultures were maintained for 18 days, with CTC and leukocyte dynamics observed by assessing cell viability during the first six days of culture. Additionally, morphological observations and cell morphometric measurements were conducted. On the 18th day, the presence of CTCs was verified using immunofluorescence with cytokeratin 20 (CK20) and plastin 3 (PLS3) markers. The results indicated that CTCs cultured in media supplemented with 10X ITS exhibited larger cell diameters compared to those cultured with 1X ITS and 10% FBS. This finding suggests that ITS plays a critical role in the successful culture of CTCs in serum-free media and that a 10X concentration of ITS can enhance the growth of colorectal cancer CTCs."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2024
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Ziad Abdullah
"Circulating tumor cell (CTC) adalah sel tumor yang terlepas dan bersirkulasi di pembuluh darah. Kultur CTC dapat bermanfaat untuk menentukan pengobatan yang efektif dan presisi terhadap penyakit kanker. Akan tetapi, hingga saat ini, kultur CTC masih terbatas dilakukan. Kobalt klorida dilaporkan dapat meningkatkan pertumbuhan sel tumor dalam kultur in-vitro. Namun, kobalt klorida belum pernah digunakan dalam mengultur CTC kanker kolorektal. Oleh karena itu, optimasi konsentrasi CoCl2 dalam mengultur CTC kanker kolorektal penting untuk dilakukan. Parameter yang dapat digunakan dalam optimasi tersebut adalah viabilitas dan jumlah agregasi CTC. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh penambahan beberapa konsentrasi CoCl2 (100 dan 150 μM) terhadap viabilitas dan jumlah agregasi CTC kanker kolorektal. Dalam penelitian ini, isolat hasil eritrolisis dikultur dalam medium dengan berbagai konsentrasi CoCl2 (0, 100, dan 150 μM). Kultur kemudian dikonfirmasi dengan immunofluorescence staining menggunakan CK20, PLS3, dan DAPI untuk mengonfirmasi keberadaan CTC kanker kolorektal. Berdasarkan hasil yang diperoleh, ketiga kultur terkonfirmasi mengandung CTC kanker kolorektal. Viabilitas dan jumlah agregasi sel kultur dari yang paling tinggi ke paling rendah teramati pada perlakuan 0, 100, dan 150 μM CoCl2. Berdasarkan penelitian ini, dapat disimpulkan bahwa penambahan konsentrasi CoCl2 tidak dapat meningkatkan viabilitas dan jumlah agregasi CTC kanker kolorektal.

Circulating tumor cells (CTCs) are tumor cells that have detached from the primary tumor and circulate in the bloodstream. Culturing CTCs can be beneficial in determining the effective and precise treatments for cancer. However, until now, CTCs culture is still very rare to be successfully done. Cobalt chloride has been reported to enhance tumor cell growth in in-vitro culture, but it has not yet been used to culture colorectal CTCs. Therefore, optimizing the concentration of CoCl2 in culturing colorectal CTCs is essential. Parameters that can be used in this optimization include the cell viability and the aggregates number of CTC. This study aims to investigate the effect of adding different concentrations of CoCl2 (100 and 150 μM) on the aggregates number and cell viability of colorectal CTCs. In this study, isolates obtained from erythrolysis were cultured in a medium with various concentrations of CoCl2 (0, 100, and 150 μM). The cultures were then confirmed with immunofluorescence staining using CK20, PLS3, and DAPI to confirm the presence of colorectal cancer CTCs. Based on the results, all three cultures were confirmed to contain colorectal cancer CTCs. The viability and number of cell aggregates in the culture were observed to be highest at 0 μM, followed by 100 μM, and lowest at 150 μM CoCl2. Based on this study, it can be concluded that the addition of CoCl2 concentrations does not increase the viability and number of aggregates of colorectal cancer CTCs."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2024
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Ziad Abdullah
"Circulating tumor cell (CTC) adalah sel tumor yang terlepas dan bersirkulasi di pembuluh darah. Kultur CTC dapat bermanfaat untuk menentukan pengobatan yang efektif dan presisi terhadap penyakit kanker. Akan tetapi, hingga saat ini, kultur CTC masih terbatas dilakukan. Kobalt klorida dilaporkan dapat meningkatkan pertumbuhan sel tumor dalam kultur in-vitro. Namun, kobalt klorida belum pernah digunakan dalam mengultur CTC kanker kolorektal. Oleh karena itu, optimasi konsentrasi CoCl2 dalam mengultur CTC kanker kolorektal penting untuk dilakukan. Parameter yang dapat digunakan dalam optimasi tersebut adalah viabilitas dan jumlah agregasi CTC. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh penambahan beberapa konsentrasi CoCl2 (100 dan 150 μM) terhadap viabilitas dan jumlah agregasi CTC kanker kolorektal. Dalam penelitian ini, isolat hasil eritrolisis dikultur dalam medium dengan berbagai konsentrasi CoCl2 (0, 100, dan 150 μM). Kultur kemudian dikonfirmasi dengan immunofluorescence staining menggunakan CK20, PLS3, dan DAPI untuk mengonfirmasi keberadaan CTC kanker kolorektal. Berdasarkan hasil yang diperoleh, ketiga kultur terkonfirmasi mengandung CTC kanker kolorektal. Viabilitas dan jumlah agregasi sel kultur dari yang paling tinggi ke paling rendah teramati pada perlakuan 0, 100, dan 150 μM CoCl2. Berdasarkan penelitian ini, dapat disimpulkan bahwa penambahan konsentrasi CoCl2 tidak dapat meningkatkan viabilitas dan jumlah agregasi CTC kanker kolorektal.

Circulating tumor cells (CTCs) are tumor cells that have detached from the primary tumor and circulate in the bloodstream. Culturing CTCs can be beneficial in determining the effective and precise treatments for cancer. However, until now, CTCs culture is still very rare to be successfully done. Cobalt chloride has been reported to enhance tumor cell growth in in-vitro culture, but it has not yet been used to culture colorectal CTCs. Therefore, optimizing the concentration of CoCl2 in culturing colorectal CTCs is essential. Parameters that can be used in this optimization include the cell viability and the aggregates number of CTC. This study aims to investigate the effect of adding different concentrations of CoCl2 (100 and 150 μM) on the aggregates number and cell viability of colorectal CTCs. In this study, isolates obtained from erythrolysis were cultured in a medium with various concentrations of CoCl2 (0, 100, and 150 μM). The cultures were then confirmed with immunofluorescence staining using CK20, PLS3, and DAPI to confirm the presence of colorectal cancer CTCs. Based on the results, all three cultures were confirmed to contain colorectal cancer CTCs. The viability and number of cell aggregates in the culture were observed to be highest at 0 μM, followed by 100 μM, and lowest at 150 μM CoCl2. Based on this study, it can be concluded that the addition of CoCl2 concentrations does not increase the viability and number of aggregates of colorectal cancer CTCs."
Depok: Fakultas Matematika Dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2024
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Fitri Aulia
"Kanker kolorektal menempati peringkat ketiga berdasarkan angka kematian di Indonesia. Cluster of differentiation 44 (CD44) merupakan biomarker yang dapat digunakan dalam mendeteksi kanker kolorektal. Ekspresi gen CD44 dapat dideteksi pada circulating tumor cell (CTC) yang diisolasi dari darah perifer, akan tetapi CTC merupakan rare cell. Ekspresi gen CD44 pada peripheral blood mononuclear cells (PBMC) berpotensi untuk dijadikan biomarker dalam deteksi kanker kolorektal karena kelimpahannya yang banyak jika dibandingkan dengan CTC, akan tetapi penelitian tentang deteksi ekspresi gen CD44 pada PBMC masih terbatas. Tujuan penelitian ini adalah untuk mendeteksi ekspresi gen CD44 pada sampel CTC dan PBMC sebagai potensi biomarker kanker kolorektal menggunakan metode semi-kuantitatif RT-PCR dan direct immunofluorescence. Hasil penelitian menunjukkan tidak terdeteksinya gen CD44 baik pada sampel CTC maupun PBMC dengan menggunakan metode semi-kuantitatif RT-PCR. Gen CD44 terdeteksi pada beberapa sampel PBMC dengan menggunakan direct immunofluorescence. Gen CD44 berpotensi sebagai biomarker kanker kolorektal, namun penelitian ini perlu diteliti lebih lanjut.

Colorectal cancer ranks third based on mortality in Indonesia. Cluster of differentiation 44 (CD44) is a biomarker that can be used to detect colorectal cancer. CD44 gene expression can be detected in circulating tumor cells (CTC) isolated from peripheral blood, but CTC is a rare cell. The expression of the CD44 gene in Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC) has the potential to be used as a biomarker in the detection of colorectal cancer because of its high abundance when compared to CTC, but research on the detection of CD44 gene expression in PBMCs is still limited. The purpose of this study was to detect the expression of the CD44 gene in CTC and PBMC samples as a potential colorectal cancer biomarker using semi-quantitative RT-PCR and direct immunofluorescence methods. The results showed that the CD44 gene was not detected in both CTC and PBMC samples using the semi-quantitative RT-PCR method. The CD44 gene was detected in several PBMC samples using direct immunofluorescence. The CD44 gene has potential as a biomarker of colorectal cancer, but this research needs to be investigated further. "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2021
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Izzati Rafidah
"Kanker kolorektal adalah salah satu penyakit dengan jumlah penderita yang banyak di Indonesia. Metode deteksi dini kanker kolorektal merupakan hal yang penting karena dilaporkan bahwa diagnosa pada tahap awal dapat meningkatkan tingkat kesembuhan. Salah satu metode deteksi dini yang umum dilakukan adalah melalui skrining biomarker kanker kolorektal pada darah perifer (peripheral blood). Dalam darah perifer tersebut diketahui terdapat circulating tumor cells (CTCs) yang menandakan metastasis dan peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) yang menandakan imunitas penderita kanker kolorektal. Biomarker CD45 (gen CD45) umum digunakan sebagai marker dalam metode seleksi negatif CTCs karena hanya diekspresikan pada PBMCs, akan tetapi telah dilaporkan bahwa CD45 juga diekspresikan pada microenvironment tumor kanker kolorektal, sehingga diperlukan penelitian lebih lanjut terkait ekspresi gen CD45 pada CTCs. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendeteksi ekspresi gen CD45 pada CTCs dan PBMCs penderita kanker kolorektal dengan metode semi-kuantitatif RT-PCR dan direct immunofluorescence agar mengetahui potensinya sebagai biomarker deteksi kanker kolorektal. Delapan sampel darah perifer dari pasien kanker kolorektal RSUPN Dr. Cipto Mangunkusumo dikumpulkan, kemudian CTCs dan PBMCs diisolasi dari sampel darah tersebut. Hasil penelitian menunjukkan mRNA gen CD45 terdeteksi pada seluruh sampel CTCs dan PBMCs, serta ekspresi relatif lebih tinggi pada sampel PBMCs, sedangkan hasil deteksi protein gen CD45 hanya terdeteksi pada satu sampel PBMCs. Maka dapat disimpulkan bahwa mRNA gen CD45 terdeteksi baik pada CTCs maupun PBMCs sehingga berpotensi sebagai biomarker kanker kolorektal.

Colorectal cancer is one of the cancers with a high prevalence in Indonesia. The method for early detection of colorectal cancer is important because it has been reported that diagnosis in the early stages of the disease can increase the cure rate. One of the common methods for early detection is through screening the colorectal cancer biomarkers in peripheral blood that indicates metastasis (CTCs), and the immunity (PBMCs) of colorectal cancer patients. The CD45 biomarker (CD45 gene) is commonly used in the negative selection method for CTCs due to its expression only in PBMCs. Nevertheless, it has been reported that CD45 is also expressed in the microenvironment of colorectal cancer tumors, therefore further research is requireded. The purpose of this study is to detect the expression of the CD45 gene in CTCs and PBMCs of colorectal cancer patients using semi-quantitative RT-PCR and direct immunofluorescence in order to determine its potential as a biomarker for the detection of colorectal cancer. Peripheral blood samples from 8 patients at RSUPN Cipto Mangunkusumo were collected and then the CTCs and PBMCs were isolated from those samples. The results showed that the CD45 gene’s mRNA was detected in all samples of both, with relatively higher expression in the PBMCs, while the CD45 gene’s protein was detected only in one PBMCs sample. It can conclude that the mRNA of the CD45 gene was detected in both CTCs and PBMCs so that it has the potential as a biomarker of colorectal cancer. "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia , 2021
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Saskia Aziza Nursyirwan
"Latar Belakang: Kanker kolorektal (KKR) adalah salah satu penyebab utama morbiditas dan mortalitas terkait kanker. Pemeriksaan baku emas yang dilakukan untuk mendiagnosis kanker kolorektal hingga saat ini adalah histopatologi, yang didapat dari biopsi saat kolonoskopi. Oleh karena tidak semua pasien mau untuk menjalani pemeriksaan invasif di awal rencana diagnosis, maka pendekatan non-invasif baru yang dapat melengkapi dan meningkatkan strategi untuk diagnosis non invasif dan manajemen kanker kolorektal sangat dibutuhkan. Circulating tumor cell (CTC) dalam darah diharapkan dapat digunakan sebagai penanda diagnostik yang non-invasif pada pasien dengan KKR.
Tujuan: Penelitian ini merupakan uji diagnostik CTC pada KKR menggunakan metode isolasi dan analisis CTC imunomagnetik seleksi negatif menggunakan Easysep™ dan marker mesenkimal kanker CD44.
Metode: potong lintang dengan populasi terjangkau pasien dewasa yang diduga kanker kolorektal di RSCM selama bulan September 2020 hingga September 2021. Analisis uji diagnostik digunakan untuk mencari titik potong beserta nilai sensitivitas, spesifisitas, nilai duga positif (NDP), nilai duga negatif (NDN), rasio kemungkinan positif (RKP), dan rasio kemungkinan negatif (RKN) CTC dalam mendeteksi KKR.
Hasil: Sebanyak total 80 subjek penelitian, didapatkan mean umur 56 ± 11 tahun. Proporsi subjek berdasarkan jenis kelamin yaitu 46,3% pasien perempuan dan 53,8% pasien lelaki. Sebanyak 77,5% subjek mengalami kanker kolorektal, 7,5% polip adenoma, dan 15% polip inflamasi/ hiperplastik. Uji diagnostik CTC untuk mendeteksi KKR (KKR dibandingkan dengan polip inflamasi/hiperplastik + polip adenoma), dengan titik potong CTC >1,5 sel/mL, didapatkan hasil sensitivitas, spesifisitas, NDP, NDN, RKP, RKN berturut-turut sebesar 50%; 88,89%; 93,94%; 34,04%; 4,5; dan 0,56. Selain itu didapatkan variabel diferensiasi kanker memiliki hubungan yang signifikan (p<0,05) dengan jumlah CTC.
Simpulan: Pemeriksaan CTC memiliki sensitifitas yang rendah dan spesifisitas yang tinggi untuk mendiagnosis KKR. Pemeriksaan ini dapat dipertimbangkan menjadi pemeriksaan penunjang diagnostik non-invasif kanker kolorektal sebelum menjalani pemeriksaan yang lebih invasif yaitu kolonoskopi dan biopsi histopatologi.

Background: Colorectal cancer (CRC) is one of the leading causes of cancer-related morbidity and mortality. The gold standard for diagnosing colorectal cancer is histopathology, which is obtained from a biopsy during colonoscopy. Since not all patients are willing to undergo invasive testing at the outset of the first diagnotic plan, new non-invasive approaches that can complement and enhance strategies for non-invasive diagnosis and management of colorectal cancer are urgently needed. Circulating tumor cells (CTC) in the blood are expected to be used as a non-invasive diagnostic marker in patients with CRC.
Purpose: This research is a diagnostic test of CTC on CRC using the isolation and analysis of negative selection immunomagnetic method with Easysep™ and CD44 cancer mesenchymal marker.
Method: Cross-sectional study of adult patients with suspected colorectal cancer at RSCM during September 2020 to September 2021. Diagnostic study analysis was used to find the cut-off point along with sensitivity, specificity, positive predictive value (PPV), negative predictive value (NPV), positive likelihood ratio (PLR), and negative likelihood ratio (NLR) of CTC in detecting CRC.
Results: A total of 80 research subjects, the mean age was 56 ± 11 years. The proportion of subjects by gender was 46.3% female and 53.8% male patients. A total of 77.5% of the subjects had colorectal cancer, 7.5% adenoma polyps, and 15% inflammatory/ hyperplastic polyps. The CTC diagnostic analysis to detect CRC (CRC compared with inflammatory/hyperplastic polyps + adenoma polyps), with a CTC cut-off point of  > 1.5 cells/mL, showed that the sensitivity, specificity, PPV, NPV, PLR, NLR were 50%; 88.89%; 93.94%; 34.04%; 4.5; and 0.56, respectively. In addition, it was found that the cancer differentiation variable had a significant relationship (p<0.05) with the number of CTCs.
Conclusion: CTC examination has low sensitivity and high specificity for diagnosing CRC. This examination can be considered as a non-invasive diagnostic support for colorectal cancer before undergoing more invasive examinations, which are colonoscopy and histopathological biopsy.
"
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2022
SP-pdf
UI - Tugas Akhir  Universitas Indonesia Library
<<   1 2 3 4 5 6 7 8 9 10   >>