Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Jatropha is one of the many biodiesel plants developed in tropical countries. Efforts to increase its productivity can be done using various methods of breeding. One of the breeding methods is the introduction of genes into the Jatropha plant. The aim of this study is to assess the success of genetic transformation using the Inhibitor of Meristem Activity (IMA) gene in Jatropha curcas. The research procedures included inoculation of explants with Agrobacterium tumefaciens, callus induction, screening test of selection media, regeneration, and gene expression analysis using Polymerase Chain Reaction (PCR). IMA is one of the genes that controls flowering genes and ovule development. It was first isolated from tomato plants and has been successfully overexpressed in these plants using the Cauliflower Mosaic Virus (CaMV) 35S promoter. In this experiment, plant transformation was performed on J. curcas as the target. Explant callus formation in both the control and treated samples was good, but shoot formation decreased dramatically in the treated explants. PCR analysis indicated that IMA genes can be inserted into J. curcas with the size of the IMA gene is 500 bp.

---

Transformasi Gen Inhibitor of Meristem Activity ke Tanaman Jatropha curcas L. Jarak Pagar merupakan salah satu tanaman penghasil biodiesel yang banyak dikembangkan di beberapa negara tropis. Usaha peningkatan produktivitasnya terus ditingkatkan dengan berbagai metode pemuliaan. Salah satu metode pemuliaan tersebut adalah dengan menyisipkan gen-gen yang unggul ke tanaman Jarak Pagar. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui tingkat keberhasilan transformasi genetik yang menggunakan gen IMA (Inhibitory Meristem Activity) ke dalam tanaman Jatropha curcas L. Tahapan penelitian meliputi inokulasi eksplan dengan Agrobacterium tumefaciens, induksi kalus, seleksi, regenerasi, dan analisis ekspresi gen IMA dengan metode Polymerase Chain Reaction (PCR). Gen IMA merupakan salah satu gen yang dapat mengontrol pembungaan dan perkembangan ovul. Gen ini diisolasi pertama kali dari tanaman tomat dan peningkatan ekspresi telah berhasil dilakukan pada tanaman tomat itu sendiri menggunakan promoter 35S Cauliflower Mosaic Virus (CaMV). Pada percobaan ini dilakukan transformasi gen ke dalam tanaman target J. curcas. Pembentukan kalus pada menunjukkan hasil yang baik eksplan kontrol dan eksplan yang mengalami perlakuan, tetapi pada eksplan perlakuan hasil sangat menurun pada tahap pembentukan tunas. Analisis dengan PCR mengindikasikan bahwa gen IMA dapat disisipkan ke J. curcas dengan ukuran gen IMA sebesar 500 bp."

"The bunch size represented by the fruit number is the main parameter of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) yield. Thefruit number, which is determined during the initial phase of development, is related to various factors, including thegenetic properties of the trees. Trees that have more pistillate flowers have more fruit. The diversity of MADS-boxgenes assumed can be used as a marker for trees that have a higher number of pistillate flowers. Therefore, the aims ofthis research were to isolate and identify the MADS-box genes from flowers of tenera oil palm using PCR techniques.The SQUAMOSA (SQUA) gene and the GLOBOSA (GLO) gene are members of the MADS-box genes family that areresponsible for sepal, petal and stamen organ development. The genomic DNA of the staminate flowers of trees thathave more staminate flowers (P1) and the genomic DNA of the pistillate flowers of trees that have more pistillateflowers (P2) were isolated using the CTAB+ PVP method. The CTAB+PVP method was more efficient for isolatingpistillate flower genomic DNA than staminate flower genomic DNA. The genomic DNA of P1 and P2 was amplifiedwith two primers: BMS and BMG. The BMS primers gave a PCR product size of 1250 bp for the genomic DNA of P1and P2. Meanwhile, the BMG primers gave a PCR product size of 1250 bp and 1300 bp for P1 and P2, respectively.The PCR products were sequenced and analyzed for homology using the GenBank database. BLAST analysis showedthe PCR products have high homology with the SQUA1 gene and the GLO2 gene. Alignment analysis showed that theDNA fragments amplified with the BMS primers of the P1 and P2 sequences have variations in the exons and introns,and the variations were observed only in the introns of the DNA fragments amplified with the BMG primers.Identifikasi Gen MADS-box pada Kelapa Sawit (Elaeis guineensis Jacq.). Ukuran tandan yang dipresentasikandengan jumlah buah merupakan parameter utama pada produksi kelapa sawit (Elaeis guineensis Jacq.). Jumlah buah,yang dapat diduga selama fase awal perkembangan tanaman, berkaitan dengan berbagai faktor, salah satunya adalahproperti genetik pohon. Pohon yang mempunyai bunga betina lebih banyak mempunyai buah lebih banyak. Keragamangen MADS-box diduga dapat digunakan sebagai marka untuk pohon yang mempunyai banyak bunga betina. Tujuandari penelitian ini adalah mengisolasi dan mengidentifikasi gen MADS-box dari bunga kelapa sawit Teneramenggunakan teknik PCR. Gen SQUAMOSA (SQUA) dan gen GLOBOSA (GLO) termasuk dalam famili gen MADSboxyang berperan pada perkembangan organ sepal, petal dan stamen. DNA genom bunga jantan dari pohon yangmempunyai bunga jantan lebih banyak (P1) dan DNA genom bunga betina dari pohon yang mempunyai bunga betinalebih banyak (P2) diisolasi menggunakan metode CTAB+PVP. DNA genom P1 dan P2 diamplifikasi menggunakan duaprimer: BMS dan BMG. Primer BMS menghasilkan produk PCR berukuran 1250 bp untuk DNA genomP1 dan P2.Primer BMG menghasilkan produk PCR berukuran 1250 bp dan 1300 bp untuk P1 dan P2. Produk PCR disekuensingdan dianalisis homologinya menggunakan database GenBank. Analisis BLAST menunjukkan bahwa produk PCRmempunyai homologi yang tinggi dengan gen SQUA1 dan gen GLO2. Analisis alignment menunjukkan fragmen DNAyang teramplifikasi primer BMS dari sekuen P1 dan P2 mempunyai keragaman pada ekson dan intron, keragamanhanya terdeteksi pada intron fragmen DNA yang teramplifikasi primer BMG."

"(+)-2,2?-Epicytoskyrin A, a bis-anthraquinone isolated from fungal endophyte Diaporthe sp. GNBP-10 associated withUncaria gambir Roxb., was investigated for its antifungal activity. The broth microdilution method was used todetermine the minimum inhibitory concentration (MIC) against 22 yeast strains and three filamentous fungi. The MICsof (+)-2,2?-epicytoskyrin A ranged from 16 to 128 μg/mL, which exhibited lower activity than the antifungal nystatin.A study of the mechanism of action revealed similar effects of (+)-2,2?-epicytoskyrin A and nystatin on Candidatropicalis at their MICs (16 and 8 μg/mL, respectively) and 2 times of the MIC. Both compounds caused cytoplasmicmaterial and ion leakages on fungal cell, which were characterized by an increase in absorbance at 260 nm and 280 nmas well as Ca2+ and K+ ion concentrations. The morphology of the fungal cells after (+)-2,2?-epicytoskyrin A treatmentwas observed under a scanning electron microscope. The control cells, which were not treated with either (+)-2,2?-epicytoskyrin A or nystatin, showed a smooth surface, while the cells treated with either (+)-2,2?-epicytoskyrin A ornystatin shrank and displayed a donut-like shape. More shrinkage was observed in the 2 times MIC concentration andeven more in the cells exposed to nystatin. The action of (+)-2,2?-epicytoskyrin A was proposed through membranedisruption.Aktivitas Antijamur (+)-2,2?-Episitoskirin A dan Aksi Disrupsi Membran. (+)-2,2?-Episitoskirin A, suatu senyawabis-antrakuinon yang diisolasi dari jamur endofit Diaporthe sp. GNBP-10 yang berasosiasi dengan Uncaria gambierRoxb., telah diuji aktivitas antifungi-nya. Metode mikrodilusi cair digunakan untuk menentukan konsentrasi hambatminimum (KHM) terhadap 22 strain khamir dan tiga strain kapang. KHM dari (+)-2,2?-episitoskirin A berkisar antara16 hingga 128 μg/mL, menunjukkan aktivitas yang lebih rendah dibandingkan antijamur nistatin. Studi terhadapmekanisme kerja dari senyawa uji menunjukkan bahwa (+)-2,2?-episitoskirin A dan nistatin memiliki efek yang serupaterhadap Candida tropicalis pada konsentrasi KHM (16 dan 8 μg/mL) dan dua kali KHM-nya. Keduanya menyebabkanterjadinya kebocoran material sitoplasmik dan ion pada sel khamir yang ditandai dengan meningkatnya absorban padapanjang gelombang 260 nm dan 280 nm, serta meningkatnya konsentrasi ion Ca2+ dan K+. Morfologi dari sel khamirsetelah diberi perlakuan diamati di bawah Scanning Electron Microscope. Sel kontrol yang tidak diberi perlakuan, baikdengan (+)-2,2?-episitoskirin A maupun nistatin, menunjukkan permukaan yang halus, sementara sel yang diberiperlakuan dengan (+)-2,2?-episitoskirin A dan nistatin masing-masing mengalami pengerutan dan berbentuk sepertidonat. Pengerutan sel ini bertambah pada konsentrasi 2 kali KHM dan semakin bertambah pada sel yang diberiperlakuan dengan nistatin. Dari studi yang dilakukan, mekanisme kerja dari (+)-2,2?-episitoskirin A diduga melaluiperusakan pada membran sel."

"Genes related to starch synthesis and the metabolism contribute to a variety of physicochemical properties thatdetermine the eating/cooking qualities of rice. Our previous study suggested that a set of molecular markers was able toestimate the eating quality of japonica rice. The present study reports the genetic diversity of 22 japonica rice varietiesbased on markers corresponding to starch synthesizing genes. The mean of the polymorphic information content (PIC:0.135) value and the diversity index (0.171) indicated a low genetic diversity in these varieties. The phylogenetic treeclearly demonstrated three main clusters: 1) cluster I contained seven varieties with similar physicochemical properties;2) cluster II only showed a Japanese variety, Koshihikari, and 3) cluster III included the most Korean varieties (14varieties). This phylogenetic analysis did not completely represent the physicochemical properties differentiation of thejaponica varieties, although it did reveal an initial clue to the close relationship between Korean rice and the Japaneseand Chinese varieties. Notably, these markers were also able to identify a premium japonica rice. The molecularmarkers and information concerning the genetic relationship would be useful in improving the japonica rice along withits starch quality of in breeding program.Keragaman Genetik Padi Japonica berdasarkan Marka terkait Gen Sintesis Pati. Gen terkait sintesis danmetabolism pati berkontribusi pada berbagai sifat fisiko-kimia yang menentukan mutu rasa dan hasil masak (cooking)beras. Penelitian sebelumnya menunjukkan bahwa satu set marka molekuler mampu memprediksi mutu rasa berasjaponica. Pada studi ini dilaporka keragaman genetik 22 varietas padi japonica berdasarkan marka untuk gen-genpensintesis pati. Rata-rata nilai polymorphic information content (PIC:0,135) dan indeks keragaman (0,171)menunjukkan keragaman genetik yang rendah dalam varietas padi ini. Pohon filogenetik menunjukkan tiga kelompokutama yang dibentuk: 1) klaster I terdiri dari tujuh varietas dengan sifat fisikokimia yang mirip; 2) klaster II hanyaterdiri dari verietas premium Jepang, Koshihikari, dan 3) klaster III mengelompokkan sebagian besar varietas Korea (14varietas). Analisis filogenetik ini belum sepenuhnya menggambarkan diferensiasi varietas japonica berdasarkan sifatfisiko-kimia, namun hasil ini mengungkapkan petunjuk awal korelasi yang erat antara padi Korea dengan varietasJepang dan Cina. Marka-marka tersebut juga mampu mengidentifikasi beras premium japonica. Marka molekuler daninformasi kekerabatan genetik ini akan berguna dalam membantu mengembangkan padi japonica terkait dengan mutupati dalam program pemuliaan"

"Vinblastine and vincristine are secondary metabolites from Madagascar periwinkles that have a very high economicvalue as chemotherapy drugs. These compounds are naturally produced in a very low quantity in planta. One promisingalternative method for vinblastine and vincristine production is to use a treatment that can trigger plant stress responsein vitro. This study has been done to evaluate the effect of drought stress using polyethylene glycol (PEG) on vinblastineand vincristine production in the C. roseus callus culture, which were grown on medium Zenk supplemented with plantgrowth regulators (PGR) 1 μM NAA + 10 μM Kinetin to induce laticifer and idioblast differentiation. 13-week-old calluscultures were then treated with 0%, 6%, 9%, and 12% (w/v) PEG4000 each for 0, 24, 48, and 72 hours. Biochemical analysiswas performed using HPLC to determine the levels of vinblastine and vincristine, while the presence of differentiated cells(idioblasts and laticifers) was determined using a histochemical method. Protein profiles of the culture were determined bySDS-Page. The results showed that drought treatment with PEG4000, until the concentration was 12% (w/v), did notsignificantly affect the production of vinblastine and vincristine, but might affect terpenoid production. Histochemicalanalysis confirmed the presence of idioblasts, non-elongated laticifers, and laticifers that were producing and accumulatingterpenoids highest in the 12% PEG treatment. PEG treatments also did not change the protein profile of callus.Produksi Senyawa Viblastin dan Vincristin pada Kultur Kalus Tanaman Tapak Dara (Catharanthus roseus (L.) G.Don) dengan Pemberian Cekaman Menggunakan Polietilena Glikol (PEG). Vinblastin dan vincristine merupakansenyawa metabolit sekunder dari tanaman Tapak Dara yang memiliki nilai ekonomi tinggi sebagai obat kemoterapikanker. Kedua senyawa ini hanya diproduksi dalam jumlah yang sangat sedikit pada tumbuhan. Salah satu metodealternatif yang menjanjikan untuk meningkatkan produksinya adalah dengan pemberian cekaman pada kultur in vitro.Telah dilakukan penelitian dengan tujuan untuk menentukan pengaruh pemberian cekaman kekeringan menggunakanpolyethylene glycol (PEG) terhadap produksi senyawa vinblastin dan vincristine pada kultur agregat C. roseus yang ditanampada medium Zenk dengan penambahan zat pengatur tumbuh (ZPT) NAA 1 μM + Kinetin 10 μM untuk menginduksipembentukan kelenjar latisifer dan sel idioblas. Kalus yang berusia 13 minggu kemudian diberi perlakuan cekamankekeringan menggunakan PEG4000 0%, 6%, 9%, dan 12% (w/v) masing-masing selama 0, 24, 48, dan 72 jam. Analisisdilakukan secara histokimia untuk menguji keberadaan latisifer pada kalus dan biokimiawi untuk menentukan kadarvinblastin dan vincristine dengan menggunakan HPLC. Selain itu dilakukan pula analisis profil protein dengan SDSPage.Hasil penelitian menunjukkan bahwa pemberian cekaman kekeringan dengan menggunakan PEG4000 hinggakonsentrasi 12% (w/v) tidak berdampak signifikan terhadap produksi senyawa vinblastin dan vincristine namun didugaberdampak pada pembentukan senyawa terpenoid. Sel idioblas dan latisifer yang mengandung terpenoid dalam jumlahrelatif banyak ditemukan pada perlakuan PEG 12%. Perlakuan dengan PEG juga tidak berdampak pada perubahanprofil protein kalus. Analisis protein menunjukkan bahwa seluruh perlakuan memiliki profil protein yang sama."

"Rumah cerdas adalah rumah yang dapat memberikan layanan kepada penghuninya sesuai dengan konteks yang sedang berlangsung saat ini. Salah satu konteks yang dijadikan acuan oleh rumah cerdas untuk memberikan layanan kepada penghuninya adalah konteks lokasi penghuni dan perangkat. Dalam beberapa penelitian rumah cerdas di Fasilkom UI, belum diimplementasikan modul yang memiliki fungsi untuk memahami konteks lokasi tersebut. Penelitian ini akan mengimplementasikan modul yang berfungsi untuk mengidentifikasi lokasi penghuni dan perangkat dengan menggunakan projective transformation yang meliputi perspective grid dan pendeteksian manusia pada citra video. Dari lokasi penghuni dan perangkat tersebut dapat diturunkan informasi lain seperti perangkat-perangkat terdekat dengan penghuni dan jaraknya dengan penghuni.

---

Smart home is a home that can provide services to it’s occupants according to the current ongoing context. One of the contexts that is used as reference, by the smart home to give services to it’s occupants, is the occupants location and devices location. There were some study about smart home in Fasilkom UI, but none of them implemented a module that has functionality for understanding the location context. This study will implement a module that will identify the location of occupants and devices using perspective grid on the image from video. Based on the occupant location and devices location, we can derive the other information such as the closest devices to the occupant dan the distance between them."

"Walau merupakan kajian yang relatif baru, para ahli antropologi semakin menyadari bahwa perbatasan merupakan laboratorium perubahan sosial dan kebudayaan yang penting. Tidak ada kawasan lain tempat berlangsungnya kontradiksi yang tajam dalam hal representasi komuniti lokal. Seperti di kawasan perbatasanlah ditemukan kelompok-kelompok minoritas. Para ahli antropologi yang mempelajari perbatasan, termasuk di Borneo dan Laut Sulu, sangat menaruh perhatian pada proses inkorporasi komuniti-komuniti perbatasan itu kedalam negara-bangsa, dan masyarakat-global. Tulisan ini bermaksud mendiskusikan sebuah konsep yang koheren tentang batas dan daerah perbatasan, serta mengidentifikasi pertanyaan-pertanyaan penelitian dan agenda studi perbatasan di masa depan. Penulis mengemukakan sebuah argumentasi bahwa masa depan dari studi perbatasan bertumpu pada kajian tentang sejarah komuniti-komuniti yang terpinggirkan, misalnya masyarakat Iban, Bugis, dan Orang Laut. Diulas pula cara komuniti-komuniti perbatasan itu memberikan makna dan bentuk pada transformasi ruang di kawasan perbatasan. Dimensi kesejarahan dan sejarah lisan perlu pula memperoleh perhatian dalam studi komuniti-komuniti perbatasan."