Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Infeksi Hookworm (Necator americanus atau Ancylostoma duodenale) didunia mencapai sekitar 740 juta jiwa. Infeksi cacing tambang dapat menyebabkan malnutrisi, anemia dan defisiensi zat besi. Secara konvensional, diagnosis infeksi cacing tambang berdasarkan pada deteksi telur cacing tambang dalam sampel tinja manusia secara mikroskopik. Namun, metode tersebut memiliki beberapa keterbatasan. Terutama, seringnya kegagalan dalam membedakan sampai tingkat spesies. Dengan menggunakan Real Time PCR kita mengevaluasi infeksi submikroskopis hookwom (N. americanus dan A. duodenale) dari sampel feses anak (usia 5--18 tahun) pre dan post treatment Albendazole 400 mg di Nangapanda, Ende. Pemeriksaan dilakukan di Laboratorium Helmintologi, Departemen Parasitologi FKUI pada bulan November 2012 sampai dengan Mei 2013. Dua jenis probe spesifik yang digunakan dalam Real Time PCR: FAM dan Texas Red untuk mendeteksi N. americanus dan A. duodenale. Sebanyak 5 dari 90 sampel feses acak pre dan post treatment terinfeksi N. americanus dengan kandungan DNA rendah dan tidak ditemukan sampel yang terinfeksi A. duodenale. Penelitian menunjukkan bahwa Real Time PCR dapat mendeteksi infeksi submikroskopis spesies hookworm secara spesifik. Multiplex Real Time PCR sangat berguna untuk mendeteksi infeksi submikroskopis, terutama ketika intensitas infeksi rendah.

---

Hookworm infection (Necator americanus or Ancylostoma duodenale) in the world reachs about 740 million people. The infection of hookworm can lead to malnutrition, anemia and iron deficiency. Traditionally, diagnostic of hookworm infection is based on detection of hookworm eggs in human stool samples using microscopy. However, there are several limitations of this method. Importantly, species differentiation are often failed. Using Real Time PCR we evaluated submicroscopic infection of N. americanus and A. duodenale from human faecal samples (5-18years) in Nangapanda, Ende. The stool samples were collected in two times period, before and after treatment using 400mg of Albendazole. The examination was performed at the Laboratory of Parasitology,Faculty of Medicine Department Helmintologi during November 2012-May 2013. Two specific species probes were used in Real Time PCR: FAM and Texas Red to detect N.americanus and A.duodenale respectively. Five out of 90 random faecal samples were infected by N. americanus with low load DNA and none of A.duodenale infection was found. The present study shown that Real Time PCR could detect submicroscopic infection from specific species of hookworm. Multiplex Real Time PCR is very useful for detecting submicroscopic infections, especially when the intensity of hookworm infection is low."

"Ascaris lumbricoides termasuk kelompok nematoda usus yang dapat menimbulkan malnutrisi pada individu yang memiliki sistem imun lemah. Penelitian bertujuan untuk mendeteksi dan mengetahui persentase infeksi submikroskopis dari A. lumbricoides, dengan sampel feses anak usia 5-18 tahun di Nangapanda, menggunakan metode real-time PCR. Sampel feses dikoleksi selama dua kali, yaitu pre dan post treatment albendazole 400 mg. Total sampel yaitu 242, tetapi yang digunakan dengan uji real-time PCR hanya 45 sampel negatif secara mikroskopis. Sampel diisolasi kemudian dilakukan running realtime PCR. Primer yang digunakan berasal dari daerah target ITS-1. Daerah ITS-1 dipilih karena memiliki laju mutasi yang tinggi dan mampu menbedakan Ascaris dengan cacing lain. Real-time PCR mampu mendeteksi kuantitas DNA A. lumbricoides dalam jumlah yang sedikit. Deteksi sampel menggunakan realtime PCR menghasilkan kurva amplifikasi pada fluorophore VIC. Dua sampel (4,4%) pada pre treatment termasuk dalam low load of DNA (Ct > 35) dan lima sampel (11,4%) pada post treatment termasuk moderate load of DNA (30 < Ct < 35). Hasil penelitian menunjukkan bahwa real-time PCR dapat mendeteksi infeksi submikroskopis.

---

Ascaris lumbricoides is an intestinal nematode that can cause malnutrition, in the individual with weak immune system. The aim of this research is to detect and know the percentage of submicroscopic infection of A. lumbricoides, from human faecal samples (5-18 years) in Nangapanda by using real-time polymerase chain reaction (PCR) method. The faecal samples were collected in two times period, before and after treatment using 400 mg of Albendazole. Total samples were 242 but only 45 negative samples from microscopic detection were tested with realtime PCR. The samples were isolated and amplified with real-time PCR, by using primer from target area of internally transcribed spacer (ITS-1). ITS-1 region was chosen due to its high rate mutation and ability to differentiate Ascaris with the other helminth parasites. Real-time PCR can detect low load of A. lumbricoides DNA. Detection of samples with real-time PCR generated amplification curve in VIC fluorophore. Two samples (4.4%) in pre treatment were low load of DNA (Ct > 35) and five samples (11.4%) in post treatment were moderate load of DNA (30 < Ct < 35). The result showed that real-time PCR can detect submicroscopic infection of A. lumbricoides."

"Parasitemia rendah umumnya tidak dapat terdeteksi pada saat pemeriksaan secara mikroskopis. Penelitian dilakukan untuk mendeteksi infeksi submikroskopis Plasmodium falciparum dan Plasmodium vivax di Nangapanda, Ende menggunakan metode Real-time Polymerase Chain Reaction (PCR). Sebanyak 72 sampel darah anak (umur 5--18 tahun) digunakan dalam amplifikasi DNA menggunakan gen target 18S rRNA. Hasil yang diperoleh menunjukkan Realtime PCR mampu mendeteksi adanya infeksi submikroskopis P. falciparum dan P. vivax di Nangapanda. Persentase infeksi submikroskopis yang diperoleh dari sampel positif P. falciparum sebesar 11,1%, P. vivax sebesar 9,7% dan infeksi campuran sebesar 2,8%. Sensitivitas Real-time PCR mampu mendeteksi kategori nilai Ct low load of DNA (Ct>35) dengan persentase infeksi sebesar 9,7% untuk P. falciparum dan 8,3% untuk P. vivax. Hasil uji chi-square menunjukkan tidak adanya hubungan yang signifikan (p>0,05) antara infeksi submikroskopis dengan variabel jenis kelamin dan kelompok umur. Deteksi terhadap infeksi submikroskopis berguna terutama dalam program eliminasi malaria.

---

In malaria endemic areas, individuals are frequently asymptomatic are present at densities below the limit for conventional microscopy. An 18S rRNA based multiplex Real-time Polymerase Chain Reaction (PCR) had been done to determine sub-microscopic infection of Plasmodium falciparum and Plasmodium vivax. A total of 72 blood samples from children 5--18 years of age in Nangapanda sub-district, Ende were analysed. The sensitivity of Real-time PCR revealed that sub-microscopic infections are common in this area. The prevalence for P. falciparum, P. vivax and mixed infection of both species are 11,1%, 9,7% and 2,8%, respectively. A low load of Plasmodium species-specific DNA (Ct>35) was found for P. falciparum and P. vivax in 9,7% and 8,3% of the positive cases, respectively. There was no significant correlation (p>0,05) between malaria submicroscopic with gender and age groups. Real-time PCR provides more insight into the epidemiology of P. falciparum and P. vivax infections, which could be applied for monitoring and evaluation of novel programs for the elimination of malaria."

"Prevalensi dari infeksi cacing tambang termasuk A duodenale di Indonesia khususnya di Nusa Tenggara Timur NTT masih tinggi Umumnya anak anak usia sekolah berIsiko tinggi terkena infeksi cacing tambang karena sering bermain di luar tanpa memakai alas kaki Riset ini bertujuan untuk mencari hubungan antara infeksi A duodenale dengan status anemia pada anak anak di desa Nangapanda kabupaten Ende NTT Riset ini dilakukan berdasarkan data sekunder dari penelitian departemen Parasitologi FKUI yang dilakukan dengan metode cross sectional Data diambil dari sampel berupa darah dan feses dari 262 anak anak berusia 6 sampai 17 tahun Dari sampel feses terbukti bahwa 90 dari 262 anak yang dites terinfeksi A duodenale di mana 53%-nya adalah laki-laki Prevalensi infeksi meningkat dengan bertambahnya umur anak dan prevalensi tertinggi ditemukan pada anak usia 10 tahun sebelum kemudian menurun hingga pada usia 16 dan 17 tahun dengan tidak ditemukan sampel yang terinfeksi Sampel darah menunjukkan bahwa ada 26 dari 262 sampel yang dikategorikan sebagai anemia Dari semua individu yang terinfeksi A duodenale hanya 6,7% yang terkena anemia Hal ini menunjukkan bahwa tidak ada hubungan yang signifikan antara status infeksi A duodenale dan anemia (p=0,150) Namun terdapat perbedaan signifikan pada nilai hemoglobin rata rata antara individu yang sudah terinfeksi dan tidak terinfeksi (p=0,020) Tidak terdapat perbedaan status anemia antara laki laki dan perempuan (p=0,862) atau antara anak anak dan remaja (p=0,184). Disimpulkan bahwa infeksi A duodenale tidak menyebabkan anemia pada anak sekolah di Nangapanda Kata Kunci Infeksi A duodenale anak anak usia sekolah anemia.

---

The prevalence of Soil Transmitted Helminths STH infection including A duodenale in Indonesia especialy Nusa Tenggara Timur NTT is high and school aged children are at greatest risk for this infection This study aims to provide the link and determine the nature of the relationship between A duodenale infection with anemia status and prove whether the infection alone is causing anemia among children in Nangapanda village Ende district NTT This research is based on cohort study done by Department of Parasitology FKUI Data from stool and blood sample was collected from 262 children aged 6 ndash 17 years old Analysis was done using SPSS 17 0 program Result from stool sample showed that 90 out of 262 samples were infected with A duodenale with 53 of them being male The distribution of infection based on age rise with age and peaked at the age of 10 before declining and finally none of the 16 and 17 years old are infected Blood test reveals there are 26 out of 262 samples that is considered anemia This means only 6 7 of the individual infected with A duodenale has anemia which shows that there is no significant relationship between A duodenale infection status and anemia p 0 150 However Mann Whitney shows that there rsquo s a significant difference in the mean value of Hb between the infected and uninfected individuals p 0 020 There is also no significant difference of anemia status between gender p 0 862 or between children and adolescence p 0 184 In conclusion A duodenale infection does not cause anemia among school aged children in Nangapanda Keywords A duodenale infection school aged children anemia."

"Insiden terjadinya infeksi dari Necator americanus masih cukup tinggi, khususnya di negara berkembang. Komplikasi tersering dari infeksi geohelminth adalah anemia, dimana apabila terjadi pada anak-anak dalam jangka panjang akan mengakibatkan terhambatnya pertumbuhan. Anak-anak adalah kelompok umur yang paling rentan terhadap infeksi parasit ini dikarenakan korelasi antara kebiasaan anak kecil dan metode penularan cacing ini. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui korelasi antara prevalensi infeksi N.americanus dan anemia pada anak sekolah di Nangapanda. Penelitian ini dilakukan di desa Nangapanda, Kabupaten Ende, Nusa Tenggara Timur. Sebanyak 262 anak berusia 6-17 tahun berpartisipasi pada penelitian ini. Data personal anak dari tingkat SD dan SMP di Nangapanda diperoleh dengan mengisi kuesioner dan dikumpulkan 262 sampel darah dan tinja. Infeksi cacing ditentukan dengan metode RT-PCR dan status anemia ditentukan melalui pemeriksaan darah. Informasi yang didapat lalu diuji dengan metode chi-square. Hasil penelitian menunjukkan bahwa prevalensi infeksi N.americanus adalah 40.8% dan prevalensi anemia 9.9%. Uji statistik chi-square menunjukkan bahwa infeksi N.americanus bukan merupakan faktor yang cukup signifikan sebagai penyebab anemia (p =0.155). Kesimpulan yang di dapat adalah tidak adannya korelasi antara infeksi N.americanus dan anemia pada anak sekolah di desa Nangapanda, kabupaten Ende, Nusa Tenggara Timur.

---

The prevalence of Necator americanus is still high, especially in developing country. The most common infection because of geohelminth infection is anemia, which in the long run can cause stunted growth on children. Children age group is the most prone age group towards this parasite infection due to its corelation between children habits with its mode of infection.

This research is done in Nangapanda, Kabupaten Ende, Nusa Tenggara Timur. 262 children with age range between 6-17 years old participate in this research. Children personal data was obtained through questionnaire form and 262 sample of blood and stool are obtained. RT-PCR is use to detect the presence of helminth infection and anemia status is checked with blood test. The result is then analyzed using chi-square method.

Result of this research shows that the prevalence of N.americanus infection is 40.8% and the prevalence of anemia is 9.9%. Data analysis using chi-square shows that N.americanus infection is not a significant factor to cause anemia (p=0.155). "

"Anemia adalah suatu kondisi dimana jumlah sel darah merah atau kemampuannya untuk mengangkut oksigen tidak cukup untuk memenuhi kebutuhan fisiologis tubuh. Anemia pada anak dapat mempengaruhi tumbuh kembang anak, serta menyebabkan anak menjadi lemas dan pucat. Salah satu faktor yang dapat menyebabkan anemia di negara-negara berkembang adalah infeksi soil-transmitted helminths. Penelitian ini bertujuan untuk meneliti hubungan antara infeksi soil-transmitted helminths dengan kejadian anemia pada balita di Kecamatan Nangapanda, Ende, Nusa Tenggara Timur. Penelitian ini menggunakan desain potong-lintang yang meneliti status infeksi soil-transmited helminths melalui pemeriksaan telur pada feses dan hubungannya dengan anemia yang diukur dari kadar hemoglobin darah kapiler. Selain itu juga diteliti hubungan antara anemia dengan faktor perancu berupa usia, jenis kelamin, dan nutrisi. Penelitian ini dilakukan pada Juli 2015 hinga Oktober 2015 di Departemen Parasitologi Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia. Data dianalisis dengan menggunakan program SPSS 20.0 for windows dengan Uji Chi Square dan Fisher untuk analisis univariat serta Regresi Logistik untuk analisis mutivariat. Hasil penelitian ini menunjukkan prevalensi infeksi soil-transmitted helminths pada 100 balita di Kecamatan Nangapanda, Ende, Nusa Tenggara Timur adalah 59%, dengan infeksi terbanyak disebabkan oleh infeksi majemuk antara Ascaris lumbricoides dan Trichuris trichiura sebanyak 23%. Prevalensi anemia pada balita di Kecamatan Nangapanda, Ende, Nusa Tenggara Timur adalah 63%. Tidak terdapat hubungan yang signifikan antara infeksi soil-transmitted helminths dengan kejadian anemia pada balita di Kecamatan Nangapanda, Ende, Nusa Tenggara Timur. Dari berbagai faktor yang diteliti, usia yang kurang dari 2 tahun merupakan faktor yang memiliki hubungan yang signifikan terhadap kejadian anemia pada populasi ini.

---

Anemia is a condition where the red blood cell count or its ability to carry oxygen is not adequate to fulfill physiological needs. Anemia in children can affected growth and development and cause fatigue, paleness. One of the factors that can cause anemia in developing countries is soil-transmitted helminths infection. This research aimed to analyze the correlation between soil-transmitted helminths infection and the prevalence of anemia in under-five children in Nangapanda Subdistrict, Ende district, East Nusa Tenggara. This research used cross-sectional design by investigating soil-transmitted helminths infection status through detection of helminth eggs in stool examination and its correlation with status of anemia based on hemoglobin measured from finger-prick blood. The link between anemia and confounding factors such as age, gender, and nutriotinal status was also analyzed. This research was conducted from July 2015 to October 2015 at Parasitology Departement of Faculty of Medicine of University of Indonesia. The data are analyzed using SPSS 20.0 software for Windows with Chi-Square and Fisher Test for univariate analysis and Logistic Regression for multivariate analysis. The results showed that the prevalence of soil-transmitted helminths infection in the 100 under-five children in Nangapanda Subdistrict, Ende district, East Nusa Tenggara was 59%, with majority of children (23%) co infected with Ascaris lumbricoides and Trichuris trichiura. The prevalence of anemia in the under-five children in Nangapanda Subdistrict, Ende district, East Nusa Tenggara 63%. There was no significant correlation between soil-transmitted helminths infection and anemia status in under-five children in Nangapanda Subdistrict, Ende District, East Nusa Tenggara. However, among other confounding factors analyzed, children under 2 years old were significantly associated with the prevalence of anemia in this population."

"Latar Belakang : COVID- 19 disebabkan SARS-COV-2. WHO menerbitkan protokol pemeriksaan laboratorium untuk deteksi virus menggunakan metode real time RT-PCR dari spesimen swab nasofaring dan orofaring. Metode ini cukup invasif. Diperlukan tehnik pemeriksaan yang relatif aman dan nyaman untuk pasien. Penelitian ini bertujuan untuk melihat efetivitas swab bukal sebagai alternatif pemeriksaan SARS-COV-2.Metode : Studi uji diagnostik ini dilaksanakan sejak tahun 2020 - 2021, mengambil spesimen swab nasofaring, swab orofaring dan swab bukal dari pasien positif COVID- 19. Dilakukan optimasi, ekstraksi RNA virus dan real time RT-PCR .Hasil Penelitian : Hasil studi mengumpulkan 68 spesimen dari pasien COVID-19. Hasil uji nasofaring, orofaring dan bukal positif adalah 24 spesimen. Hasil uji nasofaring dan orofaring positif dengan uji bukal negatif adalah 23 spesimen. Berdasarkan nilai Ct < 20 dan Ct <25, hasil kesesuaian positif dan negatif adalah 100%. Nilai Ct < 30 hasil kesesuaian positif 85,3 % dan negatif adalah 100%. Nilai Ct < 40 , hasil kesesuaian positif 51,1 % dan negatif adalah 100%. Kesimpulan : Swab bukal dapat digunakan sebagai pemeriksaan alternatif pada pemeriksaan SARS- CoV-2.

---

Background: COVID-19 caused by the SARS-COV-2 virus. WHO published protocol for the detection of the virus using the real time RT-PCR from nasopharyngeal and oropharynx swab specimens. This method is invasive. Required an examination technique that is relatively safe and comfortable. This study aims to see the effectiveness of the buccal swab as an alternative to the SARS-CoV-2 examination.

Methods: This diagnostic test study from 2020 to 2021, specimens of nasopharyngeal, oropharyngeal and buccal swabs from COVID-19. Specimens underwent an optimization, viral RNA extraction and real time RT-PCR.

Result : This study collected 68 specimens from COVID- 19 patients. The results of positive nasopharyngeal, oropharynx and buccal tests were 24 specimens. The results of a positive nasopharynx and oropharynx test with a negative buccal test were 23 specimens. Based on the values ​​of Ct < 20 and Ct < 25 , the results of positive agreement and negative are 100%. The value of Ct < 30 and Ct < 40  results in a positive agreement are 85.3% and 51,1 %. The negative  results are 100%.

Conclusion : Buccal swab can be used as an alternative test for SARS-CoV-2 examination."

"Infeksi cacing tanah, terutama A. duodenale tersebar luas ke seluruh dunia. Anak-anak adalah salah satu populasi yang dianggap memiliki resiko tinggi untuk terinfeksi dan mengalami komplikasi seperti kehilangan darah kronis dan malnutrisi yang pada akhirnya dapat mengganggu tumbuh kembang sang anak. Penelitian ini bertujuan untuk melihat hubungan dari infeksi A. duodenale dengan kekurusan pada anak usia sekolah. Peserta riset ini adalah anak-anak yang tinggal di Nangapanda, Nusa Tenggara Timur yang berusia dibawah 18 tahun. Data demografis dan antropometri diperoleh dan deteksi A. duodenale dari sampel tinja dilakukan dengan metode rtPCR. Analisis univariat dan multivariat dilakukan untuk melihat hubungan tiap variabel dan disesuaikan dengan jenis kelamin dan usia tiap anak. Dari 185 anak, 25 anak (13.5%) menderita infeksi A. duodenale dan 94 anak (51%) berada dalam kategori kurus dan sangat kurus berdasarkan hasil z-score BMI menurut umur. Pada akhirnya kami menemukan bahwa terdapat korelasi positif antara infeksi A. duodenale dengan kekurusan pada grup anak perempuan berusia ≥ 10 tahun namun tidak pada grup anak lainnya. Umur dan jenis kelamin tidak memiliki asosiasi dengan infeksi A. duodenale. Studi longitudinal dibutuhkan untuk bisa mengkonfirmasi hubungan antara infeksi A. duodenale dengan tingkat kekurusan pada anak-anak.

---

Soil-transmitted helminth (STH) infection, especially A. duodenale infection is distributed widely in the world. Children are one of the most susceptible populations at risk to develop complications from hookworm infection, such as chronic blood loss and malnutrition that may eventually lead to development retardation. This study aims to see the relationship between A. duodenale infection and thinness in school-aged children. Children below 18 years old living in Nangapanda Subdistrict, East Nusa Tenggara were examined for their demographic and anthropometric data, along with stool samples for further analysis using real time polymerase chain reaction (rtPCR). The data gathered was further analyzed using univariate and multivariate analysis between A. duodenale infection and body mass index (BMI) to age Z score with age and gender as the potential confounding factor. From 185 children, 25 (13.5%) had positive A. duodenale infection by rtPCR. 94(51%) were considered thin with BMI-to-age Z-scores (BAZ). A. duodenale was associated with thinness (p = 0.014) in female children aged above and equal 10 years old but not in the other groups. We found that A. duodenale infection was associated with thinness in older female population but not in the other population groups. Age and gender were found not to be significant with A. duodenale infection. Further longitudinal studies are needed to confirm the causal relationship between A. duodenale infection and low BMI status."

"Infeksi Necator amerikanus adalah salah satu infeksi yang paling prevalen di daerah tropis seperti Indonesia. Kota Ende di Provinsi Nusa Tenggara Timur memiliki prevalen 20 -49.9%. infeksi cacing tambang sering di asosiasikan dengan malnutrisi dan gangguan pertumbuhan pada anak serta anemia defisiensi besi dan hipoalbuminemia. Riset mengenai status nutrisi dan hubungannya dengan infeksi N. americanus masih minimal, terlebih di Indonesia. Sebuah studi oleh Sumanto et al. membahas tentang factor resiko dari infeksi N. americanus. Tujuan dari studi ini adalah untuk menggali lebih dalam tentang korelasi infeksi N. americanus dan status nutrisi. Infeksi ditentukan dengan real-time PCR dari sampel sebesar 185 anak-anak Ende, Nusa Tenggara Timur. Status nutrisi partisipan ditentukan oleh indeks massa tubuh (IMT). Data yang didapatakan dianalisa menggunakan SPSS 22 untuh mencari korelasi usia dan seks dengan infeksi serta infekse dengan IMT. Uji statistik yang digunakan adalah regresi logistic dan chi-square. Hasil yang didapatkan menunjukan bahwa korelasi sex dan infeksi tidak signifikan, serta infeksi dan IMT juga tidak signifikan. Namun, hasil signifikan didapatkan pada korelasi usia (dibagi menjadi 2 kategori: dibawah dan diatas 10 tahun) dengan infeksi N. americanus dengan infeksi yang lebih prevalen di subjek yang berusia diatas 10 tahun. Karena riset ini merupakan cross-sectional, hubungan sebab-akibat langsung dari infeksi N. americanus dan IMT tidak dapat ditentukan dan harus dilakukan riset lebih lanjut.

---

Necator americanus infection is one of the most prevalent hookworm infection affecting tropical regions such as Indonesia. East Nusa tenggara including Ende, has a prevalence of 20 to 49.9%. Hookworm infection is closely linked to malnutrition and impaired growth as well as iron deficiency anemia and hypoalbuminemia. The aim of this study is to explore the relationship between N. americanus infection and nutritional status. Infection was determined using real-time PCR from stool samples of 185 children in Ende, Nusa Tenggara Timur. Nutritional status was determined based on body mass index of participants.

The data were analyzed using SPSS 22 to find the relationship between age or sex and N.americanus infection and between infection and BMI. Logistic regressions and chi-square tests were used. The result showed there were no signnificant relationship between sex and infection, and between infection and BMI. However, children aged above 10 years old had significantly higher prevalence of N. americanus infection compared to younger children. Due to being a cross-sectional research, the direct cause and affect relationship of N.americanus infection and BMI cannot be determined and further research should be done."