Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Kondisi infertilitas yang dialami oleh Wanita memiliki prevalensi yang tinggi. Kegagalan implantasi salah satu penyebab rendahnya keberhasilan IVF sebagai teknologi reproduksi berbantuan. Defek pada reseptivitas endometrium menyebabkan perkembangan kurang adekuat untuk proses implantasi. Progesteron berperan dalam peningkatan reseptivitas endometrium sehingga perlu dilakukan eksplorasi potensi senyawa bahan alam sebagai dasar pengembangan alternatif terapi alternatif infertilitas. Tujuan dari penelitian ini yaitu melakukan penapisan dan evaluasi senyawa bahan alam yang berpotensi sebagai kandidat modulator reseptor progesteron. Metode yang digunakan adalah penapisan virtual berbasis literatur secara sistematis, simulasi penambatan molekuler; analisis prediksi absorbsi, distribusi, metabolism, ekskresi dan toksisitas (ADMET), simulasi dinamika molekuler dan uji ikatan kompetitif reseptor progesteron secara in vitro. Berdasarkan hasil skrinig literatur informasi terkait 12 senyawa yang memiliki kemampuan modulasi reseptor progesteron. Hasil simulasi penambatan molekuler, analisis ADMET dan simulasi dinamika molekuler diperoleh kandidat 6 senyawa potensial dalam hal pengikatan dengan reseptor progesteron pada situs aktif dan stabil dengan reseptor progesteron serta memiliki profil farmakokinetika yang baik. Senyawa tersebut yaitu apigenin, kaempferol, naringenin, baicalein, paeoniflorin dan e-Guggulsterone. Uji konfirmasi ikatan dengan reseptor progesteron manusia secara in vitro menunjukkan senyawa yang memiliki nilai IC50 paling mendekati dengan kontrol progesteron yaitu apigenin (1,10 μM) dan e-guggulsterone (1,35 μM). Selanjutnya yaitu senyawa Baicalein (13,85 μM), Kaempferol (16 μM) dan Naringenin (47,97 μM). Paeoniflorin (0,98 μM) memiliki nilai IC 50 paling rendah dibandingkan dengan senyawa lainnya akan tetapi grafik menunjukkan tidak adanya perubahan nilai polarisasi terhadap perubahan konsentrasi senyawa sehingga data dianggap tidak valid (R= 0,18). Dapat ditarik kesimpulan kandidat senyawa yang berpotensi untuk dikembangkan sebagai fitoprogestin untuk alternatif terapi pada infertilitas melalui reseptor progesteron yaitu apigenin dan e-guggulsterone.

---

The prevalence of infertility conditions is high in women. Implantation failure is one of the causes of the low success of IVF as an assisted reproductive technology. Defects in endometrial receptivity result in inadequate development for the implantation process. Progesterone plays a role in increasing endometrial receptivity, therefore it is necessary to explore the potential of natural compounds as a basis for developing alternative infertility therapies. The aim of this study is to screen and evaluate natural compounds that potentially to be candidates for progesterone receptor modulators. The methods used are systematic literature screening, molecular docking, absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity (ADMET) prediction analysis, molecular dynamics simulation, and competitive binding assay of progesterone receptors. Based on the results of the literature screening, information related to 12 compounds that have the ability to modulate progesterone receptors. The results of molecular docking simulations, ADMET analysis, and molecular dynamics simulations obtained six potential candidate compounds in terms of binding to the progesterone receptor in the active site, being stable with the progesterone receptor, and having a good pharmacokinetic profile. These compounds are apigenin, kaempferol, naringenin, baicalein, paeoniflorin and e-guggulsterone. The result of assay in confirming the binding to the human progesterone receptor showed that the compound with an IC50 value closest to the control progesterone was apigenin (1.10 μM) and e-guggulsterone (1.35 μM). The next compounds are Baicalein (13.85 μM), Kaempferol (16 μM) and Naringenin (47.97 μM). Paeoniflorin (0.98 μM) has the lowest IC50 value compared to other compounds, but the graph shows no change in polarization value to changes in compound concentration so that the data is considered invalid (R = 0.18). In conclusion, the candidate compounds which have the potential to be developed as a phytoprogestin for alternative therapy for infinfertility via the progesterone receptor are apigenin and e-guggulsterone."

"Penelitian ini membahas pengaruh aktivitas reseptor CXCL4 dan dampaknya terhadap ketidakstabilan plak aterosklerosis terhadap maturasi dan diferensiasi makrofag. Amygdalin menarik perhatian karena potensinya untuk membantu sistem imun. Penelitian ini menggunakan dua pendekatan. Pertama, in silico docking digunakan untuk melihat kemungkinan penemuan obat baru yang menargetkan modulasi makrofag yang disebabkan oleh induksi kemokin CXCL4/PF4. Hasil analisis in silico menunjukkan bahwa amygdalin berikatan dengan CCR1, salah satu reseptor CXCL4. Kedua, penelitian in vitro dilakukan dengan menggunakan PBMC dari sebelas subjek yang sehat. PBMC dikultur dengan M-CSF, CXCL4, atau amygdalin (10 ng/mL atau 20 ng/mL). Meskipun hasil analisa MMP7 secara statistik belum bermakna, pemeriksaan ELISA menunjukkan kecendrungan ekspresi MMP7 yang lebih rendah, yang terkait dengan penurunan kemampuan adhesi molekul. Dapat disimpulkan bahwa amygdalin berpotensi membantu mencegah diferensiasi makrofag M4, yang berpengaruh terhadap ketidakstabilan plak aterosklerosis. Temuan ini masih perlu divalidasi dengan menambah jumlah sampel dan variasi konsentrasi amygdalin. Namun demikian, penelitian ini memberikan wawasan penting tentang kemungkinan obat baru untuk mencegah perkembangan aterosklerosis melalui modulasi makrofag dan implikasi penting molekul MMP7. Penelitian lebih lanjut diperlukan untuk mengetahui lebih mendalam terkait mekanisme ini.

---

This study explores the impact of CXCL4 receptor activity on macrophage maturation, differentiation, and atherosclerotic plaque instability. The potential of amygdalin in supporting the immune system has gained attention. The research employs two methods. Firstly, in silico docking is used to investigate the potential of discovering drugs targeting macrophage modulation induced by CXCL4/PF4 chemokines. The analysis reveals that amygdalin binds to CCR1, one of the CXCL4 receptors. Secondly, an in vitro study using PBMC from eleven

healthy subjects are conducted. PBMCs are cultured with M-CSF, CXCL4, or amygdalin (10 ng/mL or 20 ng/mL).

Although the MMP7 analysis results were not statistically significant, ELISA examination indicates a trend of reduced MMP7 expression, which suggests decreased molecule adhesion capability. In conclusion, amygdalin shows promise in preventing M4 macrophage differentiation, thereby impacting atherosclerotic plaque instability.However, further validation through increased sample size and varying amygdalin concentrations is necessary. Nevertheless, this study offers valuable insights into potential new drugs for atherosclerosis prevention via macrophage modulation and the significance of the MMP7 molecule. Additional research is required to gain a deeper understanding of this mechanism."

"ABSTRAKLatar belakang. Prosedur stimulasi ovarium terkendali pada program FIV berdampak buruk terhadap reseptivitas endometrium. Efek buruk tersebut terjadi karena perubahan kadar hormon yang tidak fisiologis. Laporan penelitian menunjukkan bahwa keberhasilan hamil pada program FIV hanya sekitar 30%.Tujuan penelitian. Menilai dampak pemberian stimulator ovarium terhadap ekspresi petanda reseptivitas endometrium periode implantasi.Metodologi penelitian. Sebanyak 16 ekor Macaca nemestrina dibagi menjadi 4 kelompok: 1 kelompok kontrol dan 3 kelompok perlakuan, berupa pemberian stimulator ovarium dosis 30-70 IU selama 10-12 hari sampai diperoleh puncak sekresi estradiol pada fase folikuler akhir dan dilanjutkan dengan pemberian hCG dosis 3200 IU. Nekropsi jaringan uterus dilakukan hari ke 8-9 setelah puncak sekresi estradiol. Parameter yang dinilai adalah kadar hormon estradiol, progesteron dan ekspresi protein HOXA10, integrin αvβ3 pinopod endometrium dan hubungan hormon steroid dengan ekspresi petanda reseptivitas endometrium.Hasil dan pembahasan. Berdasarkan uji Anova, variasi dosis stimulator ovarium antara 30-70 IU tidak menunjukkan perbedaan bermakna kadar estradiol, progesteron serta ekspresi protein HOXA10 dan integrin αvβ3 antara kelompok kontrol dengan perlakuan (p > 0,05). Berdasarkan Uji korelasi Pearson terdapat hubungan bermakna antara kadar progesteron dengan ekspresi protein HOXA10 dan integrin αvβ3 terutama pada daerah fungsional endometrium ( p < 0,05), sedangkan dengan hormon estradiol tidak terdapat perbedaan yang bermakna (P>0.05). Perkembangan pinopod yang menunjukkan periode jendela implantasi (tahap perkembangan maksimal) diperoleh pada rasio progesteron/estrogen antara 0,20 ? 0,49 dan periode regresi yaitu pada rasio 0,26 ? 7,34.Kesimpulan.Variasi dosis stimulator ovarium 30-70 IU tidak mempengaruhi sekresi hormon estrogen, progesteron dan ekspresi petanda reseptivitas endometrium. Berdasarkan uji regresi Pearson terdapat hubungan bermakna antara hormon progesteron fase folikuler akhir dan fase luteal dengan ekspresi petanda reseptivitas endometrium. Lonjakan estradiol fase folikuler akhir tidak berpengaruh terhadap ekspresi petanda reseptivitas endometrium. Rasio progesteron/estradiol antara 0,20-0,49 menunjukan periode jendela implantasi, sedangkan rasio 0,26 ? 7,34 menunjukkan bahwa perkembangan pinopod mengalami regresi.

---

ABSTRACT

Background.Controlled ovarian stimulation procedure on FIV program adversely affect endometrial receptivity. The adverse effects occur due to non physiological changes in hormone levels. Research reports showed that pregnant success rate of FIV program were only around 30%.

Research objective.To assess the impact of ovarian stimulator on the expression of endometrial receptivity markers of implantation period.

Research methodology.Total of 16 Macaca nemestrinawere divided into four groups, one control group and three treatment groups, ie giving a dose of 30-70 IU ovarian stimulator for 10-12 days to obtain peak estradiol secretion at the end of follicular phase and continued with a dose of 3200 IU of hCG administration. Uterine tissue necropsy was performed 8-9 days after the peak secretion of estradiol. The parameters assessed were levels of the hormones estradiol, progsterone and expression of proteins HOXA10, integrin αvβ3 pinopod endometrium and steroid hormone relationship with the expression of markers of endometrial receptivity.

Results and discussion. Based on analysis of variance (anova), ovarian stimulator dose variation between 30-70 IU showed no significant difference levels of estradiol, progesterone and protein expression of integrin αvβ3 HOXA10 and the control group with treatment (p> 0.05). Based on Pearson correlation test there is a significant correlation between the levels of progesterone with HOXA10 protein expression and integrin αvβ3 especially in the area of functional endometrium (p <0.05), whereas the hormone estradiol no significant difference (P> 0.05). Pinopod development which indicates implantation window period (maximum developmental stage) was obtained in the ratio of progesterone/estrogen between .20 to 0.49 and regression period is the ratio of 0.26 to 7.34.

Conclusion. Variations ovarian stimulator dose of 30-70 IU did not affect the secretion of the hormone estrogen, progesterone and endometrial receptivity marker expression. Based on Pearson regression test there was a significant relationship between the hormone progesterone late follicular phase and the luteal phase endometrial receptivity marker expression. While the surge in late follicular phase estradiol had no effect on the expression of markers of endometrial receptivity. Progesterone/estadiol ratio between 0.20 to 0.49 indicates implantation window period, while the ratio of 0.26 to 7.34 indicates that the development pinopod regresses."

"Pendahuluan: Demam berdarah dengue (DBD) merupakan penyakit infeksi virus dengue (DENV) dengan vektor Aedes aegypti. Pada tahun 2016, terdapat 290 ribu kasus dengue di dunia dan 68.507 kasus DBD di Indonesia pada tahun 2017. Regimen terapi DBD adalah terapi suportif yaitu terapi cairan dan simptomatik. Butil galat memiliki potensi sebagai antiviral dengue. Namun, mekanisme penghambatannya masih belum diketahui sehingga penelitian ini dilakukan untuk mengetahui efek butil galat terhadap penghambatan reseptor dan penempelan virus dengue serotipe 2 (DENV-2) in vitro dan ikatan energi butil galat dengan protein E secara in silico.Metode: Penelitian ini merupakan studi eksperimental untuk menganalisis mekanisme butil galat sebagai antiviral dengue in vitro terhadap DENV-2 menggunakan sel Vero sebagai sel uji dan in silico untuk mengetahui ikatan energi butil galat dengan protein E DENV. Focus assay dan MTT Assay digunakan untuk menilai pengambatan reseptor dan penempelan virus, serta viabilitas sel secara berturut-turut. Konsentrasi butil galat yaitu dua kali IC50. DMSO digunakan sebagai kontrol.Hasil: Persentase hambat pada reseptor dan penempelan virus adalah 28,68% dan 36,10%, viabilitas sel bernilai 108,69% serta ikatan energi bernilai -4,89 kkal/mol dengan konstanta inhibisi 0,26 mM.Kesimpulan: Butil galat memiliki efek penghambatan penempelan virus yang lebih baik daripada reseptor serta memiliki ikatan yang baik dengan protein E.

---

Introduction: Dengue hemorrhagic fever (DHF) is an infectious disease caused by dengue virus (DENV) with vector Aedes aegypti. In 2016, 290 thousand people were diagnosed with DHF. In 2017, there are 68,507 DHF cases in Indonesia. Therapy regiment of DHF are supportive treatments; fluid therapy and symptomatic therapy. Butyl gallate has potential antiviral activity against dengue serotype 2 virus (DENV-2). However, the inhibitory mechanism is still unknown. Therefore, this research aims to find out the effect of butyl gallate in receptor and virus attachment inhibition of DENV-2 in vitro and binding energy between butyl gallate and protein E DENV in silico.

Method: Experimental study was done to analyze butyl gallate mechanism as dengue antiviral in vitro to DENV-2 using Vero cell as test cell and in silico to calculate binding energy between butyl gallate and DENV’s E protein. Focus assay and MTT assay were used to evaluate receptor inhibition and virus attachment as well as cell viability, respectively. Butyl gallate concentration was twice that of IC50. DMSO was used as control.

Results: Inhibition percentage on receptor and virus attachment yielded 28.68% and 36.10%, Cell viability yielded 108.69%, and energy bond valued -4.89 kcal/mol with inhibition constant of 0.26 mM

Conclusion: Butyl gallate had higher inhibition effect on virus attachment compared to receptor and had stronger bond with E protein.

"

"Pendahuluan: Infeksi virus dengue merupakan infeksi yang paling banyak terjadi di Indonesia. Terapi infeksi dengue umumnya bersifat suportif berupa terapi cairan dan simptomatik. Berdasarkan penelitian sebelumnya, quercetin diketahui memiliki potensi sebagai antiviral dengue. Namun, mekanisme penghambatannya belum diketahui. Penelitian ini bertujuan untuk menilai persentase hambatan quercetin pada mekanisme penghambatan reseptor dan penempelan virus dengue serotipe 2 (DENV-2), persentase viabilitas sel terhadap quercetin, serta ikatan energi antara quercetin dengan protein E pada DENV secara in silico. Metode: Senyawa diuji secara in vitro terhadap DENV-2 menggunakan sel Vero. Dilakukan dua jenis pengujian, yaitu uji penghambatan reseptor dan penempelan virus melalui uji fokus dan uji viabilitas sel melalui uji MTT. Konsentrasi quercetin yang digunakan sebagai uji adalah sebesar 2 kali IC50 (36,81 µg/ml). Pengujian hambatan secara in silico dengan menggunakan software Autodock Tools - 1.5.6. Hasil: Nilai persentase penghambatan pada reseptor dan penempelan DENV dengan quercetin adalah 23,53% dan 45%. Persentase viabilitas sel vero terhadap quercetin pada penghambatan tahap pra-infeksi adalah 109,82%. Interaksi antara quercetin dan protein E DENV memiliki nilai ikatan energi dan konstanta inhibisi pada konformasi terbaik sebesar -4,89 kkal/mol dan 0,26 mM. Kesimpulan: Quercetin berpotensi sebagai antiviral dengue melalui mekanisme penghambatan pada tahap pra-infeksi, terutama penghambatan penempelan virus

---

Introduction: Viral dengue infection is the most common infection in Indonesi. Nowadays, management of DHF is only supportive care, i.e, fluid and symptomatic therapy. Based on previous research, quercetin has potency as antiviral dengue, but the mechanism is still unknown. Thus, the purpose of this research is to evaluate the percentage of reseptor inhibition and dengue serotype 2 virus (DENV-2) attachments inhibition with quercetin, cell viability percentage against quercetin, and energy bond between quercetin and protein E DENV in silico. Method: The compound was tested in vitro against DENV-2 using Vero Cells. There were 2 type of tests, receptor and DENV attachment inhibitory test using focus assay and viability test using MTT assay. The quercetin concentration was 2 times IC50 (36,81µg/ml). In silico study was conducted using Autodock Tools – 1.5.6. Results: Inbitory percentage of reseptor and DENV attachment with quercetin were 23,53% and 45%. Vero cell viability against quercetin in pre-infection step was 109,82%. Energy bond and inhibition constanta between quercetin and protein E DENV were -4,89 kkal/mol and 0,26 mM. Conclusion: This study shows that quercetin has potency as antiviral dengue through DENV attachment inhibition.

"

"Salah satu peran industri farmasi adalah untuk mengembangkan agen terapetik yang dapat mencegah, mengurangi, atau menyembuhkan penyakit. Kunci untuk mencapai peran ini adalah melalui penemuan dari senyawa-senyawa baru dapat diandalkan untuk menjadi agen terapetik yang baru. Metode yang saat ini sedang marak dikembangkan adalah pencarian obat dengan menggunakan in silico screening atau dikenal pula dengan nama virtual screening.Salah satu penyakit endemik yang muncul pada abad 20-an adalah AIDS (Acquired Immunodeficiency Syndrome) yang disebabkan oleh Human Immunodeficiency Virus tipe 1 (HIV-1). Virus ini cepat bermutasi sehingga menyebabkan belum adanya obat yang dapat menyembuhkan penyakit ini secara total. Salah satu target enzim yang dapat diinhibisi untuk menghambat replikasi virus adalah protease HIV-1.Pada penelitian kali ini dilakukan virtual screening dengan menggunakan perangkat lunak GOLD untuk mencari kandidat obat inhibitor Protease HIV-1 dengan menggunakan database Tanaman Obat di Indonesia. Virtual screening yang dilakukan adalah structure based virtual screening.Berdasarkan hasil dari virtual screening ini diperoleh 10 kandidat senyawa obat yang diharapkan dapat menjadi obat protease inhibitor. Senyawa tersebut antara lain Quercetin 7,4'-diglucoside, 4-Methylpentyl glucosinolate, Quercetin 3-rutinoside, Glucoraphenin, Glucobrassicin, Luteolin 3'- methylether7-manosyl-(1-2)alloside, Apigenin-7-O(6"-O-p-coumaroylglucoside), Cyanidin 7(3-glucosil-6-malonylglucoside)4'-glucoside, Sinalbin dan 4-Methylsulfinyl butyl glucosinolate dengan kisaran GoldScore dari 86.2803 sampai 95.6252.

---

One role of the pharmaceutical industry is to develop therapeutic agents that can prevent, reduce or cure disease. The key to achieve this role is through the discovery of new compounds that can be counted to be a new therapeutic agent. Recent method being developed is searching a new drug using in silico screening, or also known as virtual screening.One of the endemic disease emerged in the 20th century is AIDS (Acquired Immunodeficiency Syndrome) caused by Human Immunodeficiency Virus type 1 (HIV-1). This virus mutates rapidly causing no drug that can cure this disease completely. One of enzyme target that can be inhibited to block the replication of this virus is HIV-1 protease. Inhibition to the enzyme cause the blocking of protein cleavage in virus maturation process.In this research, virtual screening was performed using GOLD software to find drug candidates as HIV-1 protease inhibitor using the database Tanaman Obat di Indonesia (database of Medicinal Plants in Indonesia). The virtual screening performed was a structure based virtual screening.Based on the results obtained from the virtual screening there were 10 drug candidates which expected to be a protease inhibitor. These compounds were Quercetin 7,4'-diglucoside, 4-Methylpentyl glucosinolate, Quercetin 3-rutinoside, Glucoraphenin, Glucobrassicin, Luteolin 3'-methylether7-manosyl-(1-2)alloside, Apigenin-7-O(6"-O-p-coumaroylglucoside), Cyanidin 7(3-glucosil-6-malonylglucoside)4'-glucoside, Sinalbin dan 4-Methylsulfinyl butyl glucosinolate with GoldScore ranged from 86.2803 to 95.6252."

"Penyakit tuberkulosis (TB) merupakan penyakit mudah menular yang disebabkan oleh bakteri Mycobacterium Tuberkulosis (MTB) yang merupakan patogen paru-paru yang juga dapat menyebar ke seluruh bagian tubuh. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh senyawa obat TB yang akan menyerang protein Topoisomerase I pada mtb, menggunakan inhibitor senyawa peptida siklis. Protein Topoisomerase I dijadikan sebagai target obat dalam penelitian ini, karena fungsinya yang penting dalam mengurangi masalah topologi DNA pada mtb. Struktur 3D Topoisomerase I mtb diunduh dari Protein Data Bank (PDB). Senyawa peptida siklis dan standar yang digunakan pada penelitian ini diperoleh dari data base PubChem. Proses simulasi penambatan molekul dilakukan menggunakan perangkat lunak Molecular Operating Environment (MOE). Proses simulasi penambatan molekul dilakukan dengan menggunakan protokol rigid dan fleksibel. Proses ini menghasilkan 21 ligan peptida siklis terbaik yang memiliki energi ikat bebas negatif. Dari hasil penelitian, didapatkan ligan Cochinmicin I sebagai kandidat obat terbaik, karena memiliki sifat ADME, toksisitas dan sifat kimia obat yang paling baik.

---

Tuberculosis (TB) is a contagious disease caused by the bacteria Mycobacterium Tuberculosis (MTB), which is a lung pathogen that can also spread to all parts of the body. This study aims to obtain TB drug compounds that will attack the Topoisomerase I protein on MTB, using a cyclic peptide compound inhibitor. Topoisomerase I protein was used as a drug target in this study, because of its important function in reducing DNA topological problems in MTB. The 3D Topoisomerase I MTB structure was downloaded from the Protein Data Bank (PDB). The cyclic peptide compounds and standards used in this study were obtained from the PubChem database. The molecular docking simulation process is carried out using Molecular Operating Environment (MOE) software. The molecular docking simulation process is carried out using a rigid and flexible protocol. This process produces the best 21 cyclic peptide ligands which have negative free binding energy. From the research results, it was found that the Cochinmicin I ligand was the best drug candidate because it had the best ADME properties, toxicity and chemical properties of the drug."

"Kanker kolorektal merupakan masalah kesehatan masyarakat global dengan prevalensi tinggi yang pengobatannya masih memiliki keterbatasan. Senyawa flavonoid terutama kuersetin dinilai memiliki aktivitas biologis sebagai antikanker, sehingga beberapa senyawa flavonoid lainnya diharapkan juga memiliki aktivitas serupa. Tujuan dari studi ini adalah melakukan analisis secara in-silico dan in-vitro terhadap beberapa senyawa flavonoid terutama kuersetin dan turunannya sebagai agen apoptosis sel kanker kolorektal HT-29. Metode yang dilakukan secara in-silico meliputi jejaring farmakologi dan simulasi molekuler. Senyawa terbaik berdasarkan analisis in-silico diuji secara in-vitro dengan menilai aktivitas sitotoksisitasnya pada sel HT-29 menggunakan metode MTT Assay dan apoptosisnya dianalisis menggunakan flow cytometry. Protein target yang memiliki interaksi dengan kuersetin dan senyawa turunannya yaitu AKT1, APAF1, BCL2, CASP3, MAPK1 dan CASP9. Berdasarkan analisis prediksi ADMET, kuersetin dan turunannya masuk dalam kategori aman sebagai kandidat obat. Dua senyawa terbaik berdasarkan analisis in-silico yakni isoramnetin dan isokuersitrin dipilih untuk diuji secara in-vitro. Aktivitas sitotoksik kuersetin, isoramnetin dan isokuersitrin terhadap sel HT-29 dinyatakan dengan nilai CC50 berturut-turut 158,92mm + 5,4, 65,52mm + 5,0 dan 47,59mm + 2,5. Aktivitas apoptosis mencapai 16,7% hingga 62,4% jika dibandingkan dengan kontrol sel. Isoramnetin dan Isokuersitrin sebagai senyawa flavonoid turunan kuersetin berpotensi sebagai agen apoptosis sel kanker kolorektal HT-29.Kanker kolorektal merupakan masalah kesehatan masyarakat global dengan prevalensi tinggi yang pengobatannya masih memiliki keterbatasan. Senyawa flavonoid terutama kuersetin dinilai memiliki aktivitas biologis sebagai antikanker, sehingga beberapa senyawa flavonoid lainnya diharapkan juga memiliki aktivitas serupa. Tujuan dari studi ini adalah melakukan analisis secara in-silico dan in-vitro terhadap beberapa senyawa flavonoid terutama kuersetin dan turunannya sebagai agen apoptosis sel kanker kolorektal HT-29. Metode yang dilakukan secara in-silico meliputi jejaring farmakologi dan simulasi molekuler. Senyawa terbaik berdasarkan analisis in-silico diuji secara in-vitro dengan menilai aktivitas sitotoksisitasnya pada sel HT-29 menggunakan metode MTT Assay dan apoptosisnya dianalisis menggunakan flow cytometry. Protein target yang memiliki interaksi dengan kuersetin dan senyawa turunannya yaitu AKT1, APAF1, BCL2, CASP3, MAPK1 dan CASP9. Berdasarkan analisis prediksi ADMET, kuersetin dan turunannya masuk dalam kategori aman sebagai kandidat obat. Dua senyawa terbaik berdasarkan analisis in-silico yakni isoramnetin dan isokuersitrin dipilih untuk diuji secara in-vitro. Aktivitas sitotoksik kuersetin, isoramnetin dan isokuersitrin terhadap sel HT-29 dinyatakan dengan nilai CC50 berturut-turut 158,92mm + 5,4, 65,52mm + 5,0 dan 47,59mm + 2,5. Aktivitas apoptosis mencapai 16,7% hingga 62,4% jika dibandingkan dengan kontrol sel. Isoramnetin dan Isokuersitrin sebagai senyawa flavonoid turunan kuersetin berpotensi sebagai agen apoptosis sel kanker kolorektal HT-29.

---

Colorectal cancer is a global public health problem with a high prevalence, and its treatment still has limitations. Flavonoid compounds, especially quercetin, are considered to have biological activity as an anticancer, so several other flavonoid compounds are also expected to have similar activity. This study aimed to perform in-silico and in-vitro analysis of several flavonoid compounds, especially quercetin and its derivatives as apoptotic agents for colorectal cancer cells HT-29. The in silico method includes network pharmacology and molecular simulations. The best compounds based on in silico analysis were tested in-vitro by assessing their cytotoxic activity in HT-29 cells using the MTT Assay method. Their apoptosis was analyzed using flow cytometry. Target proteins interacting with quercetin and its derivatives are AKT1, APAF1, BCL2, CASP3, MAPK1 and CASP9. Based on ADMET prediction analysis, quercetin and its derivatives are included in the safe category as drug candidates. The best compounds based on in-silico analysis, isorhamnetin and isoquercitrin, were selected to be tested in-vitro. The cytotoxic activity of quercetin, isorhamnetin and isoquercitrin against HT-29 cells was expressed by CC50 values of 158.92 mm + 5.4, 65.52 mm + 5.0 and 47.59 mm + 2.5, respectively. Apoptotic activity reached 16.7% to 62.4% when compared to control cells. Isoramnetin and isoquercitrin, flavonoid compounds derived from quercetin, have potential apoptotic agents for HT-29 colorectal cancer cells."

"Penyakit demam berdarah dengue masih menjadi permasalahan kesehatan global, dan merupakan penyakit yang endemik di lebih dari 100 negara. Mengetahui efek dari mutasi pada virus sangat penting pada prosesmdesain dan pengembangan obat. Pada penelitian ini, mutasi dan pengaruhnya dianalisis pada NS5 virus dengue dengan menggunakan protein kode 3P8Z sebagai sekuens utama. Berdasarkan hasil analisis mutasi terjadi pada sekuen NS5 virus dengue serotipe 3. Glutamin menjadi metionin pada posisi 10 dan treonin menjadi isoleusin pada posisi 55. Residu yang termutasi merupakan bagian dari domain SAdenosyl-L-Methionine-Dependent Methyltransferase (IPR029063), adanya mutasi diprediksikan dapat mengganggu fungsi protein.Berdasarkan hasil penambatan molekul, dari 100 senyawa terbaik hanya 17 senyawa antiviral yang terpilih. Pada penelitian ini penentuan ligan terbaik tidak hanya berdasarkan hasil penambatan molekul, tetapi juga melalui tahapan prediksi ADMET (Absorpsi, Distribusi, Metabolisme, Ekskresi dan Toksisitas),bioavailabilitas serta efek ligan terhadap kesehatan. Terdapat 3 ligan terbaik yang dapat diusulkan sebagai kandidat antiviral pada virus dengue yaitu UNQ15038, UNQ16938 dan UNQ14727. Studi simulasi dinamika molekuler menunjukkan bahwa kompleks protein-ligan stabil pada temperatur 310 K dan 312 K. Kompleks paling stabil terdapat pada kompleks protein 3P8Z dengan ligan UNQ15038.

---

Dengue fever is still a major health problem, which is endemic in more than 100 countries. Information about the effects of the virus mutation is important in drug design and development. In this research, the mutations and their effects were analyzed in NS5 dengue virus by using 3P8Z protein as the main sequence. The result of mutation analysis showed that mutation occurs in NS5 of DENV serotype 3. Glutamine mutates into methionine at position 10 and threonine mutates into isoleucine at position 55. These residues are part of the domain named S-Adenosyl-L-Methionine-Dependent Methyltransferase (IPR029063). The wildtype and mutant residue have the different properties, which can disturb this domain and abolish its function.Based on the result of molecular docking simulation, from 100 best compounds only 17 compounds werenselected. Determination of the best ligand not only based on molecular docking simulation but also analyze the ADMET (absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity), bioavailability and health effect of the ligands. There are three best ligands that can be proposed as antiviral candidates, the ligands are UNQ15038, UNQ16948 and UNQ14727. Molecular dynamics simulation study showed that the protein-ligand complexes are stable at temperature 310 K and 312 K. The most stable complex is the protein 3P8Z with ligand UNQ15038."

"Agen pencerah kulit sintetik dinilai kurang aman untuk digunakan karena dapat menimbulkan efek samping pada penggunaan jangka panjang. Oleh karena itu, dilakukan pencarian bahan-bahan pencerah kulit berbasis tanaman yang lebih aman. Penelitian ini dilakukan untuk memperoleh tanaman Indonesia yang memiliki potensi sebagai inhibitor tirosinase menggunakan penapisan in silico dengan piranti lunak penambatan molekul AutoDock Vina. Pengujian secara in vitro terhadap penghambatan tirosinase dilakukan terhadap ekstrak dan fraksi daun trengguli (Cassia fistula L.) yang mengandung senyawa ent-epikatekin-(4α→8)-ent-epikatekin dan clitorin yang menempati peringkat 10 besar dari hasil penapisan virtual. Pengujian aktivitas penghambatan tirosinase dilakukan dengan mengukur penurunan intensitas warna yang menunjukkan penghambatan pembentukan dopakrom dalam reaksi L-DOPA-tirosinase. Parameter adanya aktivitas ditunjukkan oleh nilai IC50 dan persentase inhibisi. Hasil uji aktivitas penghambatan tirosinase menunjukkan fraksi air daun trengguli (Cassia fistula L.) memiliki nilai IC50 tertinggi (152,031 µg/mL). Uji kinetika enzim menunjukkan fraksi air daun trengguli menginhibisi tirosinase secara kompetitif campuran. Hasil identifikasi golongan senyawa menunjukkan bahwa fraksi air daun trengguli mengandung alkaloid, flavonoid, glikosida, fenol, dan tanin.

---

Synthetic skin lightening agents are considered less safe to use because it can cause side effects in long term use. Because of that, recent researches are aimed to search plant-based skin lightening agents which is considered safer. This research was conducted to obtain Indonesian plants that have potential as tyrosinase inhibitors using in silico screening with AutoDock Vina. In vitro assay on the inhibition of tyrosinase was performed on extract and fractions of trengguli leaves (Cassia fistula L.) containing ent-epicatechin-(4α→8)-ent-epicatechin and clitorin which ranks the top 10 results of virtual screening. Tyrosinase inhibitory activity assay performed by measuring the decrease in the intensity of color that suggests inhibition of dopachrome formation resulted from L-DOPA-tyrosinase reaction. The parameters of the activity shown by the IC50 values ​​and the percentage of inhibition. The test results showed tyrosinase inhibitory activity of water fraction of trengguli leaves extract (Cassia fistula L.) had the highest IC50 values ​​(152.031 µg/mL). Enzyme kinetics assay showed that water fraction of trengguli leaves extract inhibits tyrosinase with mixed inhibition type. Phytochemical screening showed that water fraction of trengguli leaves extract contain alkaloids, flavonoids, glycosides, phenols, and tannins."