Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Chlorophyll-a is a pigment that is contained in phytoplankton. Through the photosynthesis process, chlorophyll-a playsan important role in the global carbon cycle. The purpose of this research is to investigate the effect of global warmingon chlorophyll-a concentration in Indonesian waters. The data used includes the monthly data of sea surfacetemperatures from 1984-2013, CO2 concentrations from 1980-2014, and chlorophyll-a concentrations from 2003-2014.The method used is linear regression. The results show that sea surface temperatures in Indonesian waters increased byabout 0.51 °C from 1984-2013. The effects of global warming on chlorophyll-a concentrations varies between differentareas of Indonesian waters. From the 12 research sites, 9 showed a decrease in concentration and 3 showed an increase.Pengaruh Pemanasan Global terhadap Konsentrasi Klorofil-a di Perairan Indonesia. Klorofil-a adalah pigmenyang terkandung dalam fitoplankton. Klorofil-a mempunyai peranan penting dalam siklus karbon global melalui prosesfotosintesis. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh pemanasan global terhadap konsentrasi klorofil-a diperairan Indonesia. Data yang digunakan terdiri dari suhu permukaan laut bulanan dari tahun 1984-2013, konsentrasiCO2 bulanan dari tahun 1980-2014 dan konsentrasi klorofil-a bulanan dari tahun 2003-2014. Metode yang digunakandalam penelitian ini adalah regresi linier. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dari tahun 1984-2013 telah terjadipeningkatan suhu permukaan laut wilayah perairan Indonesia sebesar 0,51 °C. Pengaruh pemanasan global terhadapkonsentrasi klorofil-a bervariasi untuk setiap wilayah perairan Indonesia yang berbeda. Dari 12 lokasi penelitian, 9lokasi menunjukkan tren penurunan dan 3 lokasi penelitian menunjukkan tren kenaikan suhu."

"Pembentukan 8-Hidroksi-2′-Deoksiguanosin (8-OHdG) dalam Calf thymus DNA yang Disebabkan dari Reaksi 2′-Deoksiguanosin dengan Senyawa Propil Galat dan 2,6-Di-Tert-Butil-p-Benzoquinon secara In Vitro. Kerusakan oksidatif DNA yang disebabkan oleh propil galat (PG) dan 2,6-di-tert-butil-p-benzoquinon (BHT-quinon, metabolit BHT), dianalisis dari pembentukan DNA adduct, 8-hidroksi-2’-deoksiguanosin (8-OHdG), terhadap calf thymus DNA dan basa tunggal DNA, 2′-deoksiguanosin (dG) secara in vitro. PG dengan dimediasi oleh CuCl2 menyebabkan peningkatan 8-OHdG terhadap calf thymus DNA sebesar 9,17 kali lebih besar dibandingkan terhadap kontrol (DNA tanpa perlakuan). Dengan adanya CuCl2 pada konsentrasi 1,28 x10-5 M, rasio pembentukan 8-OHdG dari hasil interaksi antara dG dengan PG pada berbagai variasi konsentrasi (20-150 ppm) berkisar antara 75,50-312,06 8-OHdG terhadap 105 dG. Pembentukan 8-OHdG tersebut, meningkat dengan bertambahnya konsentrasi PG dari 20-80 ppm, kemudian mulai stabil dengan bertambahnya konsentrasi PG diatas 80 ppm. Sementara itu, BHT-quinon dengan adanya CuCl2 menyebabkan peningkatan 8-OHdG terhadap Calf thymus DNA sebesar 0,05 kali dibandingkan kontrol (DNA tanpa perlakuan). Analisis menggunakan LC-MS/MS dilakukan untuk mengidentifikasi 8-OHdG, dengan puncak induk (M+. + 1) 284 dan memiliki dua fragmen utama m/z 167,9 dan m/z 139,9.

---

Oxidative DNA damage caused by propyl gallate (PG) and 2,6-di-tert-butyl-p-benzoquinone (BHT-quinone, a metabolite of butylated hydroxytoluene (BHT)) was analyzed from the 8-hydroxy-2′-deoxyguanosine (8-OHdG) formation in calf thymus DNA and DNA base, 2′-deoxyguanosine (dG). PG in the presence of CuCl2 increased the 8-OHdG formation in calf thymus DNA by around 9.17 times as compared to the control (untreated DNA). In the presence of CuCl2 at 1.28×10-5 M, the 8-OHdG per dG ratio resulting from the reaction of dG with PG at various concentrations (20-150 ppm) ranged from 75.50 to 312.06 8-OHdG per 105 dG. The 8-OHdG formation increased when the PG concentration was increased from 20 ppm to 80 ppm, and then, it began to plateau around 80 ppm. On the other hand, BHT-quinone increased the formation of 8-OHdG in the presence of CuCl2 by 0.05 times as compared to the control (untreated DNA). LC-MS/MS analysis was used to identify the molecular structure of 8-OHdG, which had a base peak (M+. + 1) at m/z = 284 and two main fragments at m/z = 167.9 and m/z = 139.9."

"Bacterial leaf blight (BLB) is one of the major diseases in rice caused by Xanthomonas oryzae pv. oryzae. This studyaimed to identify and analyze the genetic diversity of 18 BLB isolates that consist of 7 races and 11 haplotypes fromvarious locations in Indonesia. The genetic diversity analysis was conducted on the basis of the VNTR (VariableNumber of Tandem Repeat) markers and the avrxa7 gene marker. The banding pattern of the amplification product wasmade into binary data as input for the construction of a dendogram. Based on the dendogram, three X. oryzae pv. oryzaegenotype groups with different virulence levels were formed. The VII (IXO80_021) race of X. oryzae pv. oryzaegenotype group I and the VIII-A (IXO 80_024) race of genotype group II were avirulent, whereas the races andhaplotypes of genotype group III were virulent.Keragaman Genetik Core Collection Isolat Bacterial Leaf Blight (Xanthomonas oryzae pv. oryzae) Indonesiaberdasarkan Marka Molekular VNTR dan avrXa7. Bacterial leaf blight (BLB) adalah salah satu penyakit utama padiyang disebabkan oleh bakteri pathogen Xanthomonas oryzae pv. oryzae. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasidan menganalisis keragaman genetik 18 isolat isolates yang terdiri dari 7 ras dan 11 haplotipe yang berasal daribeberapa lokasi koleksi di Indonesia. Analisis keragaman genetik dilakukan menggunakan marka VNTR (VariableNumber of Tandem Repeat) dan marka gen avrxa7. Pola pita DNA hasil amplifikasi digunakan sebagai data input bineruntuk membuat dendogram keragaman. Berdasarkan dendogram tersebut, terdapat tiga kelompok genotipe X. oryzaepv. oryzae dengan tingkat virulensi yang berbeda. Ras VII (IXO80_021) yang termasuk dalam kelompok I dan RasVIII-A (IXO 80_024) yang termasuk dalam kelompok II merupakan ras BLB yang tidak virulen. Sedangkan kelompokIII merupakan kelompok ras dan haplotipe yang bersifat virulen."

"The Lubuk Lampam floodplain?s ecosystem is naturally affected by the fluctuation of the water surface. This ecosystem also receives anthropogenic substances such as nutrients and other chemicals, especially from the oil palm plantation and its industrial processing activities. The main objective of this research was to determine the trophic status of the floodplain using the trophic level index (TLI) and Carlson?s trophic state index (TSI). The water quality and the fish samples were collected and analyzed from 7 stations representing various types of floodplain habitat. The results showed that the trophic status of Lubuk Lampam was hypereutrophic (very nutrient-rich). This was also supported by the high increase of the body weight (?b? value more than 3) and the high gonadosomatic index (GSI) of the studied fishes, i.e. Osteochilus vittatus 2.53-6.81% (male) and 3.00-15.86% (female); Helostoma temminckii 0.28-3.33% (male) and 1.30-10.43% (female); and Channa striata 0.33-0.59% (male) and 0.21-2.73% (female).

---

Status Trofik Rawa Banjiran Lubuk Lampam di Sumatera Selatan, Indonesia. Rawa banjiran Lubuk Lampam merupakan ekosistem yang secara alamiah dipengaruhi oleh fluktuasi tingkat muka air. Ekosistem ini juga menerima bahan masukan antropogenik berupa nutrien dan bahan kimia pertanian terutama dari perkebunan kelapa sawit dan industri pengolahannya. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan status trofik untuk rawa banjian menggunakan trophic state index (TSI) dari Carlson dan trophic level index (TLI). Pengambilan dan analisis kualitas air dan ikan pada 7 stasiun yang mewakili berbagai tipe habitat rawa banjiran. Hasil penelitian menunjukkan bahwa berdasarkan dua metode tersebut, Lubuk Lampam berada dalam status hypereutrofik (sangat subur). Hal ini juga didukung oleh pertambahan berat ikan yang tinggi (nilai ?b? lebih besar dari 3) dan indeks kematangan gonad ikan (Gonado Somatic Index, GSI) yang cukup besar dari 3 jenis ikan sampel yaitu ikan Osteochillus vittatus 2,53-6,81% (jantan) dan 3,00-15,86% (betina); Helostoma temminckii 0,28-3,33% (jantan) dan 1,30-10,43% (betina); Channa striata 0,33-0,59% (jantan) dan 0,21-2,73% (betina)"

"The conservation of the endemic tree species Dipterocarpus littoralis (Bl.) Kurz. is hampered by the paucity ofinformation on its population biology and ecology. Consequently, a targeted survey was carried out in the WestNusakambangan Nature Reserve to assess its population size and structure as well as habitat preferences. In total, 676individuals of D. littoralis were located at 52 locations, with an extent of occurrence of 3.66 km2 and an area ofoccupancy of 1.71 km2. The population had an inverse-J-shaped distribution of diameter at breast height (DBH), with63% of individuals in the 0-5 cm class and another 21% in the 5-10 cm class; only 11 (1.6%) mature individuals(DBH≥30) were found. D. littoralis was associated with steep, low, southwest-facing sites and sites that had high littercover and thickness. Illegal logging and fuel-wood chopping were the main threats to D. littoralis and its habitat. Inaddition, an invasive shrub, Langkap (Arenga obtusifolia, Arecaceae), was a potential competitor with the seedlingsthroughout the reserve. In view of its endemism, narrow range and localized distribution, small population,environmental preferences, and the severe threats from anthropogenic activities and invasive species, D. littoralisappears to more than justify its conservation status of Critically Endangered.Status Populasi dan Preferensi Habitat Jenis Kritis Dipterocarpus Littoralis di Nusakambangan Barat,Indonesia. Usaha konservasi jenis endemik Dipterocarpus littoralis (Bl.) Kurz. terhambat karena kurangnya informasimengenai biologi dan ekologi populasi tumbuhan ini. Oleh karena itu pada penelitian ini dilakukan survey terarah diCagar Alam Nusakambangan Barat untuk mengetahui struktur dan ukuran populasi serta preferensi habitat dari D.littoralis. Total sebanyak 676 individu D. littoralis di temukan di 52 lokasi dengan tingkat keberadaan (extent ofoccurrence) 3,66 km2 dan luas area yang ditempati (area of occupancy) 1,71 km2. Populasi D. littoralis memilikisebaran diameter batang setinggi dada (DBH) berbentuk huruf J terbalik dengan persentase individu dalam kelas DBH0-5 cm sebesar 63%, kelas 5-10 cm sebesar 21% dan individu dewasa (DBH ≥30) hanya sebesar 1,6%. Keberadaan D.littoralis berasosiasi dengan lokasi yang terjal, rendah, menghadap ke tenggara dan memiliki tutupan serta ketebalanserasah yang tinggi. Penebangan dan pengambilan kayu bakar secara liar merupakan ancaman utama terhadapkeberadaan D. littoralis dan habitatnya. Selain itu, tumbuhan invasif Langkap (Arenga obtusifolia, Arecaceae) yangtersebar di seluruh cagar alam merupakan saingan utama anakan D. littoralis. Karena bersifat endemik, area sebaranyang sempit dan terlokalisasi, ukuran populasi yang kecil, preferensi terhadap habitat tertentu, dan ancaman yang seriusdari aktifitas manusia dan jenis invasif, maka D. littoralis memiliki dasar yang kuat untuk tetap dalam status konservasiKritis (Critically Endangered)."