Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Kasus chronic pulmonary aspergillosis (CPA) di Indonesia memiliki prevalensi ±83.000 penderita dengan penambahan kasus baru sebanyak 17.561 pasien dengan riwayat tuberkulosis paru-paru setiap tahunnya, disebabkan oleh kapang Aspergillus spp. Gen calmodulin (CaM) merupakan markah genetik Aspergillus yang memiliki spesifikasi sekuens tinggi untuk membedakan tiap spesies Aspergillus, namun studi mengenai profil sekuensnya pada isolat penderita CPA pasca tuberkulosis di Indonesia belum ditemukan laporannya. Penelitian ini menggunakan gen CaM untuk dianalisis sekuens DNA-nya sekaligus mengidentifikasi dan memantau spesies Aspergillus dari 31 isolat spesimen klinis pasien CPA beriwayat tuberkulosis paru-paru dari 6 rumah sakit umum di Jakarta. Ekstraksi DNA dilakukan menggunakan metode PCI lalu gen CaM diamplifikasi dengan primer Cmd5 dan Cmd6, selanjutnya dilakukan sekuensing DNA. Hasil menunjukkan sekuens gen CaM Aspergillus spp. memiliki wilayah lestari dan polimorfik khas antar spesies intraseksi maupun interseksi (Nigri, Fumigati, dan Flavi). Hasil identifikasi molekuler menunjukkan spesies terdiri dari A. niger (n = 3), A. fumigatus (n = 17), A. flavus (n = 4), A. tubingensis (n = 2), A. welwitschiae (n = 2), A. tamarii (n = 2), dan A. brunneoviolaceus (n = 1). Spesies A. welwitschiae dan A. tamarii dikonfirmasi menjadi salah satu spesies kriptik penyebab CPA pada pasien beriwayat tuberkulosis paru-paru di Jakarta, Indonesia.

---

The number of chronic pulmonary aspergillosis (CPA) cases in Indonesia reached a prevalence number ±83.000 patients with increasing rate of 17.561 patients with lung tuberculosis medical history each year, caused by Aspergillus fungi. Calmodulin (CaM) gene is a biomarker for Aspergillus which has high sequence specifity to distinguish among species within the group, however a report to characterize its sequence profile on post-tuberculosis CPA isolates in Indonesia has not yet been found. The aims of this research are to conduct sequence analysis on Aspergillus CaM genes, also to identify and monitor the species from 31 isolates of post-tuberculosis CPA patient’s clinical specimens obtained from 6 public hospital in Jakarta. The results showed that CaM gene from Aspergillus spp. have unique conserved and polymorphic regions both intra/intersectionally (among Nigri, Fumigati, and Flavi) within the genus. The molecular identification results revealed a species consisiting A. niger (n = 3), A. fumigatus (n = 17), A. flavus (n = 4), A. tubingensis (n = 2), A. welwitschiae (n = 2), A. tamarii (n = 2), and A. brunneoviolaceus (n = 1). A. welwitschiae and A. tamarii are confirmed to be one of cryptic species responsible for causing human post-tuberculosis CPA in Jakarta, Indonesia.

"

"Latar belakang: Tuberkulosis (TB) dapat menimbulkan komplikasi yang disebabkan oleh infeksi Aspergillus spp, yaitu Aspergillosis Paru Kronik (APK) pada kavitasi di paru. Enzyme-linked Immunosorbent Assay (ELISA) otomatis dan Uji Imunokromatografi (ICT) adalah dua dari metode-metode yang menunjang diagnosis klinis APK. Kedua metode tersebut mendeteksi antibodi Aspergillus spp. Keduanya memiliki keunggulan dan kekurangan masing-masing, namun belum ada studi yang membandingkan hasil dari performa diagnosis APK kedua uji tersebut pada pasien akhir pengobatan TB. Metode: Penelitian ini bersifat deskriptif analitik dengan desain potong lintang. Pemeriksaan ELISA otomatis subjek memiliki ambang > 11,5 sebagai hasil positif. Pemeriksaan ICT subjek memiliki hasil positif jika terlihat garis pada masing-masing kolom T dan C, sedangkan hasil positif hanya terlihat satu garis pada kolom C. Hasil: Jumlah subjek keseluruhan adalah 62 subjek dan diperoleh 20 (32,3%) subjek terdiagnosis APK. Hasil positif pemeriksaan ELISA otomatis adalah 27 (43,5%) subjek, sedangkan pemeriksaan ICT adalah 2 (3,2%) subjek. Sensitivitas dan spesifisitas ELISA otomatis masing-masing adalah 75% dan 71,43%, sedangkan ICT adalah 10% dan 100%. Simpulan: ELISA otomatis memiliki performa diagnosis yang lebih baik dibandingkan ICT untuk diagnosis APK, namun ELISA otomatis masih belum tersedia secara adekuat di wilayah Indonesia sehingga penggunaan ICT tetap digunakan sebagai pemeriksaan APK.

---

Introduction: Tuberculosis (TB) can cause complications caused by Aspergillus spp infection, namely Chronic Pulmonary Aspergillosis (CPA) in cavitation of the lungs. Automated Enzyme-linked Immunosorbent Assay (ELISA) and Immunochromatography Test (ICT) are two of the methods that support the clinical diagnosis of CPA. Both methods detect Aspergillus spp. antibodies. Both have their advantages and disadvantages, but there is no study that compares the results of the diagnostic performance of the CPA of the two tests in patients at the end of TB treatment.

Methods: This research was analytic descriptive with a cross-sectional design. Automated ELISA examination of subjects had a threshold > 11.5 as a positive result. ICT examination of subjects had positive results if there was a line in each T and C columns, while positive results only showed one line in C column.

Results: The total number of subjects were 62 subjects and 20 (32.3%) subjects diagnosed with CPA. Subjects showed positive results of automated ELISA examination were 27 (43.5%) subjects, while ICT examinations were 2 (3.2%) subjects. The sensitivity and specificity of the automated ELISA were 75% and 71.43%, respectively, while the ICT was 10% and 100%.

Conclusion: Automated ELISA has better diagnostic performance than ICT for CPA diagnosis, but automated ELISA was not adequately available in the Indonesian region so ICT was still used as CPA examination."

"Tingginya kasus TB paru di Indonesia meningkatkan risiko terjadinya infeksi jamur paru, termasuk Aspergillus spp. yang menyebabkan aspergilosis paru kronik (APK). Identifikasi Aspergillus sampai tingkat spesies perlu dilakukan karena setiap spesies memiliki kepekaan yang berbeda terhadap obat antijamur. Identifikasi fenotipik pada beberapa spesies yang berbeda mungkin identik, sehingga identifikasi molekuler diperlukan untuk memastikan identifikasi spesies. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi Aspergillus spp. yang diisolasi dari pasien diduga APK dan kepekaannya terhadap obat antijamur. Identifikasi dilakukan dengan metode fenotipik, dilanjutkan dengan uji kepekaan menggunakan metode difusi cakram. Isolat resisten dikonfirmasi dengan identifikasi molekuler menggunakan teknik PCR pada target daerah ITS rDNA dan gen BenA. Identifikasi fenotipik 49 isolat Aspergillus yang berasal dari 39 sputum pasien menunjukkan 25 (51%) isolat A. fumigatus, 17 (34,6%) isolat A. niger, enam (12,2%) isolat A. flavus dan satu (2%) isolat A. clavatus. Uji kepekaan menunjukkan 15 (30,6%) isolat resisten terhadap vorikonazol dan atau itrakonazol yang selanjutnya dikonfirmasi dengan identifikasi molekuler. Hasil sekuensing menunjukkan 11 (73,3%) isolat A. fumigatus, dua (13,3%) isolat A. flavus, satu (6,7%) isolat A. niger, dan satu (6,7%) isolat A. clavatus . Identifikasi fenotipik dan genotipk isolat resisten menunjukkan kesesuaian.

---

The increase number of pulmonary tuberculosis (PTB) can increase the risk to pulmonary fungal infections, including Aspergillus spp. that causes chronic pulmonary aspergillosis (CPA). Aspergillus identification to the species level is necessary because each species has a different sensitivity to antifungal agents. The phenotypic identification in some different species may be identical, therefore, the molecular method is recommended to confirm the species. The study aimed to identify Aspergillus isolated from suspected CPA patients and their susceptibility profile to antifungal drugs. Fungal identification was conducted by phenotypic method, while the susceptibility testing performed with disk-diffusion method. The resistant isolates were confirmed by molecular identification using PCR technique in the target area of the ITS rDNA region and BenA gene. The phenotypic identification of 49 Aspergillus isolated from 39 sputum sample showed 25 (51%) isolates of A. fumigatus, 17 (34,6%) isolates of A. niger, six isolates of A. flavus, and one (2%) isolate A. clavatus. The susceptibility testing showed 15 (30,6%) resistant isolates were resistant to voriconazole and or itraconazole which was further confirmed by molecular identification. The sequencing results obtained 11 (73,3%) isolates of A. fumigatus, two (13,3%) isolates of A. flavus, one (6,7%) isolate of A. niger, and one (6,7%) isolate A. clavatus. The results of phenotypic and molecular examinations showed the congruence of the results."

"Latar Belakang: Aspergilosis paru kronik (APK) dapat menjadi komplikasi infeksi tuberkulosis (TB) paru yang telah diobati. Gejala klinis APK dengan TB paru sangat mirip, sehingga sulit dibedakan. Diagnosis APK ditetapkan sesuai konsensus berdasarkan gejala klinis, hasil pemeriksaan radiologi dan laboratorium mikologi. Pemeriksaan antibodi dengan imunoglobulin G (IgG) spesifik Aspergillus menggunakan metode Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) dapat membantu diagnosis APK. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakteristik klinis, profil IgG spesifik Aspergillus, serta prevalensi APK pada pasien bekas TB di beberapa rumah sakit di Jakarta.Metode: Penelitian prospektif dengan desain potong lintang ini dilakukan pada April 2019 - Februari 2020. Pemilihan subjek dilakukan dengan metode consecutive sampling. Subjek merupakan pasien bekas TB yang berasal dari poli rawat jalan dan rawat inap Rumah Sakit Umum Pusat Rujukan Respirasi Persahabatan Jakarta dan Rumah Sakit Graha Permata Ibu. Pemeriksaan IgG spesifik Aspergillus dan biakan sputum jamur dilakukan di Laboratorium Departemen Parasitologi FKUI.Hasil: Dari 97 pasien yang sesuai dengan kriteria penerimaan, 66 pasien (68%) berjenis kelamin laki-laki dan rerata usia 51,8±13,6 tahun. Gejala klinis lebih dari 3 bulan yang dilaporkan berupa mudah lelah (38,4%), sesak napas (34,02%), batuk (30,93%), hemoptisis (27,84%), penurunan berat badan (23,71%), dan nyeri dada (19,6%). Gambaran radiologi terkait APK berupa ektasis (57,8%), kavitas (27,8%), penebalan pleura (26,8%), fibrosis parakavitas (18,6%), dan bola jamur (6,2%). Hasil pemeriksaan IgG spesifik Aspergillus positif dilaporkan pada 51 pasien (52,6%), sedangkan biakan sputum jamur Aspergillus didapatkan pada 43 pasien (44,3%). Berdasarkan analisis hasil-hasil pemeriksaan tersebut, diagnosis APK ditegakkan pada 28 pasien (28,9%).Kesimpulan: Profil IgG spesifik Aspergillus pada 97 pasien bekas TB dalam penelitian ini menunjukkan hasil positif pada 51 pasien (52,6%). Gejala klinis lebih dari 3 bulan yang dilaporkan berupa batuk lama, hemoptisis, penurunan berat badan, mudah lelah, dan sesak napas. Gambaran radiologi terkait APK berupa ektasis, kavitas, penebalan pleura, fibrosis parakavitas, dan bola jamur. Prevalensi APK berdasarkan hasil-hasil pemeriksaan tersebut adalah 28,9%.

---

Introduction: Chronic pulmonary aspergillosis (CPA) might become a complication of pulmonary tuberculosis (TB) that has been treated. The clinical symptoms of CPA can resemble with PTB, making it difficult to distinguish. The diagnosis of CPA is determined by the consensus based on clinical symptoms, radiological features, and mycological results. Antibody detection with Aspergillus- specific immunoglobulin G (IgG) using the Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) method can contribute to CPA diagnosis. This study aims to determine the clinical characteristics, Aspergillus-specific IgG detection, and the prevalence of CPA in prior TB patients at several hospitals in Jakarta.

Method: This prospective cross-sectional study was conducted in April 2019 - February 2020. Patients recruitment was carried out by consecutive sampling method. Subjects were prior TB patients at Persahabatan National Respiratory Referral Hospital and Graha Permata Ibu Hospital. Detection of Aspergillus- specific IgG and fungal cultures from sputum were carried out in the Laboratory of the Parasitology Department, FMUI.

Results: Of 97 patients recruited according to inclusion criteria, 66 patients (68%) were male and the mean age was 51.8 ± 13.6 years. The clinical symptoms of more than 3 months were fatigue (38.4%), shortness of breath (34.02%), cough (30.93%), hemoptysis (27.84%), weight loss (23, 71%), and chest pain (19,6%). Radiological features associated with CPA were ectasis (57.8%), cavity (27.8%), pleural thickening (26.8%), para-cavitary fibrosis (18.6%), and fungal ball (6.2%). The Aspergillus-specific IgG positive were reported in 51 patients (52.6%), whereas Aspergillus sputum cultures were found in 43 patients (44.3%). Based on the analysis of those examinations, the diagnosis of CPA was determined in 28 patients (28.9%).

Conclusion: The detection of Aspergillus-specific IgG in 97 prior TB patients showed the positive results in 51 patients (52.6%). The clinical symptoms more than three months were fatigue, shortness of breath, cough, hemoptysis, and weight loss. The radiological features related to CPA were ectasis, cavitary lesions, pleural thickening, paracavitary fibrosis, and fungal ball. The prevalence of CPA based on those examinations was 28.9%."

"Latar belakang: Aspergillosis paru kronik (APK) menjadi salah satu penyakit yang sering ditemukan pada pasien dengan kerusakan jaringan paru, misalnya tuberkulosis (TB). Deteksi antibodi Aspergillus merupakan modalitas utama pendukung diagnosis APK. Penelitian ini, bertujuan untuk mengetahui cut-off optimal ELISA manual Bordier dalam deteksi antibodi Aspergillus di Indonesia. Metode: Penelitian ini menggunakan desain studi potong lintang. Pemeriksaan sampel menggunakan metode ELISA manual Bordier sebagai uji diagnostik APK. Data yang diperoleh dianalisis untuk menentukan cut-off optimal pemeriksaan.Hasil: Sebagian besar subjek penelitian merupakan kelompok usia <60 tahun (89,1%) dengan rentang usia 17-72 tahun dan median 34 tahun. Cut-off optimal memberikan sensitivitas 43,48% dan spesifitas 100%. Sedangkan, sensitivitas pada cut-off 0.780, 0.850 dan 0.930 menunjukkan sensitivitas yang lebih baik dibandingkan dengan cut-off 1,595 dan cut-off pabrik (>1,0). Diabetes (15,6%) dan asma (10,9%) diketahui menjadi temuan yang lebih banyak pada pasien APK dibandingkan penyakit komorbid lainnya. Kesimpulan: ELISA manual Bordier cut-off 1,595 dengan spesifitas 100%, dapat menjadi alat skrining awal diagnosis APK. Hasil positif pada pemeriksaan disertai gejala klinis dan radiologis mengarah APK dapat digunakan untuk menegakkan diagnosis, sedangkan hasil negatif membutuhkan investigasi lanjut dengan pemeriksaan ELISA otomatis.

---

Introduction: Chronic pulmonary aspergillosis (APK) is one of the diseases that are often found in patients with lung tissue damage, for example tuberculosis (TB). Aspergillus antibody detection is the main modality supporting the diagnosis of APK. This study aims to determine the optimal cut-off of Bordier's manual ELISA in the detection of Aspergillus antibodies in Indonesia.

Method: This study used a cross-sectional study design. Sampel examination using Bordier's manual ELISA method as a diagnostic APK test. The data obtained are analyzed to determine the optimal cut-off of the examination.

Result: Most of the study subjects were <60 years old age group (89.1%) with an age range of 17-72 years and a median of 34 years. The optimal cut-off provides 43.48% sensitivity and 100% specificity. Meanwhile, the sensitivity at cut-offs of 0.780, 0.850 and 0.930 showed better sensitivity compared to cut-offs of 1.595 and factory cut-offs (>1.0). Diabetes (15.6%) and asthma (10.9%) are known to be more common in APK patients than other comorbid diseases.

Conclusion: ELISA manual Bordier cut-off 1,595 with 100% specificity, can be an early screening tool for APK diagnosis. Positive results on examination accompanied by clinical and radiological symptoms leading to APK can be used to establish a diagnosis, while negative results require further investigation with automated ELISA examination."

"Latar belakang: Pasien tuberkulosis (TB) paru rentan mengalami infeksi oportunistik, termasuk oleh Aspergillus (aspergilosis paru). Keberadaan Aspergillus dikonfirmasi dengan uji kultur. Uji kepekaan Aspergillus terhadap obat anti-jamur (OAJ) dilakukan untuk mengetahui pilihan OAJ yang tepat. Itrakonazol merupakan salah satu OAJ pilihan untuk aspergilosis paru. Resistensi OAJ dapat disertai gejala klinis yang luas. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakteristik klinis pasien dikaitkan dengan hasil uji kepekaan Aspergillus terhadap itrakonazol.Metode: Penelitian potong-lintang ini dilakukan pada Juli-November 2021 dan merupakan bagian dari penelitian sebelumnya. Isolasi Aspergillus dari sputum pasien TB paru dilakukan menggunakan medium agar Sabouraud. Karakteristik klinis yang diteliti meliputi usia, jenis kelamin, indeks massa tubuh (IMT), dan gejala. Adapun uji kepekaan jamur dilakukan dengan metode cakram sesuai protokol.Hasil: Penelitian ini menyertakan 28 isolat Aspergillus sp. yang berasal dari sputum 28 pasien TB paru. Jumlah pasien laki-laki lebih dominan (24 orang). Rerata usia 50 ± 15,1 tahun, dengan kelompok usia terbanyak < 60 tahun (21 pasien). Sebanyak 12 pasien (42,9%) memiliki IMT rendah. Gejala klinis yang didapatkan meliputi: batuk (42,9%), batuk darah (35,7%), sesak (39,3%), nyeri dada (14,3%), dan rasa lelah (35,7%). Kultur sputum menunjukkan pertumbuhan 28 isolat Aspergillus, terdiri atas: 14 isolat Aspergillus fumigatus, 6 isolat Aspergillus flavus, dan 8 isolat Aspergillus niger. Uji kepekaan Aspergillus terhadap itrakonazol menunjukkan 23 isolat sensitif, 3 isolat intermediat, dan 2 isolat resisten. Analisis statistik menunjukkan tidak terdapat hubungan bermakna antara karakteristik klinis pasien dengan hasil uji kepekaan jamur.Kesimpulan: Tidak terdapat hubungan bermakna antara karakteristik klinis pasien dengan hasil uji kepekaan Aspergillus terhadap itrakonazol dalam penelitian ini.

---

Introduction: Pulmonary tuberculosis (TB) patients are susceptible to opportunistic infections, including Aspergillus infections (aspergillosis). The presence of Aspergillus was confirmed by a culture test, followed by its susceptibility study to antifungal. Antifungal resistance is generally accompanied by serious symptoms, so clinical observations are important for better clinical awareness. This study aims to determine the relationship between clinical characteristics and susceptibility study of Aspergillus to itraconazole.

Method: This cross-sectional study was carried out from July-November 2021, as part of the previous study on aspergillosis in TB patients. Aspergillus was isolated from the sputum of pulmonary TB patients using Saboraud's agar dextrose medium. Clinical characteristics obtained through patient’s history including age, gender, body mass index, and symptoms The fungal susceptibility test was carried out by disc diffusion method according to the protocol after treatment.

Result: This study included 28 isolates of Aspergillus from the sputum of 28 pulmonary TB patients. The number of males were dominant (24 from 28 patients) than females. The mean age was 50 ± 15.1 years, with the commonest age group < 60 years (21 patients). Total of 12 patients (42.9%) had a low body mass index. Clinical symptoms included: cough (42.9%), hemoptysis (35.7%), dyspnea (39.3%), chest pain (14.3%), and fatigue (35.7%). %). The sputum culture showed 14 Aspergillus fumigatus isolates, 6 Aspergillus flavus isolates, and 8 Aspergillus niger. The susceptibility test of Aspergillus to itraconazole revealed 23 sensitive isolates, 3 intermediate isolates, and 2 resistant isolates. Statistical analysis showed that there was no relationship between the patient’s clinical characteristics and the antifungal susceptibility test of itraconazole.

Conclusion: There was no significant correlation between the patient’s clinical characteristics and the antifungal susceptibility test to itraconazole in this study"

"Kasus aspergilosis paru kronik (APK) yang disebabkan Aspergillus sp. semakin meningkat seiring dengan meningkatnya frekuensi infeksi tuberkulosis (TB) paru sebagai faktor risiko. Diagnosis APK masih menjadi tantangan karena gejala klinis, pemeriksaan radiologi, maupun laboratorium tidak khas. Untuk menetapkan diagnosis APK diperlukan pemeriksaan laboratorium mikologi, termasuk uji serologi. Hasil pemeriksaan imuno-diffusion test (IDT) Aspergillus dengan crude antigen kurang optimal dan IgG Aspergillus ELISA menggunakan antigen galaktomanan yang termasuk antigen sel T independent sehingga tidak mendukung switching isotipe antibodi. Oleh sebab itu, diperlukan penelitian lain untuk mendapatkan prosedur yang lebih baik dalam menetapkan diagnosis APK. Tujuan penelitian ialah mengetahui pola respon IgG terhadap kombinasi empat protein 16 kD, 18-20 kD, 22 kD, dan 30 kD antigen Aspergillus dengan metode Western Blot. Potensi diagnostik dari kombinasi protein 16 kD, 18-20 kD, 22 kD, dan 30 kD antigen Aspergillus dengan metode Western Blot terhadap nilai konsensus positif dan negatif APK berdasarkan 2 metode pemeriksaan yaitu biakan jamur dan IgG anti galaktomanan sebagai baku emas didapatkan nilai sensitivitas dan spesifisitas sebesar 74% dan 96%. Deteksi IgG Aspergillus metode Western Blot menunjukkan antigen dominan berat molekul 16 kD dan 18-20 kD. Kesimpulan uji IgG Aspergillus Western Blot memiliki potensi diagnostik lebih baik dibanding uji IgG Aspergillus ELISA.

---

Chronic pulmonary aspergillosis (CPA) caused by Aspergillus sp. potentially increases with the increasing frequency of pulmonary tuberculosis (TB) as a risk factor. Diagnosis of CPA is still a challenge because clinical symptoms, radiological examination, and laboratory are  not specific. The diagnosis of CPA needs to be performed by specific mycological examination, including serology test. The result of the Aspergillus immunodiffusion test (IDT) with crude antigen is sub optimal and Aspergillus IgG ELISA method uses galactomannan antigens that are independent T cell antigens, so cant support switching of isotype antibodies. Therefore, other study is needed to get a better procedure in determine the CPA diagnostic. The study aimed to determine the IgG responses with a combination of  Aspergillus proteins (16 kD, 18-20 kD, 22 kD, and 30 kD) with Western Blot method. Diagnostic potential of the Aspergillus protein combination (16 kD, 18-20 kD, 22 kD, and 30 kD) with Western Blot method on positive and negative consensus values of CPA based on two examination methods are fungus culture and anti-galactomannan IgG as gold standard are obtained sensitivity and specificity of 74% and 96%. From the Aspergillus Western Blot IgG test, dominant antigens obtained were molecular weights of 16 kD and 18-20 kD. The conclusion is Aspergillus specific IgG test with Western Blot method has better diagnostic potential than the  anti-galactomannan IgG ELISA method."

"Infeksi jamur paru dapat disebabkan Aspergillus spp. menyebabkan aspergillosis paru kronik (APK) yang sering mengikuti penyakit kronik lain, termasuk tuberkulosis (TB) paru. Data APK dan metode diagnosisnya pada pasien TB paru di Indonesia masih terbatas. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui perbandingan sensitivitas deteksi antibodi spesifik Aspergillus pada pasien TB paru. Penelitian berdesain nested case-control ini merupakan bagian dari penelitian payung tentang diagnosis APK pada pasien TB paru di Jakarta. Serum pasien yang memenuhi kriteria inklusi diperiksa menggunakan imunokromatografi kit ICT LDBio Aspergillus sebanyak 2 kali, yaitu saat awal dan akhir pengobatan TB. Pemeriksaan dilakukan pada Maret-Oktober 2022 sesuai protokol di Laboratorium Parasitologi FKUI. Dari 71 pasien TB paru yang memenuhi kriteria inklusi, rerata usia 44,35 ± 17,43. Pemeriksaan ICT LDBio Aspergillus pada awal terapi OAT menunjukkan hasil positif pada 4 dari 71 (5,6%) pasien, dengan sensitivitas 11,54%, spesifisitas 97,78%. Pada akhir terapi OAT, pemeriksaan ICT LDBio Aspergillus juga menunjukkan hasil positif pada 5,6% pasien, dengan sensitivitas 25% serta spesifisitas 96,83%. Hasil ICT LD Bio Aspergillus pada 71 pasien TB paru dalam penelitian ini menunjukkan hasil positif yang setara pada awal dan akhir OAT (5,6%), dengan sensitivitas yang lebih rendah pada awal OAT (11,54%) dibandingkan akhir OAT (25%).

---

Lung fungal infection can be caused by Aspergillus spp. causes chronic pulmonary aspergillosis (CPA) which often follows other chronic diseases, including pulmonary tuberculosis (TB). CPA data and its method of diagnosis in pulmonary TB patients in Indonesia are still limited. This study aims to compare the sensitivity of Aspergillusspecific antibody detection in pulmonary TB patients. This nested case-control design study is part of an umbrella study on the diagnosis of CPA in pulmonary TB patients in Jakarta. Sera of patients who met the inclusion criteria were examined using the ICT LDBio Aspergillus kit 2 times, namely at the beginning and at the end of TB treatment. The examination was carried out in March-October 2022 according to the protocol at the FKUI Parasitology Laboratory. Of the 71 pulmonary TB patients who met the inclusion criteria, the mean age was 44.35 ± 17.43. The result of ICT LDBio Aspergillus examination at the start of anti-tuberculosis therapy showed positive results in 4 of 71 (5.6%) patients, with a sensitivity of 11.54%, a specificity of 97.78%. At the end of antituberculosis therapy, the result of ICT LDBio Aspergillus examination also showed positive results in 5.6% of patients, with a sensitivity of 25% and a specificity of 96.83%. ICT LDBio Aspergillus results in 71 pulmonary TB patients in this study showed equivalent positive results at the beginning and end of anti-tuberculosis (5.6%), with lower sensitivity at the start of anti-tuberculosis (11.54%) than at the end of anti-tuberculosis (25%)."

"ABSTRAKPenelitian bertujuan menganalisis hubungan kekerabatan spesies-spesiesCercospora berdasarkan data sequence daerah Internal Transcribed Spacers (ITS)rDNA, gen elongation factor 1-α (EF), dan gen calmodulin (CAL); mengetahuilokus yang paling baik dalam memisahkan spesies-spesies Cercospora; danmenguji host specificity Cercospora spp. dengan tanaman inangnya. Padapenelitian ini telah dilakukan amplifikasi dan sequencing daerah ITS rDNA, genEF, dan gen CAL pada 14 spesies dari 23 strain Cercospora yang berasal dari tigafamili tanaman inang (Asteraceae, Cucurbitaceae, dan Solanaceae). Pohonfilogenetik dibangun menggunakan metode Neighbor-Joining, MaximumParsimony, dan Bayesian. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pohonfilogenetik berdasarkan data sequence daerah ITS rDNA tidak dapat menjelaskanhubungan kekerabatan antarspesies pada genus Cercospora; sebagian besarCercospora (57 dari 61 OTU) berada dalam satu kelompok besar yang jarakcabangnya berimpit satu dengan lainnya. Pohon filogenetik berdasarkan datasequence gen EF dapat menjelaskan hubungan kekerabatan beberapa spesiesCercospora, walaupun sebagian spesies Cercospora (24 OTU) berada dalam satukelompok yang jarak cabangnya berimpit satu dengan lainnya. Pohon filogenetikberdasarkan data sequence gen CAL dapat menjelaskan hubungan kekerabatansebagian besar spesies Cercospora, jarak cabang terlihat lebih panjangdibandingkan pada pohon filogenetik berdasarkan data sequence gen EF,walaupun beberapa spesies Cercospora (16 OTU) belum dapat dipisahkan. Hasilanalisis filogenetik menunjukkan bahwa spesies-spesies Cercospora tidak dapatdipisahkan berdasarkan data sequence daerah ITS rDNA, akan tetapi sebagianspesies dapat dipisahkan berdasarkan data sequence gen EF dan gen CAL. Pohonfilogenetik berdasarkan data sequence gen CAL menunjukkan bahwa gen tersebutdapat digunakan untuk memisahkan spesies-spesies Cercospora lebih baikdaripada daerah ITS rDNA dan gen EF. Hasil analisis filogenetik berdasarkandata sequence multilokus menunjukkan bahwa 11 dari 14 spesies Cercosporayang digunakan dalam penelitian tidak host-specific, hanya tiga spesies yaitu C.zinniicola, C. cocciniae, dan C. mikaniicola yang spesifik terhadap inangnya.

---

ABSTRACTThe aims of this study were to analyze the phylogenetic relationships ofCercospora spp. based on sequence data of the internal transcribed spacer (ITS)region of rDNA, elongation factor 1-α (EF), and calmodulin (CAL) genes; todetermine the best locus in separating Cercospora species; and to investigate thehost specificity of Cercospora spp. In this study, the sequences of the ITS regionof rDNA, EF, and CAL genes of 23 strains which belong to 14 species ofCercospora from three host plants families were amplified and sequenced. Thephylogenetic trees of the Cercospora spp. were constructed by Neighbor-Joining,Maximum Parsimony, and Bayesian methods. Our result showed thatphylogenetic relationship of Cercospora at the species level could not be resolvedby ITS rDNA; most of Cercospora species (57 OTU) were grouped in one majorclade with no branch length differences among species. The EF phylogenetic tree,showed that some species of Cercospora could be separated, although 24 OTUwere grouped into one clade with no branch length differences. The CALphylogenetic tree showed that the majority of Cercospora species could beseparated with longer branch compared to the EF phylogenetic tree, althoughseveral species (16 OTU) could not be separated. The phylogenetic analysesshowed that most of Cercospora species could not be separated in the ITS rDNAtree, however those species could be separated in the EF and CAL phylogenetictrees. The results showed that CAL gene was the best locus in separatingCercospora species compared to ITS rDNA and EF gene. Molecularphylogenetic analysis from multiloci (ITS regions of rDNA, EF gene, and CALgene) revealed that 11 out of 14 species of Cercospora have no host specificity(have a wide host range) and only three species e.g., C. zinniicola, C. cocciniae,and C. mikaniicola showed host specificity."

"Penelaahan terhadap kandungan Aspergillus spp. pada berbagai contoh dan status Aspergillosis pada unggas di Kalimantan Selatan telah dilakukan. Contoh diperoleh dari lapangan yang berasal dari ayam buras (129), anak itik Alabio (192), telur itik (701), pakan (59), dedak (17), dan alas kandang (2). Contoh dibiakkan ke dalam medium agar glukosa Sabouraud mengandung antibiotika antibateri (penisilin-streptomisin) dan diinkubasikan pada suhu 25 derajat C dan 37 derajat C. Pertumbuhan koloni lapang, khususnya Aspergillus spp., diamati selama 10-14 hari. Hasil penelitian menunjukkan bahwa Aspergillus fumigatus, A.flavus, A.niger, dan sejumlah Aspergillus lain yang belum dapat diidentifikasikan spesiesnya dapat diisolasi dari sebagian besar contoh. "