Human Immunodeficiency Virus (HIV) merupakan virus yang menyerang sistem kekebalan tubuh manusia. Virus ini terdiri dari 23 protein dalam RNA untai tunggal. Interaksi protein HIV dan protein manusia dapat mengakibatkan penyakit AIDS. Dengan mempelajari interaksi protein dapat digunakan untuk mengembangkan obat antiviral. Untuk menganalisis interaksi protein dilakukan dengan proses
biclustering. Algoritma LCM-MBC merupakan suatu algoritma
biclustering yang digunakan untuk menganalisis interaksi protein.
Hasil dari
biclustering digunakan untuk memprediksi dengan
association rule mining. Untuk mengetahui fungsi-fungsi biologis dari protein yang terdapat pada satu
bicluster digunakan DAVID
Gene Ontology. Terdapat 45
bicluster yang memiliki protein HIV dalam satu
bicluster sebanyak lima. Dari
bicluster yang diperoleh ini, Terdapat 11 protein HIV-1 yang diprediksi akan berinteraksi dengan 36 protein manusia. Jika protein manusia terhubung dengan protein HIV sesuai dengan tipe jenis interaksinya, artinya protein manusia tersebut berinteraksi dengan proten HIV-1.
Human Immunodeficiency Virus (HIV) is a virus w attacks the human immune system. This virus consists of 23 proteins in a single-stranded RNA. The protein interaction between HIV proteins and human proteins can impact to AIDS The research about HIV-1 proteins and human proteins interactions leads to the insight of drug target prediction. To analyze protein interactions carried out by biclustering process. The LCM-MBC algorithm is a biclustering algorithm that is used to analyze protein interactions. The results of biclustering are used to predict with association rule mining. To find out the biological functions of proteins found in one cluster used DAVID Gene Ontology. There are 45 bicluster that have five HIV proteins in one bicluster. From the bicluster obtained, there are 11 HIV-1 proteins that are predicted to interact with 36 human proteins. If human protein interacts with HIV-1 protens, it means that human proteins will relate according to the interaction type by HIV proteins.