Gen Oryza sativa NAC6 (OsNAC6) merupakan gen pengkode faktortranskripsi OsNAC6 yang terinduksi cekaman kekeringan pada tanaman padi(Oryza sativa L.). Tujuan penelitian adalah mengisolasi dan mengklona genOsNAC6 dari tanaman padi kultivar Rojolele dan Batutegi. Penelitiandilakukan di Laboratorium Biologi Molekular Padi Puslit Bioteknologi LIPIselama 10 bulan (Februari--November 2008). Fragmen gen tersebutdiperoleh dari proses sintesis dan amplifikasi cDNA OsNAC6 sampel kultivarRojolele dan Batutegi dengan teknik RT-PCR. Fragmen tersebut kemudiandiligasi ke dalam plasmid pGEM-T Easy (3.015 pb) untuk mendapatkanplasmid rekombinan yang diklona ke dalam Escherichia coli DH5α. Plasmidrekombinan yang telah berhasil diklona selanjutnya diisolasi dan disekuen.Hasil analisis BLAST menunjukkan sekuen gen OsNAC6 dari kedua sampeltersebut memiliki similaritas nukleotida sebesar 99% dan similaritas asamamino sebesar 100% dengan sekuen acuan [GenBank Accession NumberAB028185], yaitu coding sequence lengkap dari mRNA Oryza sativa L.pengkode protein OsNAC6. Analisis restriksi dan Southern blot menunjukkanadanya pola sesuai prediksi, yaitu pola pita berukuran 11.702 pb(pemotongan dengan enzim BglII), 3.142 pb dan 2.580 pb (pemotongandengan enzim EcoRI). Akan tetapi, terdapat tambahan pola pada hasilSouthern blot, yaitu pola pita berukuran sekitar 9,5 kpb (pemotongan denganenzim EcoRI) dan 1 kpb (pemotongan dengan enzim BglII), yang diduga sebagai kerabat dekat gen OsNAC6. Gen OsNAC6 berukuran 912 pbberhasil diisolasi dari tanaman padi kultivar Rojolele dan Batutegi sertadiklona ke dalam Escherichia coli DH5α.